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As of 18-May-2022 number of released structures: 12082
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NDB ID: 1OLN  PDB ID: 1OLN 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
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1OLN|1|C|U|10781OLN|1|C|A|1077s53
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1OLN|1|C|U|10811OLN|1|C|A|1057cWW
1OLN|1|C|U|10811OLN|1|C|A|1080s53
1OLN|1|C|U|10811OLN|1|C|U|10810BPh
1OLN|1|C|U|10811OLN|1|C|U|1082s35
1OLN|1|C|U|10821OLN|1|C|A|1057s55
1OLN|1|C|U|10821OLN|1|C|A|1086tWW
1OLN|1|C|U|10821OLN|1|C|U|1081s53
1OLN|1|C|U|10821OLN|1|C|U|10820BPh
1OLN|1|C|U|10821OLN|1|C|U|1083s35
1OLN|1|C|U|10831OLN|1|C|A|1085ntSH
1OLN|1|C|U|10831OLN|1|C|A|1086ns535BPh
1OLN|1|C|U|10831OLN|1|C|U|1082s53
1OLN|1|C|U|10901OLN|1|C|C|1102s55
1OLN|1|C|U|10901OLN|1|C|G|1071s35
1OLN|1|C|U|10901OLN|1|C|G|1087s53
1OLN|1|C|U|10901OLN|1|C|G|1089cHS
1OLN|1|C|U|10901OLN|1|C|G|1091s35
1OLN|1|C|U|10901OLN|1|C|U|10900BPh
1OLN|1|C|U|10901OLN|1|C|U|1101cWW
1OLN|1|C|U|10941OLN|1|C|C|1097ntSH5BPh
1OLN|1|C|U|10941OLN|1|C|G|1093s53
1OLN|1|C|U|10941OLN|1|C|U|10940BPh
1OLN|1|C|U|11011OLN|1|C|C|1100s53
1OLN|1|C|U|11011OLN|1|C|C|1102s35
1OLN|1|C|U|11011OLN|1|C|G|1091s55
1OLN|1|C|U|11011OLN|1|C|U|1090cWW
1OLN|1|C|U|11011OLN|1|C|U|11010BPh


Base-PairsCount (25)Relative Frequency
cWW150.600
tWW10.040
cWH30.120
cHS10.040
tHS20.080
cSS20.080
tSS10.040
Base-PhosphateCount (56)Relative Frequency
1BPh10.018
2BPh10.018
5BPh30.054
6BPh10.018
7BPh10.018
9BPh20.036
0BPh470.839
Base-StackingCount (36)Relative Frequency
s3330.083
s53190.528
s55140.389

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)