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NDB ID: PR0104  PDB ID: 1QZW 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
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1QZW|1|H|U|2241QZW|1|H|U|2240BPh


Base-PairsCount (44)Relative Frequency
cWW360.818
tWH40.091
tHS40.091
Base-PhosphateCount (124)Relative Frequency
5BPh40.032
9BPh80.065
0BPh1120.903
Base-StackingCount (64)Relative Frequency
s3380.125
s53200.312
s55360.562

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)