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NDB ID: AH0016  PDB ID: 1ID9 

RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
1ID9|1|A|C|21ID9|1|A|C|20BPh
1ID9|1|A|C|21ID9|1|A|G|1s53
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Base-PairsCount (8)Relative Frequency
cWW81.000
Base-PhosphateCount (13)Relative Frequency
0BPh131.000
Base-StackingCount (10)Relative Frequency
s5360.600
s5540.400

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)

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