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As of 18-May-2022 number of released structures: 12082
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NDB ID: PR0023  PDB ID: 1EFW 

RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
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Base-PairsCount (48)Relative Frequency
cWW430.896
tWW10.021
cWS20.042
tHH20.042
Base-PhosphateCount (113)Relative Frequency
6BPh20.018
7BPh20.018
8BPh20.018
9BPh30.027
0BPh1040.920
Base-StackingCount (64)Relative Frequency
s3340.062
s53260.406
s55340.531

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)

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