A Portal for Three-dimensional Structural Information about Nucleic Acids
As of 11-Dec-2019 number of released structures: 10507
Search for released structures

NDB ID: PTR005  PDB ID: 1ASY 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
1ASY|1|R|A|6071ASY|1|R|A|6070BPh
1ASY|1|R|A|6071ASY|1|R|G|606s53
1ASY|1|R|A|6071ASY|1|R|U|666cWW
1ASY|1|R|A|6091ASY|1|R|A|623tHH
1ASY|1|R|A|6091ASY|1|R|A|646s55
1ASY|1|R|A|6091ASY|1|R|G|645s33
1ASY|1|R|A|6141ASY|1|R|A|614n0BP
1ASY|1|R|A|6141ASY|1|R|A|615s35
1ASY|1|R|A|6141ASY|1|R|A|621cWS
1ASY|1|R|A|6141ASY|1|R|G|622s55
1ASY|1|R|A|6141ASY|1|R|U|608tHW
1ASY|1|R|A|6151ASY|1|R|A|614s53
1ASY|1|R|A|6151ASY|1|R|A|6150BPh
1ASY|1|R|A|6151ASY|1|R|A|621
1ASY|1|R|A|6151ASY|1|R|U|648tWW
1ASY|1|R|A|6211ASY|1|R|A|614cSW
1ASY|1|R|A|6211ASY|1|R|A|6210BPh
1ASY|1|R|A|6211ASY|1|R|A|646s33
1ASY|1|R|A|6211ASY|1|R|U|608tSS
1ASY|1|R|A|6211ASY|1|R|U|648s556BPh
1ASY|1|R|A|6231ASY|1|R|A|609tHH
1ASY|1|R|A|6231ASY|1|R|A|624s35
1ASY|1|R|A|6231ASY|1|R|G|622s53
1ASY|1|R|A|6231ASY|1|R|U|612cWW
1ASY|1|R|A|6241ASY|1|R|A|623s53
1ASY|1|R|A|6241ASY|1|R|A|624n0BP
1ASY|1|R|A|6241ASY|1|R|U|611cWW
1ASY|1|R|A|6241ASY|1|R|U|612s55
1ASY|1|R|A|6241ASY|1|R|U|625s35
1ASY|1|R|A|6441ASY|1|R|A|6440BPh
1ASY|1|R|A|6441ASY|1|R|C|643s53
1ASY|1|R|A|6441ASY|1|R|G|626cWW
1ASY|1|R|A|6441ASY|1|R|G|627s55
1ASY|1|R|A|6441ASY|1|R|G|645ns35
1ASY|1|R|A|6461ASY|1|R|A|609s55
1ASY|1|R|A|6461ASY|1|R|A|621s33
1ASY|1|R|A|6461ASY|1|R|A|646n0BP
1ASY|1|R|A|6461ASY|1|R|G|622tWHn7BP
1ASY|1|R|A|6571ASY|1|R|A|6570BPh
1ASY|1|R|A|6571ASY|1|R|C|656s53
1ASY|1|R|A|6571ASY|1|R|G|617s33
1ASY|1|R|A|6571ASY|1|R|G|618s55
1ASY|1|R|A|6581ASY|1|R|A|658n0BP
1ASY|1|R|A|6581ASY|1|R|C|661s35
1ASY|1|R|A|6581ASY|1|R|G|617s55
1ASY|1|R|A|6581ASY|1|R|U|660
1ASY|1|R|A|6721ASY|1|R|A|6720BPh
1ASY|1|R|A|6721ASY|1|R|C|602s55
1ASY|1|R|A|6721ASY|1|R|G|671s53
1ASY|1|R|A|6721ASY|1|R|G|673s35
1ASY|1|R|A|6721ASY|1|R|U|601cWW
1ASY|1|R|A|6761ASY|1|R|A|6760BPh
1ASY|1|R|A|6761ASY|1|R|C|675
1ASY|1|R|C|6021ASY|1|R|A|672s55
1ASY|1|R|C|6021ASY|1|R|C|6020BPh
1ASY|1|R|C|6021ASY|1|R|C|603s35
1ASY|1|R|C|6021ASY|1|R|G|671cWW
1ASY|1|R|C|6021ASY|1|R|U|601s53
1ASY|1|R|C|6031ASY|1|R|C|602s53
1ASY|1|R|C|6031ASY|1|R|C|6030BPh
1ASY|1|R|C|6031ASY|1|R|G|604s35
