<?xml version="1.0"?>
<!DOCTYPE rnaml SYSTEM "rnaml.dtd">

<rnaml version="1.0">

   <molecule id="1">
      <sequence>
         <numbering-system id="1" used-in-file="false">
            <numbering-range>
               <start>1</start>
               <end>14</end>
            </numbering-range>
         </numbering-system>
         <numbering-table length="14" comment="sequence number in pdb file">
            1    2    3    4    5    6    7    8    9   10 
           11   12   13   14 
         </numbering-table>
         <seq-data>
            GGGUCUUCGG GUCC
         </seq-data>
         <seq-annotation comment="?">
            <segment>
               <seg-name>LOOP1</seg-name>
               <base-id-5p><base-id><position>7</position></base-id></base-id-5p>
               <base-id-3p><base-id><position>8</position></base-id></base-id-3p>
            </segment>
         </seq-annotation>
      </sequence>
      <structure>
         <model id="?">
            <model-info>
               <method>Crystallography ?</method>
               <resolution>? Angstroms</resolution>
            </model-info>
            <base>
               <position>1</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="6">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>1.075 -3.409 10.218</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>2</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="24">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>1.700 -2.010 9.719</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="32">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>6.322 -2.431 6.694</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>3</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="49">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>6.707 -1.237 5.679</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="57">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>8.277 -1.928 0.713</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>4</position>
               <base-type>U</base-type>
               <atom serial="74">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>8.444 -0.452 0.087</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="82">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>6.243 1.179 -4.408</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>5</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="96">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>6.590 2.752 -4.392</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="104">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>3.337 6.390 -6.526</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>6</position>
               <base-type>U</base-type>
               <atom serial="118">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>3.902 7.799 -5.984</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="126">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>0.271 11.537 -4.481</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>7</position>
               <base-type>U</base-type>
               <atom serial="140">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>0.806 12.830 -3.682</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="148">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-3.725 14.372 -0.144</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>8</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="162">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-3.677 14.434 1.465</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="170">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-3.596 9.225 4.187</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>9</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="184">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-4.433 9.098 5.564</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="192">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-7.972 7.036 3.845</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>10</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="209">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-6.903 5.990 4.454</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="217">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-9.628 2.047 1.316</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>11</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="234">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-9.456 0.447 1.202</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="242">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-8.643 -1.514 -3.735</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>12</position>
               <base-type>U</base-type>
               <atom serial="259">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-8.569 -3.120 -3.646</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="267">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-4.455 -5.820 -5.717</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>13</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="281">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-5.005 -7.286 -5.331</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="289">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-1.496 -11.136 -4.021</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>14</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="303">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-2.757 -12.140 -3.954</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="311">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-1.232 -15.443 0.243</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <str-annotation>
               <base-conformation>
                  <base-id><position>9</position></base-id>
                  <glycosyl>syn</glycosyl>
               </base-conformation>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>1</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>14</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>+</edge-5p>
                  <edge-3p>+</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>2</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>13</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>+</edge-5p>
                  <edge-3p>+</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>3</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>12</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>W</edge-5p>
                  <edge-3p>W</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>4</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>11</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>W</edge-5p>
                  <edge-3p>W</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>5</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>10</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>+</edge-5p>
                  <edge-3p>+</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>6</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>9</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>S</edge-5p>
                  <edge-3p>W</edge-3p>
                  <bond-orientation>t</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>6</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>10</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>W</edge-5p>
                  <edge-3p>W</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <helix id="H1">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>1</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>14</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <length>6</length>
               </helix>
               <single-strand>
                  <segment>
                     <seg-name>SG1</seg-name>
                     <base-id-5p><base-id><position>7</position></base-id></base-id-5p>
                     <base-id-3p><base-id><position>8</position></base-id></base-id-3p>
                  </segment>
               </single-strand>
            </str-annotation>
            <secondary-structure-display comment="x,y coodinates">
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>1</position></base-id>
                  <coordinates>206.925 0.000</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>2</position></base-id>
                  <coordinates>206.925 86.219</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>3</position></base-id>
                  <coordinates>206.925 172.438</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>4</position></base-id>
                  <coordinates>206.925 258.657</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>5</position></base-id>
                  <coordinates>206.925 344.876</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>6</position></base-id>
                  <coordinates>206.925 431.095</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>7</position></base-id>
                  <coordinates>166.291 550.000</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>8</position></base-id>
                  <coordinates>40.634 550.000</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>9</position></base-id>
                  <coordinates>0.000 431.095</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>10</position></base-id>
                  <coordinates>0.000 344.876</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>11</position></base-id>
                  <coordinates>0.000 258.657</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>12</position></base-id>
                  <coordinates>0.000 172.438</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>13</position></base-id>
                  <coordinates>0.000 86.219</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>14</position></base-id>
                  <coordinates>0.000 0.000</coordinates>
               </ss-base-coord>
            </secondary-structure-display>
         </model>
      </structure>
   </molecule>


   <interactions>
            <str-annotation>
            </str-annotation>
   </interactions>
</rnaml>
