<?xml version="1.0"?>
<!DOCTYPE rnaml SYSTEM "rnaml.dtd">

<rnaml version="1.0">

   <molecule id="1">
      <sequence>
         <numbering-system id="1" used-in-file="false">
            <numbering-range>
               <start>1</start>
               <end>16</end>
            </numbering-range>
         </numbering-system>
         <numbering-table length="16" comment="sequence number in pdb file">
            1    2    3    4    5    6    7    8    1    2 
            3    4    5    6    7    8 
         </numbering-table>
         <seq-data>
            aCaCacacaC aCacac
         </seq-data>
         <seq-annotation comment="?">
            <modification>
               <base-id><position>1</position></base-id>
               <modified-type> DI</modified-type>
            </modification>
            <modification>
               <base-id><position>3</position></base-id>
               <modified-type> DI</modified-type>
            </modification>
            <modification>
               <base-id><position>5</position></base-id>
               <modified-type> DI</modified-type>
            </modification>
            <modification>
               <base-id><position>6</position></base-id>
               <modified-type> DC</modified-type>
            </modification>
            <modification>
               <base-id><position>7</position></base-id>
               <modified-type> DI</modified-type>
            </modification>
            <modification>
               <base-id><position>8</position></base-id>
               <modified-type> DC</modified-type>
            </modification>
            <modification>
               <base-id><position>9</position></base-id>
               <modified-type> DI</modified-type>
            </modification>
            <modification>
               <base-id><position>11</position></base-id>
               <modified-type> DI</modified-type>
            </modification>
            <modification>
               <base-id><position>13</position></base-id>
               <modified-type> DI</modified-type>
            </modification>
            <modification>
               <base-id><position>14</position></base-id>
               <modified-type> DC</modified-type>
            </modification>
            <modification>
               <base-id><position>15</position></base-id>
               <modified-type> DI</modified-type>
            </modification>
            <modification>
               <base-id><position>16</position></base-id>
               <modified-type> DC</modified-type>
            </modification>
            <segment>
               <seg-name>LOOP1</seg-name>
               <base-id-5p><base-id><position>9</position></base-id></base-id-5p>
               <base-id-3p><base-id><position>8</position></base-id></base-id-3p>
            </segment>
         </seq-annotation>
      </sequence>
      <structure>
         <model id="?">
            <model-info>
               <method>Crystallography ?</method>
               <resolution>? Angstroms</resolution>
            </model-info>
            <base>
               <position>1</position>
               <base-type>a</base-type>
               <atom serial="6">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-1.151 7.131 17.194</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>2</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="19">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-1.546 6.114 16.016</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="27">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>2.013 3.155 12.776</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>3</position>
               <base-type>a</base-type>
               <atom serial="39">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>1.299 3.345 11.364</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="47">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>5.052 2.360 7.239</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>4</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="60">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>5.190 1.196 6.147</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="68">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>8.946 -2.993 6.693</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>5</position>
               <base-type>a</base-type>
               <atom serial="80">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>9.482 -3.344 5.209</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="88">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>14.840 -5.083 6.781</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>6</position>
               <base-type>c</base-type>
               <atom serial="101">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>15.747 -6.308 6.300</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="109">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>16.941 -9.336 10.697</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>7</position>
               <base-type>a</base-type>
               <atom serial="120">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>17.620 -10.778 10.821</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="128">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>15.242 -14.090 14.812</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>8</position>
               <base-type>c</base-type>
               <atom serial="141">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>15.416 -15.633 15.184</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="149">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>10.878 -18.553 16.668</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>9</position>
               <base-type>a</base-type>
               <atom serial="165">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>-1.151 -15.719 10.348</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>10</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="178">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>-1.546 -14.701 11.526</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="186">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>2.013 -11.743 14.766</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>11</position>
               <base-type>a</base-type>
               <atom serial="198">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>1.299 -11.933 16.178</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="206">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>5.052 -10.948 20.304</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>12</position>
               <base-type>C</base-type>
               <atom serial="219">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>5.190 -9.783 21.396</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="227">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>8.946 -5.595 20.849</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>13</position>
               <base-type>a</base-type>
               <atom serial="239">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>9.482 -5.244 22.334</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="247">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>14.840 -3.505 20.761</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>14</position>
               <base-type>c</base-type>
               <atom serial="260">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>15.747 -2.279 21.242</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="268">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>16.941 0.749 16.845</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>15</position>
               <base-type>a</base-type>
               <atom serial="279">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>17.620 2.190 16.721</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="287">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>15.242 5.502 12.730</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <base>
               <position>16</position>
               <base-type>c</base-type>
               <atom serial="300">
                  <atom-type> P  </atom-type>
                     <coordinates>15.416 7.046 12.358</coordinates>
               </atom>
               <atom serial="308">
                  <atom-type> O3'</atom-type>
                     <coordinates>10.878 9.965 10.874</coordinates>
               </atom>
            </base>
            <str-annotation>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>1</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>16</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>W</edge-5p>
                  <edge-3p>W</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>2</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>15</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>W</edge-5p>
                  <edge-3p>W</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>3</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>14</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>W</edge-5p>
                  <edge-3p>W</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>4</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>13</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>W</edge-5p>
                  <edge-3p>W</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>5</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>12</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>W</edge-5p>
                  <edge-3p>W</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>6</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>11</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>W</edge-5p>
                  <edge-3p>W</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>7</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>10</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>W</edge-5p>
                  <edge-3p>W</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <base-pair comment="?">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>8</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>9</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <edge-5p>W</edge-5p>
                  <edge-3p>W</edge-3p>
                  <bond-orientation>c</bond-orientation>
               </base-pair>
               <helix id="H1">
                  <base-id-5p>
                     <base-id><position>1</position></base-id>
                  </base-id-5p>
                  <base-id-3p>
                     <base-id><position>16</position></base-id>
                  </base-id-3p>
                  <length>8</length>
               </helix>
            </str-annotation>
            <secondary-structure-display comment="x,y coodinates">
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>1</position></base-id>
                  <coordinates>550.000 0.000</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>2</position></base-id>
                  <coordinates>471.429 0.000</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>3</position></base-id>
                  <coordinates>392.857 0.000</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>4</position></base-id>
                  <coordinates>314.286 0.000</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>5</position></base-id>
                  <coordinates>235.714 0.000</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>6</position></base-id>
                  <coordinates>157.143 0.000</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>7</position></base-id>
                  <coordinates>78.571 0.000</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>8</position></base-id>
                  <coordinates>0.000 0.000</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>9</position></base-id>
                  <coordinates>0.000 188.571</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>10</position></base-id>
                  <coordinates>78.571 188.571</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>11</position></base-id>
                  <coordinates>157.143 188.571</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>12</position></base-id>
                  <coordinates>235.714 188.571</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>13</position></base-id>
                  <coordinates>314.286 188.571</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>14</position></base-id>
                  <coordinates>392.857 188.571</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>15</position></base-id>
                  <coordinates>471.429 188.571</coordinates>
               </ss-base-coord>
               <ss-base-coord>
                  <base-id><position>16</position></base-id>
                  <coordinates>550.000 188.571</coordinates>
               </ss-base-coord>
            </secondary-structure-display>
         </model>
      </structure>
   </molecule>


   <interactions>
            <str-annotation>
            </str-annotation>
   </interactions>
</rnaml>