1ASY|1|R|C|6031ASY|1|R|G|670cWW
1ASY|1|R|C|6031ASY|1|R|G|671s55
1ASY|1|R|C|6201ASY|1|R|C|6200BPh
1ASY|1|R|C|6291ASY|1|R|C|629n0BP
1ASY|1|R|C|6291ASY|1|R|G|628s53
1ASY|1|R|C|6291ASY|1|R|G|630ns35n0BP
1ASY|1|R|C|6291ASY|1|R|G|641cWW
1ASY|1|R|C|6311ASY|1|R|C|6310BPh
1ASY|1|R|C|6311ASY|1|R|G|630s53
1ASY|1|R|C|6311ASY|1|R|G|639cWW
1ASY|1|R|C|6361ASY|1|R|C|636n0BP
1ASY|1|R|C|6361ASY|1|R|U|635
1ASY|1|R|C|6381ASY|1|R|G|639ns35
1ASY|1|R|C|6421ASY|1|R|C|6420BPh
1ASY|1|R|C|6421ASY|1|R|C|643s35
1ASY|1|R|C|6421ASY|1|R|G|628cWW
1ASY|1|R|C|6421ASY|1|R|G|641s53
1ASY|1|R|C|6431ASY|1|R|A|644s35
1ASY|1|R|C|6431ASY|1|R|C|642s53
1ASY|1|R|C|6431ASY|1|R|C|6430BPh
1ASY|1|R|C|6431ASY|1|R|G|627cWW
1ASY|1|R|C|6431ASY|1|R|G|628s55
1ASY|1|R|C|6561ASY|1|R|A|657s35
1ASY|1|R|C|6561ASY|1|R|C|6560BPh
1ASY|1|R|C|6561ASY|1|R|G|618cWW
1ASY|1|R|C|6611ASY|1|R|A|658s53
1ASY|1|R|C|6611ASY|1|R|C|6610BPh
1ASY|1|R|C|6611ASY|1|R|C|662s35
1ASY|1|R|C|6611ASY|1|R|G|653cWW
1ASY|1|R|C|6611ASY|1|R|U|6608BPh
1ASY|1|R|C|6621ASY|1|R|C|661s53
1ASY|1|R|C|6621ASY|1|R|C|6620BPh
1ASY|1|R|C|6621ASY|1|R|C|663s35
1ASY|1|R|C|6621ASY|1|R|G|652cWW
1ASY|1|R|C|6621ASY|1|R|G|653s55
1ASY|1|R|C|6621ASY|1|R|U|660n7BP
1ASY|1|R|C|6631ASY|1|R|C|662s53
1ASY|1|R|C|6631ASY|1|R|C|6630BPh
1ASY|1|R|C|6631ASY|1|R|C|664s35
1ASY|1|R|C|6631ASY|1|R|G|651cWW
1ASY|1|R|C|6631ASY|1|R|G|652s55
1ASY|1|R|C|6641ASY|1|R|C|663s53
1ASY|1|R|C|6641ASY|1|R|C|6640BPh
1ASY|1|R|C|6641ASY|1|R|G|650cWW
1ASY|1|R|C|6641ASY|1|R|G|651s55
1ASY|1|R|C|6641ASY|1|R|G|665s35
1ASY|1|R|C|6671ASY|1|R|C|6670BPh
1ASY|1|R|C|6671ASY|1|R|G|606cWW
1ASY|1|R|C|6671ASY|1|R|G|668ns35
1ASY|1|R|C|6671ASY|1|R|U|666s53
1ASY|1|R|C|6691ASY|1|R|C|6690BPh
1ASY|1|R|C|6691ASY|1|R|G|604cWW
1ASY|1|R|C|6691ASY|1|R|G|668s53
1ASY|1|R|C|6691ASY|1|R|G|670s35
1ASY|1|R|C|6741ASY|1|R|C|6740BPh
1ASY|1|R|C|6741ASY|1|R|C|675s35
1ASY|1|R|C|6741ASY|1|R|G|673s53
1ASY|1|R|C|6751ASY|1|R|A|676
1ASY|1|R|C|6751ASY|1|R|C|674s53
1ASY|1|R|C|6751ASY|1|R|C|6750BPh
1ASY|1|R|G|6041ASY|1|R|C|603s53
1ASY|1|R|G|6041ASY|1|R|C|669cWW
1ASY|1|R|G|6041ASY|1|R|G|6040BPh
1ASY|1|R|G|6041ASY|1|R|G|670s55
1ASY|1|R|G|6041ASY|1|R|U|605s35
1ASY|1|R|G|6061ASY|1|R|A|607s35
1ASY|1|R|G|6061ASY|1|R|C|667cWW
1ASY|1|R|G|6061ASY|1|R|G|6060BPh
1ASY|1|R|G|6061ASY|1|R|G|668s55
