<?xml version="1.0"?>
<!DOCTYPE rnaml SYSTEM "rnaml.dtd">

<rnaml version="1.0">

   <molecule id="1">
      <sequence>
         <numbering-system id="1" used-in-file="false">
            <numbering-range>
               <start>1</start>
               <end>27</end>
            </numbering-range>
         </numbering-system>
         <numbering-table length="27" comment="sequence number in pdb file">
            1    2    3    4    5    6    7    8    9   10 
           11   12   13   14   15   16   17   18   19   20 
           21   22   23   24   25   26   27 
         </numbering-table>
         <seq-data>
            GGAAGUCCGG UCUUCGGACC GGCUUCC
         </seq-data>
         <seq-annotation comment="?">
            <segment>
               <seg-name>LOOP1</seg-name>
               <base-id-5p><base-id><position>12</position></base-id></base-id-5p>
               <base-id-3p><base-id><position>17</position></base-id></base-id-3p>
            </segment>
         </seq-annotation>
      </sequence>
      <structure>
         <model id="?">
            <model-info>
               <method>Crystallography ?</method>
               <resolution>? Angstroms</resolution>
            </model-info>
            <base>
               <position>1</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="6">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-12.125 -2.876 -17.834</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>2</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="24">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-10.634 -3.486 -17.846</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="32">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-6.494 0.411 -16.888</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>3</position>
               <base-type>A</base-type>
               <atom serial="49">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-5.018 -0.229 -16.953</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="57">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-1.730 2.135 -13.549</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>4</position>
               <base-type>A</base-type>
               <atom serial="73">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-0.246 1.509 -13.557</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="81">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>2.266 1.079 -8.650</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>5</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="97">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>3.576 0.321 -8.099</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="105">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>3.140 -2.249 -2.418</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>6</position>
               <base-type>U</base-type>
               <atom serial="122">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>3.200 -0.965 -1.447</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="130">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>5.644 -4.824 0.113</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>7</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="144">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>7.169 -4.566 -0.337</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="152">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>9.862 -8.245 0.782</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>8</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="166">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>11.271 -8.311 0.006</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="174">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>14.539 -11.935 -1.535</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>9</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="188">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>15.921 -11.142 -1.759</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="196">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>18.845 -11.041 -5.647</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>10</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="213">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>19.818 -9.761 -5.748</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="221">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>21.319 -8.448 -11.107</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>11</position>
               <base-type>U</base-type>
               <atom serial="238">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>22.406 -7.260 -11.131</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="246">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>22.798 -3.564 -14.551</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>12</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="260">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>23.466 -2.145 -14.175</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="268">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>23.088 2.413 -14.639</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>13</position>
               <base-type>U</base-type>
               <atom serial="282">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>24.322 2.835 -13.696</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="290">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>23.853 5.873 -9.254</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>14</position>
               <base-type>U</base-type>
               <atom serial="304">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>25.173 5.858 -8.329</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="312">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>23.724 10.491 -5.163</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>15</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="326">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>22.713 11.373 -4.268</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="334">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>18.091 7.821 -2.732</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>16</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="348">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>17.886 6.511 -1.815</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="356">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>12.481 6.899 -3.707</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>17</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="373">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>11.544 5.588 -3.637</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="381">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>8.622 6.267 -7.988</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>18</position>
               <base-type>A</base-type>
               <atom serial="398">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>7.759 5.138 -8.747</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="406">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>8.388 3.415 -13.697</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>19</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="422">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>7.659 2.134 -14.347</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="430">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>8.457 -1.862 -16.633</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>20</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="444">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>7.080 -2.663 -16.409</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="452">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>6.743 -8.006 -17.131</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>21</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="466">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>5.255 -8.447 -16.703</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="474">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>4.395 -13.491 -14.377</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>22</position>
               <base-type>G</base-type>
               <atom serial="491">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>2.802 -13.389 -14.166</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="499">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>1.415 -16.896 -10.092</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>23</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="516">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-0.188 -16.803 -10.222</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="524">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-2.960 -15.452 -5.589</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>24</position>
               <base-type>U</base-type>
               <atom serial="538">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-4.478 -15.098 -5.990</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="546">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-6.010 -10.834 -2.524</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>25</position>
               <base-type>U</base-type>
