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As of 18-May-2022 number of released structures: 12082
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NDB ID: 1ESY  PDB ID: 1ESY 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
1ESY|1|A|A|121ESY|1|A|A|12n0BP
1ESY|1|A|A|121ESY|1|A|G|13s35
1ESY|1|A|A|121ESY|1|A|G|8s55
1ESY|1|A|A|121ESY|1|A|U|7cWW
1ESY|1|A|A|151ESY|1|A|A|150BPh
1ESY|1|A|A|151ESY|1|A|A|5ncWW
1ESY|1|A|A|151ESY|1|A|C|16s35
1ESY|1|A|A|151ESY|1|A|G|13ns53
1ESY|1|A|A|151ESY|1|A|U|14cHS
1ESY|1|A|A|51ESY|1|A|A|15ncWW
1ESY|1|A|A|51ESY|1|A|A|5n0BP
1ESY|1|A|A|51ESY|1|A|C|6s35
1ESY|1|A|A|51ESY|1|A|G|13s33
1ESY|1|A|A|51ESY|1|A|G|4s53
1ESY|1|A|A|51ESY|1|A|U|14tHS
1ESY|1|A|C|161ESY|1|A|A|15s53
1ESY|1|A|C|161ESY|1|A|C|160BPh
1ESY|1|A|C|161ESY|1|A|G|17ns35
1ESY|1|A|C|161ESY|1|A|G|4cWW
1ESY|1|A|C|161ESY|1|A|U|14
1ESY|1|A|C|181ESY|1|A|C|18n0BP
1ESY|1|A|C|181ESY|1|A|C|19s35
1ESY|1|A|C|181ESY|1|A|G|17s53
1ESY|1|A|C|181ESY|1|A|G|2cWW
1ESY|1|A|C|191ESY|1|A|C|18s53
1ESY|1|A|C|191ESY|1|A|C|190BPh
1ESY|1|A|C|191ESY|1|A|G|1cWW
1ESY|1|A|C|31ESY|1|A|C|3n0BP
1ESY|1|A|C|31ESY|1|A|G|17cWW
1ESY|1|A|C|31ESY|1|A|G|2s53
1ESY|1|A|C|31ESY|1|A|G|4ns35
1ESY|1|A|C|31ESY|1|A|U|14ns33
1ESY|1|A|C|61ESY|1|A|A|5s53
1ESY|1|A|C|61ESY|1|A|C|60BPh
1ESY|1|A|C|61ESY|1|A|G|13cWW
1ESY|1|A|C|61ESY|1|A|U|7s35
1ESY|1|A|G|11ESY|1|A|C|19cWW
1ESY|1|A|G|11ESY|1|A|G|10BPh
1ESY|1|A|G|11ESY|1|A|G|2s35
1ESY|1|A|G|111ESY|1|A|G|11n1BP
1ESY|1|A|G|131ESY|1|A|A|12s53
1ESY|1|A|G|131ESY|1|A|A|15ns35
1ESY|1|A|G|131ESY|1|A|A|5s33
1ESY|1|A|G|131ESY|1|A|C|6cWW
1ESY|1|A|G|131ESY|1|A|G|130BPh
1ESY|1|A|G|131ESY|1|A|U|14s35
1ESY|1|A|G|171ESY|1|A|C|16ns53
1ESY|1|A|G|171ESY|1|A|C|18s35
1ESY|1|A|G|171ESY|1|A|C|3cWW
1ESY|1|A|G|171ESY|1|A|G|17n0BP
1ESY|1|A|G|171ESY|1|A|G|2ns33
1ESY|1|A|G|171ESY|1|A|G|4ns55
1ESY|1|A|G|21ESY|1|A|C|18cWW
1ESY|1|A|G|21ESY|1|A|C|3s35
1ESY|1|A|G|21ESY|1|A|G|1s53
1ESY|1|A|G|21ESY|1|A|G|17ns33
1ESY|1|A|G|21ESY|1|A|G|20BPh
1ESY|1|A|G|41ESY|1|A|A|5s35
1ESY|1|A|G|41ESY|1|A|C|16cWW
1ESY|1|A|G|41ESY|1|A|C|3ns53
1ESY|1|A|G|41ESY|1|A|G|17ns55
1ESY|1|A|G|41ESY|1|A|G|4n0BP
1ESY|1|A|G|81ESY|1|A|A|12s55
1ESY|1|A|G|81ESY|1|A|G|80BPh
1ESY|1|A|G|81ESY|1|A|U|7s53
1ESY|1|A|U|141ESY|1|A|A|15cSH
1ESY|1|A|U|141ESY|1|A|A|5tSH
1ESY|1|A|U|141ESY|1|A|C|3ns33
1ESY|1|A|U|141ESY|1|A|G|13s53
1ESY|1|A|U|141ESY|1|A|U|140BPh
1ESY|1|A|U|71ESY|1|A|A|12cWW
1ESY|1|A|U|71ESY|1|A|C|6s53
1ESY|1|A|U|71ESY|1|A|G|8s35
1ESY|1|A|U|71ESY|1|A|U|70BPh


Base-PairsCount (8)Relative Frequency
cWW60.750
cHS10.125
tHS10.125
Base-PhosphateCount (10)Relative Frequency
0BPh101.000
Base-StackingCount (6)Relative Frequency
s3310.167
s5340.667
s5510.167

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)