1ASY|1|R|G|6061ASY|1|R|U|605s53
1ASY|1|R|G|6101ASY|1|R|G|610n0BP
1ASY|1|R|G|6101ASY|1|R|G|626s55
1ASY|1|R|G|6101ASY|1|R|G|645ncHS
1ASY|1|R|G|6101ASY|1|R|U|611s35
1ASY|1|R|G|6101ASY|1|R|U|625cWW
1ASY|1|R|G|6171ASY|1|R|A|657s33
1ASY|1|R|G|6171ASY|1|R|A|658s553BPh
1ASY|1|R|G|6181ASY|1|R|A|657s55
1ASY|1|R|G|6181ASY|1|R|C|656cWW
1ASY|1|R|G|6181ASY|1|R|G|618n0BP
1ASY|1|R|G|6221ASY|1|R|A|614s55
1ASY|1|R|G|6221ASY|1|R|A|621
1ASY|1|R|G|6221ASY|1|R|A|623s35
1ASY|1|R|G|6221ASY|1|R|A|646tHW
1ASY|1|R|G|6221ASY|1|R|G|6220BPh
1ASY|1|R|G|6261ASY|1|R|A|644cWW
1ASY|1|R|G|6261ASY|1|R|G|610s55
1ASY|1|R|G|6261ASY|1|R|G|6260BPh
1ASY|1|R|G|6261ASY|1|R|G|627s35
1ASY|1|R|G|6261ASY|1|R|G|645s55
1ASY|1|R|G|6261ASY|1|R|U|625s53
1ASY|1|R|G|6271ASY|1|R|A|644s55
1ASY|1|R|G|6271ASY|1|R|C|643cWW
1ASY|1|R|G|6271ASY|1|R|G|626s53
1ASY|1|R|G|6271ASY|1|R|G|627n0BP
1ASY|1|R|G|6271ASY|1|R|G|628s35
1ASY|1|R|G|6281ASY|1|R|C|629s35
1ASY|1|R|G|6281ASY|1|R|C|642cWW
1ASY|1|R|G|6281ASY|1|R|C|643s55
1ASY|1|R|G|6281ASY|1|R|G|627s53
1ASY|1|R|G|6281ASY|1|R|G|6280BPh
1ASY|1|R|G|6301ASY|1|R|C|629ns53
1ASY|1|R|G|6301ASY|1|R|C|631s35
1ASY|1|R|G|6301ASY|1|R|G|641s55
1ASY|1|R|G|6301ASY|1|R|U|640cWW
1ASY|1|R|G|6341ASY|1|R|G|634n0BP
1ASY|1|R|G|6341ASY|1|R|U|633
1ASY|1|R|G|6341ASY|1|R|U|635
1ASY|1|R|G|6391ASY|1|R|C|631cWW
1ASY|1|R|G|6391ASY|1|R|C|638ns53
1ASY|1|R|G|6391ASY|1|R|G|6390BPh
1ASY|1|R|G|6391ASY|1|R|U|640s35
1ASY|1|R|G|6411ASY|1|R|C|629cWW
1ASY|1|R|G|6411ASY|1|R|C|642s35
1ASY|1|R|G|6411ASY|1|R|G|630s55
1ASY|1|R|G|6411ASY|1|R|G|6410BPh
1ASY|1|R|G|6411ASY|1|R|U|640
1ASY|1|R|G|6451ASY|1|R|A|609s33
1ASY|1|R|G|6451ASY|1|R|A|644ns53
1ASY|1|R|G|6451ASY|1|R|G|610ncSH
1ASY|1|R|G|6451ASY|1|R|G|626s55
1ASY|1|R|G|6451ASY|1|R|G|6450BPh
1ASY|1|R|G|6451ASY|1|R|U|625
1ASY|1|R|G|6501ASY|1|R|C|664cWW
1ASY|1|R|G|6501ASY|1|R|G|6500BPh
1ASY|1|R|G|6501ASY|1|R|G|651s35
1ASY|1|R|G|6501ASY|1|R|G|665s55
1ASY|1|R|G|6511ASY|1|R|C|663cWW
1ASY|1|R|G|6511ASY|1|R|C|664s55
1ASY|1|R|G|6511ASY|1|R|G|650s53
1ASY|1|R|G|6511ASY|1|R|G|6510BPh
1ASY|1|R|G|6511ASY|1|R|G|652s35
1ASY|1|R|G|6521ASY|1|R|C|662cWW
1ASY|1|R|G|6521ASY|1|R|C|663s55
1ASY|1|R|G|6521ASY|1|R|G|651s53
1ASY|1|R|G|6521ASY|1|R|G|6520BPh
1ASY|1|R|G|6521ASY|1|R|G|653s35
1ASY|1|R|G|6531ASY|1|R|C|661cWW
1ASY|1|R|G|6531ASY|1|R|C|662s55