               <atom serial="560">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-7.460 -10.133 -2.547</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="568">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-7.055 -4.904 -0.304</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>26</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="582">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-8.414 -4.073 -0.070</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="590">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-9.057 0.900 -1.036</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>27</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="604">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-10.491 1.593 -0.793</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="612">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-14.981 3.153 -3.659</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <str-annotation>
               <base-conformation>
                  <base-id><position>15</position></base-id>
                  <glycosyl>syn</glycosyl>
               </base-conformation>
               <base-conformation>
                  <base-id><position>16</position></base-id>
                  <glycosyl>syn</glycosyl>
               </base-conformation>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>1</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>27</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>W</edge-5p>
                  <edge-3p>W</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>2</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>26</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>+</edge-5p>
                  <edge-3p>+</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>3</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>25</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>-</edge-5p>
                  <edge-3p>-</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>4</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>24</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>-</edge-5p>
                  <edge-3p>-</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>5</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>23</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>+</edge-5p>
                  <edge-3p>+</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>7</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>22</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>+</edge-5p>
                  <edge-3p>+</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>8</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>21</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>+</edge-5p>
                  <edge-3p>+</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>9</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>20</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>+</edge-5p>
                  <edge-3p>+</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>10</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>19</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>+</edge-5p>
                  <edge-3p>+</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>11</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>18</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>-</edge-5p>
                  <edge-3p>-</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>12</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>17</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>W</edge-5p>
                  <edge-3p>W</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>13</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>16</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>S</edge-5p>
                  <edge-3p>W</edge-3p>
                  <bond-orientation>t</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>12</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>16</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>!</edge-5p>
                  <edge-3p>!</edge-3p>
                  <bond-orientation>!</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>6</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>25</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>!</edge-5p>
                  <edge-3p>!</edge-3p>
                  <bond-orientation>!</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>13</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>14</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>!</edge-5p>
                  <edge-3p>!</edge-3p>
                  <bond-orientation>!</bond-orientation>
               </base-pair>
               <helix id="H1">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>1</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>27</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <length>5</length>
               </helix>
               <helix id="H2">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>7</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>22</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <length>5</length>
               </helix>
               <single-strand>
                  <segment>
                     <seg-name>SG1</seg-name>
                     <base-id-5p><base-id><position>6</position></base-id></base-id-5p>
                     <base-id-3p><base-id><position>6</position></base-id></base-id-3p>
                  </segment>
               </single-strand>
               <single-strand>
                  <segment>
                     <seg-name>SG2</seg-name>
                     <base-id-5p><base-id><position>12</position></base-id></base-id-5p>
                     <base-id-3p><base-id><position>17</position></base-id></base-id-3p>
                  </segment>
               </single-strand>
            </str-annotation>
            <secondary-structure-display comment="x,y coodinates">
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>1</position></base-id>
                  <coordinates>122.580 0.000</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>2</position></base-id>
                  <coordinates>122.580 43.624</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>3</position></base-id>
                  <coordinates>122.580 87.248</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>4</position></base-id>
                  <coordinates>122.580 130.871</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>5</position></base-id>
                  <coordinates>122.580 174.495</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>6</position></base-id>
                  <coordinates>122.580 218.119</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>7</position></base-id>
                  <coordinates>122.580 261.743</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>8</position></base-id>
                  <coordinates>122.580 305.367</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>9</position></base-id>
                  <coordinates>122.580 348.990</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>10</position></base-id>
                  <coordinates>122.580 392.614</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>11</position></base-id>
                  <coordinates>122.580 436.238</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>12</position></base-id>
                  <coordinates>140.463 478.100</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>13</position></base-id>
                  <coordinates>129.005 522.156</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>14</position></base-id>
                  <coordinates>92.992 550.000</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>15</position></base-id>
                  <coordinates>47.471 550.000</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>16</position></base-id>
                  <coordinates>11.458 522.156</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>17</position></base-id>
                  <coordinates>0.000 478.100</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>18</position></base-id>
                  <coordinates>17.883 436.238</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>19</position></base-id>
                  <coordinates>17.883 392.614</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>20</position></base-id>
                  <coordinates>17.883 348.990</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>21</position></base-id>
                  <coordinates>17.883 305.367</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>22</position></base-id>
                  <coordinates>17.883 261.743</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>23</position></base-id>
                  <coordinates>17.883 174.495</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>24</position></base-id>
                  <coordinates>17.883 130.871</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>25</position></base-id>
                  <coordinates>17.883 87.248</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>26</position></base-id>
                  <coordinates>17.883 43.624</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>27</position></base-id>
                  <coordinates>17.883 0.000</coordinates>
               </ss-base-coord>
            </secondary-structure-display>
         </model>
      </structure>
   </molecule>


   <interactions>
            <str-annotation>
            </str-annotation>
   </interactions>
</rnaml>
