A Portal for Three-dimensional Structural Information about Nucleic Acids
As of 18-May-2022 number of released structures: 12082
Search for released structures

NDB ID: PR0126  PDB ID: 1SZ1 

RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
1SZ1|1|E|A|141SZ1|1|E|A|21ncWS
1SZ1|1|E|A|141SZ1|1|E|G|15s35
1SZ1|1|E|A|141SZ1|1|E|G|22s55
1SZ1|1|E|A|141SZ1|1|E|U|8tHW
1SZ1|1|E|A|211SZ1|1|E|A|14ncSW
1SZ1|1|E|A|211SZ1|1|E|C|48s55
1SZ1|1|E|A|211SZ1|1|E|U|8tSS
1SZ1|1|E|A|231SZ1|1|E|A|230BPh
1SZ1|1|E|A|231SZ1|1|E|A|9tHH
1SZ1|1|E|A|231SZ1|1|E|C|13ns55
1SZ1|1|E|A|231SZ1|1|E|G|22s53
1SZ1|1|E|A|231SZ1|1|E|G|24s35
1SZ1|1|E|A|231SZ1|1|E|U|12cWW
1SZ1|1|E|A|291SZ1|1|E|A|290BPh
1SZ1|1|E|A|291SZ1|1|E|C|28s53
1SZ1|1|E|A|291SZ1|1|E|G|30s35
1SZ1|1|E|A|291SZ1|1|E|G|42s55
1SZ1|1|E|A|291SZ1|1|E|U|41cWW
1SZ1|1|E|A|311SZ1|1|E|A|310BPh
1SZ1|1|E|A|311SZ1|1|E|G|30s53
1SZ1|1|E|A|351SZ1|1|E|A|35n0BP
1SZ1|1|E|A|351SZ1|1|E|A|36s35
1SZ1|1|E|A|361SZ1|1|E|A|35s53
1SZ1|1|E|A|361SZ1|1|E|A|360BPh
1SZ1|1|E|A|361SZ1|1|E|U|33ntHS
1SZ1|1|E|A|381SZ1|1|E|A|380BPh
1SZ1|1|E|A|441SZ1|1|E|A|440BPh
1SZ1|1|E|A|441SZ1|1|E|G|43s53
1SZ1|1|E|A|441SZ1|1|E|G|45s35
1SZ1|1|E|A|51SZ1|1|E|A|50BPh
1SZ1|1|E|A|51SZ1|1|E|G|4s53
1SZ1|1|E|A|51SZ1|1|E|U|6s35
1SZ1|1|E|A|51SZ1|1|E|U|68cWW
1SZ1|1|E|A|51SZ1|1|E|U|69s55
1SZ1|1|E|A|621SZ1|1|E|A|620BPh
1SZ1|1|E|A|621SZ1|1|E|C|61s53
1SZ1|1|E|A|621SZ1|1|E|C|63s35
1SZ1|1|E|A|621SZ1|1|E|G|53s55
1SZ1|1|E|A|621SZ1|1|E|U|52cWW
1SZ1|1|E|A|641SZ1|1|E|A|640BPh
1SZ1|1|E|A|641SZ1|1|E|C|63s53
1SZ1|1|E|A|641SZ1|1|E|G|51s55
1SZ1|1|E|A|641SZ1|1|E|G|65s35
1SZ1|1|E|A|641SZ1|1|E|U|50cWW
1SZ1|1|E|A|661SZ1|1|E|A|660BPh
1SZ1|1|E|A|661SZ1|1|E|A|67s35
1SZ1|1|E|A|661SZ1|1|E|G|65s53
1SZ1|1|E|A|661SZ1|1|E|U|7cWW