1ASY|1|R|G|6531ASY|1|R|G|652s53
1ASY|1|R|G|6531ASY|1|R|G|653n0BP
1ASY|1|R|G|6651ASY|1|R|C|664s53
1ASY|1|R|G|6651ASY|1|R|G|650s55
1ASY|1|R|G|6651ASY|1|R|G|6650BPh
1ASY|1|R|G|6651ASY|1|R|U|666s35
1ASY|1|R|G|6681ASY|1|R|C|667ns53
1ASY|1|R|G|6681ASY|1|R|C|669s35
1ASY|1|R|G|6681ASY|1|R|G|606s55
1ASY|1|R|G|6681ASY|1|R|G|6680BPh
1ASY|1|R|G|6681ASY|1|R|U|605cWW
1ASY|1|R|G|6701ASY|1|R|C|603cWW
1ASY|1|R|G|6701ASY|1|R|C|669s53
1ASY|1|R|G|6701ASY|1|R|G|604s55
1ASY|1|R|G|6701ASY|1|R|G|6700BPh
1ASY|1|R|G|6701ASY|1|R|G|671s35
1ASY|1|R|G|6711ASY|1|R|A|672s35
1ASY|1|R|G|6711ASY|1|R|C|602cWW
1ASY|1|R|G|6711ASY|1|R|C|603s55
1ASY|1|R|G|6711ASY|1|R|G|670s53
1ASY|1|R|G|6711ASY|1|R|G|6710BPh
1ASY|1|R|G|6731ASY|1|R|A|672s53
1ASY|1|R|G|6731ASY|1|R|C|674s35
1ASY|1|R|G|6731ASY|1|R|G|6730BPh
1ASY|1|R|U|6011ASY|1|R|A|672cWW
1ASY|1|R|U|6011ASY|1|R|C|602s35
1ASY|1|R|U|6011ASY|1|R|U|6010BPh
1ASY|1|R|U|6051ASY|1|R|G|604s53
1ASY|1|R|U|6051ASY|1|R|G|606s35
1ASY|1|R|U|6051ASY|1|R|G|668cWW
1ASY|1|R|U|6051ASY|1|R|U|6050BPh
1ASY|1|R|U|6081ASY|1|R|A|614tWH
1ASY|1|R|U|6081ASY|1|R|A|621tSS
1ASY|1|R|U|6081ASY|1|R|U|6080BPh
1ASY|1|R|U|6111ASY|1|R|A|624cWW
1ASY|1|R|U|6111ASY|1|R|G|610s53
1ASY|1|R|U|6111ASY|1|R|U|6110BPh
1ASY|1|R|U|6111ASY|1|R|U|612s35
1ASY|1|R|U|6121ASY|1|R|A|623cWW
1ASY|1|R|U|6121ASY|1|R|A|624s55
1ASY|1|R|U|6121ASY|1|R|U|611s53
1ASY|1|R|U|6121ASY|1|R|U|6120BPh
1ASY|1|R|U|6251ASY|1|R|A|624s53
1ASY|1|R|U|6251ASY|1|R|G|610cWW
1ASY|1|R|U|6251ASY|1|R|G|626s35
1ASY|1|R|U|6251ASY|1|R|G|645
1ASY|1|R|U|6251ASY|1|R|U|6250BPh
1ASY|1|R|U|6351ASY|1|R|C|636
1ASY|1|R|U|6351ASY|1|R|G|634
1ASY|1|R|U|6351ASY|1|R|U|6350BPh
1ASY|1|R|U|6401ASY|1|R|G|630cWW
1ASY|1|R|U|6401ASY|1|R|G|639s53
1ASY|1|R|U|6401ASY|1|R|U|6400BPh
1ASY|1|R|U|6481ASY|1|R|A|615tWW
1ASY|1|R|U|6481ASY|1|R|A|621s55
1ASY|1|R|U|6481ASY|1|R|U|659s35
1ASY|1|R|U|6591ASY|1|R|U|648s53
1ASY|1|R|U|6591ASY|1|R|U|6590BPh
1ASY|1|R|U|6591ASY|1|R|U|660s35
1ASY|1|R|U|6601ASY|1|R|A|658
1ASY|1|R|U|6601ASY|1|R|U|659s53
1ASY|1|R|U|6601ASY|1|R|U|660n0BP
1ASY|1|R|U|6661ASY|1|R|A|607cWW
1ASY|1|R|U|6661ASY|1|R|C|667s35
1ASY|1|R|U|6661ASY|1|R|G|665s53
1ASY|1|R|U|6661ASY|1|R|U|6660BPh
1ASY|1|S|A|6071ASY|1|S|A|607n0BP
1ASY|1|S|A|6071ASY|1|S|C|667s55
1ASY|1|S|A|6071ASY|1|S|G|606s53
