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NDB ID: 1ELH  PDB ID: 1ELH 

RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
1ELH|1|A|C|111ELH|1|A|C|110BPh
1ELH|1|A|C|111ELH|1|A|G|10s53
1ELH|1|A|C|111ELH|1|B|A|8ntWH
1ELH|1|A|C|31ELH|1|A|C|30BPh
1ELH|1|A|C|31ELH|1|A|C|4s35
1ELH|1|A|C|31ELH|1|A|G|2s53
1ELH|1|A|C|31ELH|1|B|G|17cWW
1ELH|1|A|C|41ELH|1|A|C|3s53
1ELH|1|A|C|41ELH|1|A|C|40BPh
1ELH|1|A|C|41ELH|1|A|U|5s35
1ELH|1|A|C|41ELH|1|B|G|16cWW
1ELH|1|A|C|41ELH|1|B|G|17s55
1ELH|1|A|C|81ELH|1|A|C|8n0BP
1ELH|1|A|C|81ELH|1|A|G|7s53
1ELH|1|A|C|81ELH|1|A|G|9s35
1ELH|1|A|C|81ELH|1|B|C|13ns55
1ELH|1|A|C|81ELH|1|B|G|12cWW
1ELH|1|A|G|101ELH|1|A|C|11s35
1ELH|1|A|G|101ELH|1|A|G|100BPh
1ELH|1|A|G|101ELH|1|A|G|9s53
1ELH|1|A|G|101ELH|1|B|A|9
1ELH|1|A|G|101ELH|1|B|C|10cWW
1ELH|1|A|G|21ELH|1|A|C|3s35
1ELH|1|A|G|21ELH|1|A|G|20BPh
1ELH|1|A|G|21ELH|1|A|U|1ns53
1ELH|1|A|G|21ELH|1|B|A|19s55
1ELH|1|A|G|21ELH|1|B|C|18cWW
1ELH|1|A|G|61ELH|1|A|G|60BPh
1ELH|1|A|G|61ELH|1|A|G|7s35
1ELH|1|A|G|61ELH|1|A|U|5s53
1ELH|1|A|G|61ELH|1|B|A|15s55
1ELH|1|A|G|61ELH|1|B|C|14cWW
1ELH|1|A|G|71ELH|1|A|C|8s35
1ELH|1|A|G|71ELH|1|A|G|6s53
1ELH|1|A|G|71ELH|1|A|G|70BPh
1ELH|1|A|G|71ELH|1|B|C|13cWW
1ELH|1|A|G|71ELH|1|B|C|14s55
1ELH|1|A|G|91ELH|1|A|C|8s53
1ELH|1|A|G|91ELH|1|A|G|10s35
1ELH|1|A|G|91ELH|1|A|G|90BPh
1ELH|1|A|G|91ELH|1|B|G|12s55
1ELH|1|A|G|91ELH|1|B|U|11cWW
1ELH|1|A|U|-11ELH|1|A|U|1s35
1ELH|1|A|U|-11ELH|1|B|A|19ns33
1ELH|1|A|U|-11ELH|1|B|U|20ncWW
1ELH|1|A|U|11ELH|1|A|G|2ns35
1ELH|1|A|U|11ELH|1|A|U|-1s53
1ELH|1|A|U|11ELH|1|A|U|10BPh
1ELH|1|A|U|11ELH|1|B|A|19ncWW
1ELH|1|A|U|11ELH|1|B|C|18ncWW
1ELH|1|A|U|51ELH|1|A|C|4s53
1ELH|1|A|U|51ELH|1|A|G|6s35
1ELH|1|A|U|51ELH|1|A|U|50BPh
1ELH|1|A|U|51ELH|1|B|A|15cWW
1ELH|1|A|U|51ELH|1|B|G|16s55
1ELH|1|B|A|151ELH|1|A|G|6s55
1ELH|1|B|A|151ELH|1|A|U|5cWW
1ELH|1|B|A|151ELH|1|B|A|150BPh
1ELH|1|B|A|151ELH|1|B|C|14s53
1ELH|1|B|A|151ELH|1|B|G|16s35