1SZ1|1|E|A|671SZ1|1|E|A|66s53
1SZ1|1|E|A|671SZ1|1|E|A|670BPh
1SZ1|1|E|A|671SZ1|1|E|U|6cWW
1SZ1|1|E|A|671SZ1|1|E|U|68s35
1SZ1|1|E|A|671SZ1|1|E|U|7s55
1SZ1|1|E|A|731SZ1|1|E|A|730BPh
1SZ1|1|E|A|731SZ1|1|E|C|72s53
1SZ1|1|E|A|731SZ1|1|E|C|74s35
1SZ1|1|E|A|731SZ1|1|E|G|1s55
1SZ1|1|E|A|761SZ1|1|E|A|760BPh
1SZ1|1|E|A|761SZ1|1|E|C|75s33
1SZ1|1|E|A|91SZ1|1|E|A|23tHH6BPh
1SZ1|1|E|A|91SZ1|1|E|G|22s53
1SZ1|1|E|A|91SZ1|1|E|G|45s33
1SZ1|1|E|C|111SZ1|1|E|A|9
1SZ1|1|E|C|111SZ1|1|E|C|110BPh
1SZ1|1|E|C|111SZ1|1|E|G|24cWW
1SZ1|1|E|C|111SZ1|1|E|U|12s35
1SZ1|1|E|C|131SZ1|1|E|A|23ns55
1SZ1|1|E|C|131SZ1|1|E|A|97BPh
1SZ1|1|E|C|131SZ1|1|E|G|22cWW
1SZ1|1|E|C|131SZ1|1|E|U|12s53
1SZ1|1|E|C|131SZ1|1|E|U|8s33
1SZ1|1|E|C|21SZ1|1|E|C|20BPh
1SZ1|1|E|C|21SZ1|1|E|G|1s53
1SZ1|1|E|C|21SZ1|1|E|G|3s35
1SZ1|1|E|C|21SZ1|1|E|G|71cWW
1SZ1|1|E|C|251SZ1|1|E|C|250BPh
1SZ1|1|E|C|251SZ1|1|E|G|24s53
1SZ1|1|E|C|271SZ1|1|E|C|270BPh
1SZ1|1|E|C|271SZ1|1|E|C|28s35
1SZ1|1|E|C|271SZ1|1|E|G|43cWW
1SZ1|1|E|C|281SZ1|1|E|A|29s35
1SZ1|1|E|C|281SZ1|1|E|C|27s53
1SZ1|1|E|C|281SZ1|1|E|C|280BPh
1SZ1|1|E|C|281SZ1|1|E|G|42cWW
1SZ1|1|E|C|281SZ1|1|E|G|43s55
1SZ1|1|E|C|481SZ1|1|E|A|21s55
1SZ1|1|E|C|481SZ1|1|E|C|480BPh
1SZ1|1|E|C|481SZ1|1|E|G|15tWW
1SZ1|1|E|C|481SZ1|1|E|U|59ns35
1SZ1|1|E|C|561SZ1|1|E|C|560BPh
1SZ1|1|E|C|561SZ1|1|E|G|19cWW
1SZ1|1|E|C|561SZ1|1|E|G|57s35
1SZ1|1|E|C|601SZ1|1|E|C|600BPh
1SZ1|1|E|C|601SZ1|1|E|G|196BPh
1SZ1|1|E|C|601SZ1|1|E|U|59s53
1SZ1|1|E|C|611SZ1|1|E|A|62s35
1SZ1|1|E|C|611SZ1|1|E|C|608BPh
1SZ1|1|E|C|611SZ1|1|E|C|610BPh
1SZ1|1|E|C|611SZ1|1|E|G|53cWW
1SZ1|1|E|C|631SZ1|1|E|A|62s53
1SZ1|1|E|C|631SZ1|1|E|A|64s35
1SZ1|1|E|C|631SZ1|1|E|C|630BPh
1SZ1|1|E|C|631SZ1|1|E|G|51cWW