1ASY|1|S|A|6071ASY|1|S|U|666cWW
1ASY|1|S|A|6091ASY|1|S|A|623tHH
1ASY|1|S|A|6091ASY|1|S|A|646s55
1ASY|1|S|A|6091ASY|1|S|G|645s33
1ASY|1|S|A|6141ASY|1|S|A|615s35
1ASY|1|S|A|6141ASY|1|S|A|621cWS
1ASY|1|S|A|6141ASY|1|S|G|622s55
1ASY|1|S|A|6141ASY|1|S|U|608tHW
1ASY|1|S|A|6151ASY|1|S|A|614s53
1ASY|1|S|A|6151ASY|1|S|A|6150BPh
1ASY|1|S|A|6151ASY|1|S|U|608ns55
1ASY|1|S|A|6151ASY|1|S|U|648tWW
1ASY|1|S|A|6211ASY|1|S|A|614cSW
1ASY|1|S|A|6211ASY|1|S|A|6210BPh
1ASY|1|S|A|6211ASY|1|S|A|646s33
1ASY|1|S|A|6211ASY|1|S|U|608tSS
1ASY|1|S|A|6211ASY|1|S|U|648s55n6BP
1ASY|1|S|A|6231ASY|1|S|A|609tHH
1ASY|1|S|A|6231ASY|1|S|A|6230BPh
1ASY|1|S|A|6231ASY|1|S|A|624s35
1ASY|1|S|A|6231ASY|1|S|G|622s53
1ASY|1|S|A|6231ASY|1|S|U|612cWW
1ASY|1|S|A|6241ASY|1|S|A|623s53
1ASY|1|S|A|6241ASY|1|S|A|6240BPh
1ASY|1|S|A|6241ASY|1|S|U|611cWW
1ASY|1|S|A|6241ASY|1|S|U|612s55
1ASY|1|S|A|6241ASY|1|S|U|625s35
1ASY|1|S|A|6441ASY|1|S|A|6440BPh
1ASY|1|S|A|6441ASY|1|S|C|643s53
1ASY|1|S|A|6441ASY|1|S|G|626cWW
1ASY|1|S|A|6441ASY|1|S|G|627s55
1ASY|1|S|A|6441ASY|1|S|G|645s35
1ASY|1|S|A|6461ASY|1|S|A|609s55
1ASY|1|S|A|6461ASY|1|S|A|621s33
1ASY|1|S|A|6461ASY|1|S|A|6460BPh
1ASY|1|S|A|6461ASY|1|S|G|622tWHn7BP
1ASY|1|S|A|6461ASY|1|S|U|648n0BP
1ASY|1|S|A|6571ASY|1|S|A|6570BPh
1ASY|1|S|A|6571ASY|1|S|C|656s53
1ASY|1|S|A|6571ASY|1|S|G|617s33
1ASY|1|S|A|6571ASY|1|S|G|618s55
1ASY|1|S|A|6581ASY|1|S|A|658n0BP
1ASY|1|S|A|6581ASY|1|S|C|661s35
1ASY|1|S|A|6581ASY|1|S|G|617s55
1ASY|1|S|A|6581ASY|1|S|U|660
1ASY|1|S|A|6721ASY|1|S|A|6720BPh
1ASY|1|S|A|6721ASY|1|S|C|602ns55
1ASY|1|S|A|6721ASY|1|S|G|671s53
1ASY|1|S|A|6721ASY|1|S|G|673s35
1ASY|1|S|A|6721ASY|1|S|U|601cWW
1ASY|1|S|C|6021ASY|1|S|A|672ns55
1ASY|1|S|C|6021ASY|1|S|C|6020BPh
1ASY|1|S|C|6021ASY|1|S|C|603s35
1ASY|1|S|C|6021ASY|1|S|G|671cWW
1ASY|1|S|C|6021ASY|1|S|U|601s53
1ASY|1|S|C|6031ASY|1|S|C|602s53
1ASY|1|S|C|6031ASY|1|S|C|6030BPh
1ASY|1|S|C|6031ASY|1|S|G|604s35
1ASY|1|S|C|6031ASY|1|S|G|670cWW
1ASY|1|S|C|6031ASY|1|S|G|671s55
1ASY|1|S|C|6201ASY|1|S|C|620n0BP
1ASY|1|S|C|6291ASY|1|S|C|6290BPh
1ASY|1|S|C|6291ASY|1|S|G|628s53
1ASY|1|S|C|6291ASY|1|S|G|630ns35n0BP
1ASY|1|S|C|6291ASY|1|S|G|641cWW
1ASY|1|S|C|6311ASY|1|S|C|631n0BP
1ASY|1|S|C|6311ASY|1|S|G|630s53
1ASY|1|S|C|6311ASY|1|S|G|639cWW
1ASY|1|S|C|6361ASY|1|S|C|6360BPh
