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As of 11-Dec-2019 number of released structures: 10507
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NDB ID: PR0107  PDB ID: 1RC7 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
1RC7|1|B|C|101RC7|1|B|C|100BPh
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1RC7|1|E|G|38||||4_5751RC7|1|D|C|23||||4_575cWW
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1RC7|1|E|G|38||||4_5751RC7|1|E|C|39||||4_575s35
1RC7|1|E|G|38||||4_5751RC7|1|E|G|38||||4_5750BPh


Base-PairsCount (40)Relative Frequency
cWW401.000
Base-PhosphateCount (76)Relative Frequency
0BPh761.000
Base-StackingCount (56)Relative Frequency
s53340.607
s55220.393

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)