1SZ1|1|E|C|701SZ1|1|E|C|700BPh
1SZ1|1|E|C|701SZ1|1|E|G|3cWW
1SZ1|1|E|C|701SZ1|1|E|G|4s55
1SZ1|1|E|C|701SZ1|1|E|G|71s35
1SZ1|1|E|C|701SZ1|1|E|U|69s53
1SZ1|1|E|C|721SZ1|1|E|A|73s35
1SZ1|1|E|C|721SZ1|1|E|C|720BPh
1SZ1|1|E|C|721SZ1|1|E|G|1cWW
1SZ1|1|E|C|721SZ1|1|E|G|71s53
1SZ1|1|E|C|741SZ1|1|E|A|73s53
1SZ1|1|E|C|741SZ1|1|E|C|740BPh
1SZ1|1|E|C|741SZ1|1|E|C|75s35
1SZ1|1|E|C|751SZ1|1|E|A|76s33
1SZ1|1|E|C|751SZ1|1|E|C|74s53n9BP
1SZ1|1|E|C|751SZ1|1|E|C|75n0BP
1SZ1|1|E|G|11SZ1|1|E|A|73s55
1SZ1|1|E|G|11SZ1|1|E|C|2s35
1SZ1|1|E|G|11SZ1|1|E|C|72cWW
1SZ1|1|E|G|151SZ1|1|E|A|14s53
1SZ1|1|E|G|151SZ1|1|E|C|48tWW
1SZ1|1|E|G|151SZ1|1|E|G|150BPh
1SZ1|1|E|G|151SZ1|1|E|U|59s35
1SZ1|1|E|G|151SZ1|1|E|U|8s55
1SZ1|1|E|G|181SZ1|1|E|G|18n0BP
1SZ1|1|E|G|181SZ1|1|E|G|57s33
1SZ1|1|E|G|191SZ1|1|E|C|56cWW
1SZ1|1|E|G|191SZ1|1|E|G|190BPh
1SZ1|1|E|G|191SZ1|1|E|G|57s55
1SZ1|1|E|G|201SZ1|1|E|G|20n0BP
1SZ1|1|E|G|201SZ1|1|E|G|22
1SZ1|1|E|G|221SZ1|1|E|A|14s55
1SZ1|1|E|G|221SZ1|1|E|A|21
1SZ1|1|E|G|221SZ1|1|E|A|23s35
1SZ1|1|E|G|221SZ1|1|E|A|9s35
1SZ1|1|E|G|221SZ1|1|E|C|13cWW
1SZ1|1|E|G|221SZ1|1|E|G|22n0BP
1SZ1|1|E|G|241SZ1|1|E|A|23s53
1SZ1|1|E|G|241SZ1|1|E|C|11cWW
1SZ1|1|E|G|241SZ1|1|E|C|25s35
1SZ1|1|E|G|241SZ1|1|E|G|240BPh
1SZ1|1|E|G|241SZ1|1|E|U|12s55
1SZ1|1|E|G|31SZ1|1|E|C|2s53
1SZ1|1|E|G|31SZ1|1|E|C|70cWW
1SZ1|1|E|G|31SZ1|1|E|G|30BPh
1SZ1|1|E|G|31SZ1|1|E|G|4s35
1SZ1|1|E|G|31SZ1|1|E|G|71s55
1SZ1|1|E|G|301SZ1|1|E|A|29s53
1SZ1|1|E|G|301SZ1|1|E|A|31s35
1SZ1|1|E|G|301SZ1|1|E|G|300BPh
1SZ1|1|E|G|301SZ1|1|E|U|41s55
1SZ1|1|E|G|41SZ1|1|E|A|5s35
1SZ1|1|E|G|41SZ1|1|E|C|70s55
1SZ1|1|E|G|41SZ1|1|E|G|3s53
1SZ1|1|E|G|41SZ1|1|E|G|40BPh
1SZ1|1|E|G|41SZ1|1|E|U|69cWW
1SZ1|1|E|G|421SZ1|1|E|A|29s55
1SZ1|1|E|G|421SZ1|1|E|C|28cWW
