<?xml version="1.0"?>
<!DOCTYPE rnaml SYSTEM "rnaml.dtd">

<rnaml version="1.0">

   <molecule id="1">
      <sequence>
         <numbering-system id="1" used-in-file="false">
            <numbering-range>
               <start>1</start>
               <end>19</end>
            </numbering-range>
         </numbering-system>
         <numbering-table length="19" comment="sequence number in pdb file">
          201  202  203  204  205  206  207  208  209  210 
          211  212  213  214  215  216  217  218  219 
         </numbering-table>
         <seq-data>
            gGCGACUGGU GAGUACGCC
         </seq-data>
         <seq-annotation comment="?">
            <modification>
               <base-id><position>1</position></base-id>
               <modified-type>CG1</modified-type>
            </modification>
            <segment>
               <seg-name>LOOP1</seg-name>
               <base-id-5p><base-id><position>8</position></base-id></base-id-5p>
               <base-id-3p><base-id><position>11</position></base-id></base-id-3p>
            </segment>
         </seq-annotation>
      </sequence>
      <structure>
         <model id="?">
            <model-info>
               <method>Crystallography ?</method>
               <resolution>? Angstroms</resolution>
            </model-info>
            <base>
               <position>1</position>
               <base-type>g</base-type>
               <atom serial="2">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-40.235 -7.659 9.611</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="10">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-42.345 -9.116 4.998</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>2</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="29">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-42.179 -7.804 4.098</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="37">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-46.905 -6.052 1.717</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>3</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="54">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-46.599 -4.601 1.117</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="62">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-51.733 -2.191 1.470</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>4</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="76">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-51.602 -0.729 0.836</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="84">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-54.657 2.269 2.815</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>5</position>
               <base-type>A</base-type>
               <atom serial="101">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-54.743 3.827 3.166</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="109">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-55.330 7.451 5.730</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>6</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="125">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-54.651 8.573 4.813</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="133">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-52.930 11.720 8.893</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>7</position>
               <base-type>U</base-type>
               <atom serial="147">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-53.021 13.104 8.097</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="155">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-48.986 15.709 10.300</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>8</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="169">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-48.370 16.833 9.342</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="177">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-42.788 16.945 10.390</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>9</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="194">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-42.597 18.534 10.411</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="202">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-43.606 15.636 13.339</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>10</position>
               <base-type>U</base-type>
               <atom serial="219">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-42.083 15.442 12.894</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="227">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-40.647 10.830 11.424</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>11</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="241">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-39.313 10.928 10.545</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="249">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-36.047 6.629 12.017</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>12</position>
               <base-type>A</base-type>
               <atom serial="266">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-35.689 5.126 11.604</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="274">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-36.979 3.835 8.836</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>13</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="290">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-36.962 2.538 7.898</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="298">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-41.166 -0.042 10.669</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>14</position>
               <base-type>U</base-type>
               <atom serial="315">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-40.869 -1.602 10.473</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="323">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-44.651 -2.706 14.469</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>15</position>
               <base-type>A</base-type>
               <atom serial="337">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-43.795 -3.564 15.515</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="345">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-48.164 -3.015 19.633</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>16</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="361">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-49.342 -4.051 19.318</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="369">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-54.163 -1.995 18.553</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>17</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="383">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-55.027 -3.271 18.978</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="391">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-58.083 -5.811 15.623</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>18</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="408">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-58.249 -7.316 16.136</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="416">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-58.247 -11.108 12.410</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>19</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="430">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-58.094 -12.424 13.307</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="438">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-55.873 -16.428 10.505</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <str-annotation>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>1</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>19</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>+</edge-5p>
                  <edge-3p>+</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>2</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>18</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>+</edge-5p>
                  <edge-3p>+</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>3</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>17</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>+</edge-5p>
                  <edge-3p>+</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>4</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>16</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>+</edge-5p>
                  <edge-3p>+</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>5</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>14</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>W</edge-5p>
                  <edge-3p>W</edge-3p>
                  <bond-orientation>t</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>5</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>15</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>W</edge-5p>
                  <edge-3p>W</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>6</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>13</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>+</edge-5p>
                  <edge-3p>+</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>7</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>12</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>-</edge-5p>
                  <edge-3p>-</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>14</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>15</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>S</edge-5p>
                  <edge-3p>H</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>14</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>16</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>S</edge-5p>
                  <edge-3p>H</edge-3p>
                  <bond-orientation>t</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>4</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>14</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>!</edge-5p>
                  <edge-3p>!</edge-3p>
                  <bond-orientation>!</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>7</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>10</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>!</edge-5p>
                  <edge-3p>!</edge-3p>
                  <bond-orientation>!</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>9</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>10</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>!</edge-5p>
                  <edge-3p>!</edge-3p>
                  <bond-orientation>!</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>11</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>12</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>!</edge-5p>
                  <edge-3p>!</edge-3p>
                  <bond-orientation>!</bond-orientation>
               </base-pair>
               <helix id="H1">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>1</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>19</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <length>5</length>
               </helix>
               <helix id="H2">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>6</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>13</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <length>2</length>
               </helix>
               <single-strand>
                  <segment>
                     <seg-name>SG1</seg-name>
                     <base-id-5p><base-id><position>8</position></base-id></base-id-5p>
                     <base-id-3p><base-id><position>11</position></base-id></base-id-3p>
                  </segment>
               </single-strand>
               <single-strand>
                  <segment>
                     <seg-name>SG2</seg-name>
                     <base-id-5p><base-id><position>14</position></base-id></base-id-5p>
                     <base-id-3p><base-id><position>14</position></base-id></base-id-3p>
                  </segment>
               </single-strand>
            </str-annotation>
            <secondary-structure-display comment="x,y coodinates">
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>1</position></base-id>
                  <coordinates>154.991 0.000</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>2</position></base-id>
                  <coordinates>154.991 61.135</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>3</position></base-id>
                  <coordinates>154.991 122.270</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>4</position></base-id>
                  <coordinates>154.991 183.404</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>5</position></base-id>
                  <coordinates>154.991 244.539</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>6</position></base-id>
                  <coordinates>154.991 366.809</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>7</position></base-id>
                  <coordinates>154.991 427.943</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>8</position></base-id>
                  <coordinates>163.258 497.575</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>9</position></base-id>
                  <coordinates>116.690 550.000</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>10</position></base-id>
                  <coordinates>46.569 550.000</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>11</position></base-id>
                  <coordinates>0.000 497.575</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>12</position></base-id>
                  <coordinates>8.267 427.943</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>13</position></base-id>
                  <coordinates>8.267 366.809</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>14</position></base-id>
                  <coordinates>8.267 305.674</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>15</position></base-id>
                  <coordinates>8.267 244.539</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>16</position></base-id>
                  <coordinates>8.267 183.404</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>17</position></base-id>
                  <coordinates>8.267 122.270</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>18</position></base-id>
                  <coordinates>8.267 61.135</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>19</position></base-id>
                  <coordinates>8.267 0.000</coordinates>
               </ss-base-coord>
            </secondary-structure-display>
         </model>
      </structure>
   </molecule>


   <interactions>
            <str-annotation>
            </str-annotation>
   </interactions>
</rnaml>