1ASY|1|S|C|6361ASY|1|S|U|635s53
1ASY|1|S|C|6381ASY|1|S|G|639ns35n0BP
1ASY|1|S|C|6421ASY|1|S|C|6420BPh
1ASY|1|S|C|6421ASY|1|S|C|643s35
1ASY|1|S|C|6421ASY|1|S|G|628cWW
1ASY|1|S|C|6421ASY|1|S|G|641s53
1ASY|1|S|C|6431ASY|1|S|A|644s35
1ASY|1|S|C|6431ASY|1|S|C|642s53
1ASY|1|S|C|6431ASY|1|S|C|6430BPh
1ASY|1|S|C|6431ASY|1|S|G|627cWW
1ASY|1|S|C|6431ASY|1|S|G|628s55
1ASY|1|S|C|6561ASY|1|S|A|657s35
1ASY|1|S|C|6561ASY|1|S|C|6560BPh
1ASY|1|S|C|6561ASY|1|S|G|618cWW
1ASY|1|S|C|6611ASY|1|S|A|658s53
1ASY|1|S|C|6611ASY|1|S|C|6610BPh
1ASY|1|S|C|6611ASY|1|S|C|662s35
1ASY|1|S|C|6611ASY|1|S|G|653cWW
1ASY|1|S|C|6611ASY|1|S|U|6608BPh
1ASY|1|S|C|6621ASY|1|S|C|661s53
1ASY|1|S|C|6621ASY|1|S|C|6620BPh
1ASY|1|S|C|6621ASY|1|S|C|663s35
1ASY|1|S|C|6621ASY|1|S|G|652cWW
1ASY|1|S|C|6621ASY|1|S|G|653s55
1ASY|1|S|C|6631ASY|1|S|C|662s53
1ASY|1|S|C|6631ASY|1|S|C|663n0BP
1ASY|1|S|C|6631ASY|1|S|C|664s35
1ASY|1|S|C|6631ASY|1|S|G|651cWW
1ASY|1|S|C|6631ASY|1|S|G|652s55
1ASY|1|S|C|6641ASY|1|S|C|663s53
1ASY|1|S|C|6641ASY|1|S|C|6640BPh
1ASY|1|S|C|6641ASY|1|S|G|650cWW
1ASY|1|S|C|6641ASY|1|S|G|651s55
1ASY|1|S|C|6641ASY|1|S|G|665s35
1ASY|1|S|C|6671ASY|1|S|A|607s55
1ASY|1|S|C|6671ASY|1|S|C|6670BPh
1ASY|1|S|C|6671ASY|1|S|G|606cWW
1ASY|1|S|C|6671ASY|1|S|U|666s53
1ASY|1|S|C|6691ASY|1|S|C|6690BPh
1ASY|1|S|C|6691ASY|1|S|G|604cWW
1ASY|1|S|C|6691ASY|1|S|G|668s53
1ASY|1|S|C|6691ASY|1|S|G|670ns35
1ASY|1|S|C|6741ASY|1|S|C|6740BPh
1ASY|1|S|C|6741ASY|1|S|C|675s35
1ASY|1|S|C|6741ASY|1|S|G|673s53
1ASY|1|S|C|6751ASY|1|S|C|674s537BPh
1ASY|1|S|C|6751ASY|1|S|C|6750BPh
1ASY|1|S|G|6041ASY|1|S|C|603s53
1ASY|1|S|G|6041ASY|1|S|C|669cWW
1ASY|1|S|G|6041ASY|1|S|G|6040BPh
1ASY|1|S|G|6041ASY|1|S|G|670s55
1ASY|1|S|G|6041ASY|1|S|U|605s35
1ASY|1|S|G|6061ASY|1|S|A|607s35
1ASY|1|S|G|6061ASY|1|S|C|667cWW
1ASY|1|S|G|6061ASY|1|S|G|606n0BP
1ASY|1|S|G|6061ASY|1|S|G|668s55
1ASY|1|S|G|6061ASY|1|S|U|605s53
1ASY|1|S|G|6101ASY|1|S|G|610n0BP
1ASY|1|S|G|6101ASY|1|S|G|626s55
1ASY|1|S|G|6101ASY|1|S|G|645ncHS
1ASY|1|S|G|6101ASY|1|S|U|611s35
1ASY|1|S|G|6101ASY|1|S|U|625cWW
1ASY|1|S|G|6171ASY|1|S|A|657s33
1ASY|1|S|G|6171ASY|1|S|A|658s553BPh
1ASY|1|S|G|6181ASY|1|S|A|657s55
1ASY|1|S|G|6181ASY|1|S|C|656cWW
1ASY|1|S|G|6181ASY|1|S|G|618n0BP
1ASY|1|S|G|6221ASY|1|S|A|614s55
