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NDB ID: PR0111  PDB ID: 1S03 

RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
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1S03|1|B|U|71S03|1|B|U|7


Base-PairsCount (42)Relative Frequency
cWW360.857
cHS40.095
tHS20.048
Base-PhosphateCount (75)Relative Frequency
6BPh10.013
0BPh740.987
Base-StackingCount (62)Relative Frequency
s3340.065
s53350.565
s55230.371

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)

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