1SZ1|1|E|G|421SZ1|1|E|G|420BPh
1SZ1|1|E|G|421SZ1|1|E|G|43s35
1SZ1|1|E|G|421SZ1|1|E|U|41s53
1SZ1|1|E|G|431SZ1|1|E|A|44s35
1SZ1|1|E|G|431SZ1|1|E|C|27cWW
1SZ1|1|E|G|431SZ1|1|E|C|28s55
1SZ1|1|E|G|431SZ1|1|E|G|42s53
1SZ1|1|E|G|431SZ1|1|E|G|430BPh
1SZ1|1|E|G|451SZ1|1|E|A|44s53
1SZ1|1|E|G|451SZ1|1|E|A|9s33
1SZ1|1|E|G|451SZ1|1|E|G|450BPh
1SZ1|1|E|G|511SZ1|1|E|A|64s55
1SZ1|1|E|G|511SZ1|1|E|C|63cWW
1SZ1|1|E|G|511SZ1|1|E|G|510BPh
1SZ1|1|E|G|511SZ1|1|E|U|50s53
1SZ1|1|E|G|511SZ1|1|E|U|52s35
1SZ1|1|E|G|531SZ1|1|E|A|62s55
1SZ1|1|E|G|531SZ1|1|E|C|61cWW
1SZ1|1|E|G|531SZ1|1|E|G|530BPh
1SZ1|1|E|G|531SZ1|1|E|U|52s53
1SZ1|1|E|G|571SZ1|1|E|C|56s53
1SZ1|1|E|G|571SZ1|1|E|G|18s33
1SZ1|1|E|G|571SZ1|1|E|G|19s55n3BP
1SZ1|1|E|G|571SZ1|1|E|G|570BPh
1SZ1|1|E|G|651SZ1|1|E|A|64s53
1SZ1|1|E|G|651SZ1|1|E|A|66s35
1SZ1|1|E|G|651SZ1|1|E|G|650BPh
1SZ1|1|E|G|651SZ1|1|E|U|50s55
1SZ1|1|E|G|711SZ1|1|E|C|2cWW
1SZ1|1|E|G|711SZ1|1|E|C|70s53
1SZ1|1|E|G|711SZ1|1|E|C|72s35
1SZ1|1|E|G|711SZ1|1|E|G|3s55
1SZ1|1|E|G|711SZ1|1|E|G|710BPh
1SZ1|1|E|U|121SZ1|1|E|A|23cWW
1SZ1|1|E|U|121SZ1|1|E|C|11s53
1SZ1|1|E|U|121SZ1|1|E|C|13s35
1SZ1|1|E|U|121SZ1|1|E|G|24s55
1SZ1|1|E|U|121SZ1|1|E|U|120BPh
1SZ1|1|E|U|331SZ1|1|E|A|36ntSHn5BP
1SZ1|1|E|U|331SZ1|1|E|U|330BPh
1SZ1|1|E|U|411SZ1|1|E|A|29cWW
1SZ1|1|E|U|411SZ1|1|E|G|30s55
1SZ1|1|E|U|411SZ1|1|E|G|42s35
1SZ1|1|E|U|411SZ1|1|E|U|410BPh
1SZ1|1|E|U|471SZ1|1|E|U|470BPh
1SZ1|1|E|U|501SZ1|1|E|A|64cWW
1SZ1|1|E|U|501SZ1|1|E|G|51s35
1SZ1|1|E|U|501SZ1|1|E|G|65s55
1SZ1|1|E|U|501SZ1|1|E|U|500BPh
1SZ1|1|E|U|521SZ1|1|E|A|62cWW
1SZ1|1|E|U|521SZ1|1|E|G|51s53
1SZ1|1|E|U|521SZ1|1|E|G|53s35
1SZ1|1|E|U|521SZ1|1|E|U|520BPh
1SZ1|1|E|U|591SZ1|1|E|C|48ns53
1SZ1|1|E|U|591SZ1|1|E|C|60s35