1ASY|1|S|G|6221ASY|1|S|A|621
1ASY|1|S|G|6221ASY|1|S|A|623s35
1ASY|1|S|G|6221ASY|1|S|A|646tHW
1ASY|1|S|G|6221ASY|1|S|G|6220BPh
1ASY|1|S|G|6261ASY|1|S|A|644cWW
1ASY|1|S|G|6261ASY|1|S|G|610s55
1ASY|1|S|G|6261ASY|1|S|G|6260BPh
1ASY|1|S|G|6261ASY|1|S|G|627s35
1ASY|1|S|G|6261ASY|1|S|G|645s55
1ASY|1|S|G|6261ASY|1|S|U|625s53
1ASY|1|S|G|6271ASY|1|S|A|644s55
1ASY|1|S|G|6271ASY|1|S|C|643cWW
1ASY|1|S|G|6271ASY|1|S|G|626s53
1ASY|1|S|G|6271ASY|1|S|G|6270BPh
1ASY|1|S|G|6271ASY|1|S|G|628s35
1ASY|1|S|G|6281ASY|1|S|C|629s35
1ASY|1|S|G|6281ASY|1|S|C|642cWW
1ASY|1|S|G|6281ASY|1|S|C|643s55
1ASY|1|S|G|6281ASY|1|S|G|627s53
1ASY|1|S|G|6281ASY|1|S|G|6280BPh
1ASY|1|S|G|6301ASY|1|S|C|629ns53
1ASY|1|S|G|6301ASY|1|S|C|631s35
1ASY|1|S|G|6301ASY|1|S|G|641s55
1ASY|1|S|G|6301ASY|1|S|U|640cWW
1ASY|1|S|G|6341ASY|1|S|U|633
1ASY|1|S|G|6341ASY|1|S|U|635
1ASY|1|S|G|6391ASY|1|S|C|631cWW
1ASY|1|S|G|6391ASY|1|S|C|638ns53
1ASY|1|S|G|6391ASY|1|S|G|6390BPh
1ASY|1|S|G|6391ASY|1|S|U|640s35
1ASY|1|S|G|6411ASY|1|S|C|629cWW
1ASY|1|S|G|6411ASY|1|S|C|642s35
1ASY|1|S|G|6411ASY|1|S|G|630s55
1ASY|1|S|G|6411ASY|1|S|G|641n0BP
1ASY|1|S|G|6411ASY|1|S|U|640ns53
1ASY|1|S|G|6451ASY|1|S|A|609s33
1ASY|1|S|G|6451ASY|1|S|A|644s53
1ASY|1|S|G|6451ASY|1|S|G|610ncSH
1ASY|1|S|G|6451ASY|1|S|G|626s55
1ASY|1|S|G|6451ASY|1|S|G|6450BPh
1ASY|1|S|G|6451ASY|1|S|U|625
1ASY|1|S|G|6501ASY|1|S|C|664cWW
1ASY|1|S|G|6501ASY|1|S|G|6500BPh
1ASY|1|S|G|6501ASY|1|S|G|651s35
1ASY|1|S|G|6501ASY|1|S|G|665s55
1ASY|1|S|G|6511ASY|1|S|C|663cWW
1ASY|1|S|G|6511ASY|1|S|C|664s55
1ASY|1|S|G|6511ASY|1|S|G|650s53
1ASY|1|S|G|6511ASY|1|S|G|6510BPh
1ASY|1|S|G|6511ASY|1|S|G|652s35
1ASY|1|S|G|6521ASY|1|S|C|662cWW
1ASY|1|S|G|6521ASY|1|S|C|663s55
1ASY|1|S|G|6521ASY|1|S|G|651s53
1ASY|1|S|G|6521ASY|1|S|G|6520BPh
1ASY|1|S|G|6521ASY|1|S|G|653s35
1ASY|1|S|G|6531ASY|1|S|C|661cWW
1ASY|1|S|G|6531ASY|1|S|C|662s55
1ASY|1|S|G|6531ASY|1|S|G|652s53
1ASY|1|S|G|6531ASY|1|S|G|6530BPh
1ASY|1|S|G|6651ASY|1|S|C|664s53
1ASY|1|S|G|6651ASY|1|S|G|650s55
1ASY|1|S|G|6651ASY|1|S|G|6650BPh
1ASY|1|S|G|6651ASY|1|S|U|666s35
1ASY|1|S|G|6681ASY|1|S|C|667
1ASY|1|S|G|6681ASY|1|S|C|669s35
1ASY|1|S|G|6681ASY|1|S|G|606s55
1ASY|1|S|G|6681ASY|1|S|G|668n0BP
1ASY|1|S|G|6681ASY|1|S|U|605cWW
1ASY|1|S|G|6701ASY|1|S|C|603cWW