1ELH|1|B|A|191ELH|1|A|G|2s55
1ELH|1|B|A|191ELH|1|A|U|-1ns33
1ELH|1|B|A|191ELH|1|A|U|1ncWW
1ELH|1|B|A|191ELH|1|B|A|19n0BP
1ELH|1|B|A|191ELH|1|B|C|18s53
1ELH|1|B|A|191ELH|1|B|U|20s35
1ELH|1|B|A|81ELH|1|A|C|11ntHW
1ELH|1|B|A|81ELH|1|B|A|8n0BP
1ELH|1|B|A|81ELH|1|B|A|9s35
1ELH|1|B|A|91ELH|1|A|G|10
1ELH|1|B|A|91ELH|1|B|A|8s53
1ELH|1|B|A|91ELH|1|B|A|90BPh
1ELH|1|B|A|91ELH|1|B|C|10s35
1ELH|1|B|C|101ELH|1|A|G|10cWW
1ELH|1|B|C|101ELH|1|B|A|9s53
1ELH|1|B|C|101ELH|1|B|C|100BPh
1ELH|1|B|C|101ELH|1|B|U|11s35
1ELH|1|B|C|131ELH|1|A|C|8ns55
1ELH|1|B|C|131ELH|1|A|G|7cWW
1ELH|1|B|C|131ELH|1|B|C|130BPh
1ELH|1|B|C|131ELH|1|B|C|14s35
1ELH|1|B|C|131ELH|1|B|G|12s53
1ELH|1|B|C|141ELH|1|A|G|6cWW
1ELH|1|B|C|141ELH|1|A|G|7s55
1ELH|1|B|C|141ELH|1|B|A|15s35
1ELH|1|B|C|141ELH|1|B|C|13s53
1ELH|1|B|C|141ELH|1|B|C|140BPh
1ELH|1|B|C|181ELH|1|A|G|2cWW
1ELH|1|B|C|181ELH|1|A|U|1ncWW
1ELH|1|B|C|181ELH|1|B|A|19s35
1ELH|1|B|C|181ELH|1|B|C|18n0BP
1ELH|1|B|C|181ELH|1|B|G|17s53
1ELH|1|B|G|121ELH|1|A|C|8cWW
1ELH|1|B|G|121ELH|1|A|G|9s55
1ELH|1|B|G|121ELH|1|B|C|13s35
1ELH|1|B|G|121ELH|1|B|G|120BPh
1ELH|1|B|G|121ELH|1|B|U|11ns53
1ELH|1|B|G|161ELH|1|A|C|4cWW
1ELH|1|B|G|161ELH|1|A|U|5s55
1ELH|1|B|G|161ELH|1|B|A|15s53
1ELH|1|B|G|161ELH|1|B|G|160BPh
1ELH|1|B|G|161ELH|1|B|G|17s35
1ELH|1|B|G|171ELH|1|A|C|3cWW
1ELH|1|B|G|171ELH|1|A|C|4s55
1ELH|1|B|G|171ELH|1|B|C|18s35
1ELH|1|B|G|171ELH|1|B|G|16s53
1ELH|1|B|G|171ELH|1|B|G|17n0BP
1ELH|1|B|U|111ELH|1|A|G|9cWW
1ELH|1|B|U|111ELH|1|B|C|10s53
1ELH|1|B|U|111ELH|1|B|G|12ns35
1ELH|1|B|U|111ELH|1|B|U|110BPh
1ELH|1|B|U|201ELH|1|A|U|-1ncWW
1ELH|1|B|U|201ELH|1|B|A|19s53
1ELH|1|B|U|201ELH|1|B|U|200BPh


Base-PairsCount (9)Relative Frequency
cWW91.000
Base-PhosphateCount (19)Relative Frequency
0BPh191.000
Base-StackingCount (15)Relative Frequency
s5390.600
s5560.400

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)

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