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As of 9-Feb-2023 number of released structures: 12635
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NDB ID: 1ETF  PDB ID: 1ETF 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
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Base-PairsCount (14)Relative Frequency
cWW120.857
tWW10.071
tHS10.071
Base-PhosphateCount (27)Relative Frequency
3BPh10.037
0BPh260.963
Base-StackingCount (15)Relative Frequency
s3310.067
s53100.667
s5540.267

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)