1SZ1|1|E|U|591SZ1|1|E|G|15s53
1SZ1|1|E|U|591SZ1|1|E|U|590BPh
1SZ1|1|E|U|61SZ1|1|E|A|5s53
1SZ1|1|E|U|61SZ1|1|E|A|67cWW
1SZ1|1|E|U|61SZ1|1|E|U|60BPh
1SZ1|1|E|U|61SZ1|1|E|U|7s35
1SZ1|1|E|U|681SZ1|1|E|A|5cWW
1SZ1|1|E|U|681SZ1|1|E|A|67s53
1SZ1|1|E|U|681SZ1|1|E|U|680BPh
1SZ1|1|E|U|681SZ1|1|E|U|69s35
1SZ1|1|E|U|691SZ1|1|E|A|5s55
1SZ1|1|E|U|691SZ1|1|E|C|70s35
1SZ1|1|E|U|691SZ1|1|E|G|4cWW
1SZ1|1|E|U|691SZ1|1|E|U|68s53
1SZ1|1|E|U|691SZ1|1|E|U|690BPh
1SZ1|1|E|U|71SZ1|1|E|A|66cWW
1SZ1|1|E|U|71SZ1|1|E|A|67s55
1SZ1|1|E|U|71SZ1|1|E|U|6s53
1SZ1|1|E|U|71SZ1|1|E|U|70BPh
1SZ1|1|E|U|81SZ1|1|E|A|14tWH
1SZ1|1|E|U|81SZ1|1|E|A|21tSS
1SZ1|1|E|U|81SZ1|1|E|C|13s33
1SZ1|1|E|U|81SZ1|1|E|G|15s55
1SZ1|1|E|U|81SZ1|1|E|U|80BPh
1SZ1|1|F|A|141SZ1|1|F|A|21ncWS
1SZ1|1|F|A|141SZ1|1|F|G|15s35
1SZ1|1|F|A|141SZ1|1|F|G|22s55
1SZ1|1|F|A|141SZ1|1|F|U|8tHW
1SZ1|1|F|A|211SZ1|1|F|A|14ncSW
1SZ1|1|F|A|211SZ1|1|F|C|48s55
1SZ1|1|F|A|211SZ1|1|F|U|8tSS
1SZ1|1|F|A|231SZ1|1|F|A|230BPh
1SZ1|1|F|A|231SZ1|1|F|A|9tHH
1SZ1|1|F|A|231SZ1|1|F|C|13ns55
1SZ1|1|F|A|231SZ1|1|F|G|22s53
1SZ1|1|F|A|231SZ1|1|F|G|24s35
1SZ1|1|F|A|231SZ1|1|F|U|12cWW
1SZ1|1|F|A|291SZ1|1|F|A|290BPh
1SZ1|1|F|A|291SZ1|1|F|C|28s53
1SZ1|1|F|A|291SZ1|1|F|G|30s35
1SZ1|1|F|A|291SZ1|1|F|G|42s55
1SZ1|1|F|A|291SZ1|1|F|U|41cWW
1SZ1|1|F|A|311SZ1|1|F|A|310BPh
1SZ1|1|F|A|311SZ1|1|F|G|30s53
1SZ1|1|F|A|351SZ1|1|F|A|35n0BP
1SZ1|1|F|A|351SZ1|1|F|A|36s35
1SZ1|1|F|A|361SZ1|1|F|A|35s53
1SZ1|1|F|A|361SZ1|1|F|A|360BPh
1SZ1|1|F|A|361SZ1|1|F|U|33ntHS
1SZ1|1|F|A|381SZ1|1|F|A|380BPh
1SZ1|1|F|A|441SZ1|1|F|A|440BPh
1SZ1|1|F|A|441SZ1|1|F|G|43s53
1SZ1|1|F|A|441SZ1|1|F|G|45s35
1SZ1|1|F|A|51SZ1|1|F|A|50BPh
1SZ1|1|F|A|51SZ1|1|F|G|4s53
1SZ1|1|F|A|51SZ1|1|F|U|6s35
1SZ1|1|F|A|51SZ1|1|F|U|68cWW
