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NDB ID: DR0008  PDB ID: 1MWL 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
1MWL|1|A|A|16||A1MWL|1|A|A|16||An0BP
1MWL|1|A|A|16||A1MWL|1|A|A|17||Ans35
1MWL|1|A|A|17||A1MWL|1|A|A|16||Ans53
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1MWL|1|A|A|71MWL|1|A|C|6s53
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1MWL|1|A|A|71MWL|1|B|G|40s55
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1MWL|1|A|A|91MWL|1|A|C|10s35
1MWL|1|A|A|91MWL|1|A|C|8s53
1MWL|1|A|A|91MWL|1|B|G|37s55
1MWL|1|A|A|91MWL|1|B|U|36cWW
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1MWL|1|A|C|101MWL|1|A|C|100BPh
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1MWL|1|A|C|111MWL|1|A|C|10s53
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1MWL|1|A|C|111MWL|1|A|G|12s35
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1MWL|1|B|U|411MWL|1|B|U|410BPh


Base-PairsCount (18)Relative Frequency
cWW181.000
Base-PhosphateCount (36)Relative Frequency
0BPh361.000
Base-StackingCount (23)Relative Frequency
s53140.609
s5590.391

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)