1ASY|1|S|G|6701ASY|1|S|C|669ns53
1ASY|1|S|G|6701ASY|1|S|G|604s55
1ASY|1|S|G|6701ASY|1|S|G|6700BPh
1ASY|1|S|G|6701ASY|1|S|G|671s35
1ASY|1|S|G|6711ASY|1|S|A|672s35
1ASY|1|S|G|6711ASY|1|S|C|602cWW
1ASY|1|S|G|6711ASY|1|S|C|603s55
1ASY|1|S|G|6711ASY|1|S|G|670s53
1ASY|1|S|G|6711ASY|1|S|G|6710BPh
1ASY|1|S|G|6731ASY|1|S|A|672s53
1ASY|1|S|G|6731ASY|1|S|C|674s35
1ASY|1|S|G|6731ASY|1|S|G|6730BPh
1ASY|1|S|G|6731ASY|1|S|U|601s55
1ASY|1|S|U|6011ASY|1|S|A|672cWW
1ASY|1|S|U|6011ASY|1|S|C|602s35
1ASY|1|S|U|6011ASY|1|S|G|673s55
1ASY|1|S|U|6011ASY|1|S|U|6010BPh
1ASY|1|S|U|6051ASY|1|S|G|604s53
1ASY|1|S|U|6051ASY|1|S|G|606s35
1ASY|1|S|U|6051ASY|1|S|G|668cWW
1ASY|1|S|U|6051ASY|1|S|U|6050BPh
1ASY|1|S|U|6081ASY|1|S|A|614tWH
1ASY|1|S|U|6081ASY|1|S|A|615ns55
1ASY|1|S|U|6081ASY|1|S|A|621tSS
1ASY|1|S|U|6081ASY|1|S|U|6080BPh
1ASY|1|S|U|6111ASY|1|S|A|624cWW
1ASY|1|S|U|6111ASY|1|S|G|610s53
1ASY|1|S|U|6111ASY|1|S|U|6110BPh
1ASY|1|S|U|6111ASY|1|S|U|612s35
1ASY|1|S|U|6121ASY|1|S|A|623cWW
1ASY|1|S|U|6121ASY|1|S|A|624s55
1ASY|1|S|U|6121ASY|1|S|U|611s53
1ASY|1|S|U|6121ASY|1|S|U|6120BPh
1ASY|1|S|U|6251ASY|1|S|A|624s53
1ASY|1|S|U|6251ASY|1|S|G|610cWW
1ASY|1|S|U|6251ASY|1|S|G|626s35
1ASY|1|S|U|6251ASY|1|S|G|645
1ASY|1|S|U|6251ASY|1|S|U|6250BPh
1ASY|1|S|U|6351ASY|1|S|C|636s35
1ASY|1|S|U|6351ASY|1|S|G|634
1ASY|1|S|U|6351ASY|1|S|U|6350BPh
1ASY|1|S|U|6401ASY|1|S|G|630cWW
1ASY|1|S|U|6401ASY|1|S|G|639s53
1ASY|1|S|U|6401ASY|1|S|G|641ns35
1ASY|1|S|U|6401ASY|1|S|U|6400BPh
1ASY|1|S|U|6481ASY|1|S|A|615tWW
1ASY|1|S|U|6481ASY|1|S|A|621s55
1ASY|1|S|U|6481ASY|1|S|U|659s35
1ASY|1|S|U|6591ASY|1|S|U|648s53
1ASY|1|S|U|6591ASY|1|S|U|6590BPh
1ASY|1|S|U|6591ASY|1|S|U|660s35
1ASY|1|S|U|6601ASY|1|S|A|658
1ASY|1|S|U|6601ASY|1|S|C|661
1ASY|1|S|U|6601ASY|1|S|U|659s539BPh
1ASY|1|S|U|6601ASY|1|S|U|6600BPh
1ASY|1|S|U|6661ASY|1|S|A|607cWW
1ASY|1|S|U|6661ASY|1|S|C|667s35
1ASY|1|S|U|6661ASY|1|S|G|665s53
1ASY|1|S|U|6661ASY|1|S|U|6660BPh


Base-PairsCount (54)Relative Frequency
cWW420.778
tWW20.037
tWH40.074
cWS20.037
tHH20.037
tSS20.037
Base-PhosphateCount (103)Relative Frequency
3BPh20.019
6BPh10.010
7BPh10.010
8BPh20.019
9BPh10.010
0BPh960.932
Base-StackingCount (74)Relative Frequency
s3360.081
s53290.392
s55390.527

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)