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NDB ID: UH0003  PDB ID: 1N7A 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
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1N7A|1|H|U|61N7A|1|H|U|60BPh


Base-PairsCount (40)Relative Frequency
cWH240.600
tWH80.200
tWS80.200
Base-PhosphateCount (32)Relative Frequency
0BPh321.000
Base-StackingCount (21)Relative Frequency
s33160.762
s5350.238

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)