1SZ1|1|F|A|51SZ1|1|F|U|69ns55
1SZ1|1|F|A|621SZ1|1|F|A|620BPh
1SZ1|1|F|A|621SZ1|1|F|C|61s53
1SZ1|1|F|A|621SZ1|1|F|C|63s35
1SZ1|1|F|A|621SZ1|1|F|G|53s55
1SZ1|1|F|A|621SZ1|1|F|U|52cWW
1SZ1|1|F|A|641SZ1|1|F|A|640BPh
1SZ1|1|F|A|641SZ1|1|F|C|63s53
1SZ1|1|F|A|641SZ1|1|F|G|51s55
1SZ1|1|F|A|641SZ1|1|F|G|65s35
1SZ1|1|F|A|641SZ1|1|F|U|50cWW
1SZ1|1|F|A|661SZ1|1|F|A|660BPh
1SZ1|1|F|A|661SZ1|1|F|A|67s35
1SZ1|1|F|A|661SZ1|1|F|G|65s53
1SZ1|1|F|A|661SZ1|1|F|U|7cWW
1SZ1|1|F|A|671SZ1|1|F|A|66s53
1SZ1|1|F|A|671SZ1|1|F|A|670BPh
1SZ1|1|F|A|671SZ1|1|F|U|6cWW
1SZ1|1|F|A|671SZ1|1|F|U|68s35
1SZ1|1|F|A|671SZ1|1|F|U|7s55
1SZ1|1|F|A|731SZ1|1|F|A|730BPh
1SZ1|1|F|A|731SZ1|1|F|C|72s53
1SZ1|1|F|A|731SZ1|1|F|C|74s35
1SZ1|1|F|A|731SZ1|1|F|G|1s55
1SZ1|1|F|A|761SZ1|1|F|A|760BPh
1SZ1|1|F|A|761SZ1|1|F|C|75s33
1SZ1|1|F|A|91SZ1|1|F|A|23tHH6BPh
1SZ1|1|F|A|91SZ1|1|F|G|22s53
1SZ1|1|F|A|91SZ1|1|F|G|45s33
1SZ1|1|F|C|111SZ1|1|F|A|9
1SZ1|1|F|C|111SZ1|1|F|C|110BPh
1SZ1|1|F|C|111SZ1|1|F|G|24cWW
1SZ1|1|F|C|111SZ1|1|F|U|12s35
1SZ1|1|F|C|131SZ1|1|F|A|23ns55
1SZ1|1|F|C|131SZ1|1|F|A|97BPh
1SZ1|1|F|C|131SZ1|1|F|G|22cWW
1SZ1|1|F|C|131SZ1|1|F|U|12s53
1SZ1|1|F|C|131SZ1|1|F|U|8s33
1SZ1|1|F|C|21SZ1|1|F|C|20BPh
1SZ1|1|F|C|21SZ1|1|F|G|1s53
1SZ1|1|F|C|21SZ1|1|F|G|3s35n0BP
1SZ1|1|F|C|21SZ1|1|F|G|71cWW
1SZ1|1|F|C|251SZ1|1|F|C|250BPh
1SZ1|1|F|C|251SZ1|1|F|G|24s53
1SZ1|1|F|C|271SZ1|1|F|C|270BPh
1SZ1|1|F|C|271SZ1|1|F|C|28s35
1SZ1|1|F|C|271SZ1|1|F|G|43cWW
1SZ1|1|F|C|281SZ1|1|F|A|29s35
1SZ1|1|F|C|281SZ1|1|F|C|27s53
1SZ1|1|F|C|281SZ1|1|F|C|280BPh
1SZ1|1|F|C|281SZ1|1|F|G|42cWW
1SZ1|1|F|C|281SZ1|1|F|G|43s55
1SZ1|1|F|C|481SZ1|1|F|A|21s55
1SZ1|1|F|C|481SZ1|1|F|C|480BPh
1SZ1|1|F|C|481SZ1|1|F|G|15tWW
1SZ1|1|F|C|481SZ1|1|F|U|59ns35
