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As of 18-May-2022 number of released structures: 12082
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NDB ID: PR0035  PDB ID: 1G59 

RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
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Base-PairsCount (64)Relative Frequency
cWW460.719
tWW20.031
tWH60.094
cWS20.031
tWS20.031
tHH20.031
cHS20.031
tSS20.031
Base-PhosphateCount (123)Relative Frequency
5BPh40.033
9BPh20.016
0BPh1170.951
Base-StackingCount (71)Relative Frequency
s3380.113
s53240.338
s55390.549

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)

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