1SZ1|1|F|C|561SZ1|1|F|C|560BPh
1SZ1|1|F|C|561SZ1|1|F|G|19cWW
1SZ1|1|F|C|561SZ1|1|F|G|57s35
1SZ1|1|F|C|601SZ1|1|F|C|600BPh
1SZ1|1|F|C|601SZ1|1|F|G|196BPh
1SZ1|1|F|C|601SZ1|1|F|U|59s53n9BP
1SZ1|1|F|C|611SZ1|1|F|A|62s35
1SZ1|1|F|C|611SZ1|1|F|C|608BPh
1SZ1|1|F|C|611SZ1|1|F|C|610BPh
1SZ1|1|F|C|611SZ1|1|F|G|53cWW
1SZ1|1|F|C|631SZ1|1|F|A|62s53
1SZ1|1|F|C|631SZ1|1|F|A|64s35
1SZ1|1|F|C|631SZ1|1|F|C|630BPh
1SZ1|1|F|C|631SZ1|1|F|G|51cWW
1SZ1|1|F|C|701SZ1|1|F|C|700BPh
1SZ1|1|F|C|701SZ1|1|F|G|3cWW
1SZ1|1|F|C|701SZ1|1|F|G|4s55
1SZ1|1|F|C|701SZ1|1|F|G|71s35
1SZ1|1|F|C|701SZ1|1|F|U|69s53
1SZ1|1|F|C|721SZ1|1|F|A|73s35
1SZ1|1|F|C|721SZ1|1|F|C|720BPh
1SZ1|1|F|C|721SZ1|1|F|G|1cWW
1SZ1|1|F|C|721SZ1|1|F|G|71s53
1SZ1|1|F|C|741SZ1|1|F|A|73s53
1SZ1|1|F|C|741SZ1|1|F|C|740BPh
1SZ1|1|F|C|741SZ1|1|F|C|75s35
1SZ1|1|F|C|751SZ1|1|F|A|76s33
1SZ1|1|F|C|751SZ1|1|F|C|74s53n9BP
1SZ1|1|F|C|751SZ1|1|F|C|75n0BP
1SZ1|1|F|G|11SZ1|1|F|A|73s55
1SZ1|1|F|G|11SZ1|1|F|C|2s35
1SZ1|1|F|G|11SZ1|1|F|C|72cWW
1SZ1|1|F|G|151SZ1|1|F|A|14s53
1SZ1|1|F|G|151SZ1|1|F|C|48tWW
1SZ1|1|F|G|151SZ1|1|F|G|150BPh
1SZ1|1|F|G|151SZ1|1|F|U|59s35
1SZ1|1|F|G|151SZ1|1|F|U|8s55
1SZ1|1|F|G|181SZ1|1|F|G|18n0BP
1SZ1|1|F|G|181SZ1|1|F|G|57s33
1SZ1|1|F|G|191SZ1|1|F|C|56cWW
1SZ1|1|F|G|191SZ1|1|F|G|190BPh
1SZ1|1|F|G|191SZ1|1|F|G|57s55
1SZ1|1|F|G|201SZ1|1|F|G|20n0BP
1SZ1|1|F|G|201SZ1|1|F|G|22
1SZ1|1|F|G|221SZ1|1|F|A|14s55
1SZ1|1|F|G|221SZ1|1|F|A|21
1SZ1|1|F|G|221SZ1|1|F|A|23s35
1SZ1|1|F|G|221SZ1|1|F|A|9s35
1SZ1|1|F|G|221SZ1|1|F|C|13cWW
1SZ1|1|F|G|221SZ1|1|F|G|22n0BP
1SZ1|1|F|G|241SZ1|1|F|A|23s53
1SZ1|1|F|G|241SZ1|1|F|C|11cWW
1SZ1|1|F|G|241SZ1|1|F|C|25s35
1SZ1|1|F|G|241SZ1|1|F|G|240BPh
1SZ1|1|F|G|241SZ1|1|F|U|12s55
1SZ1|1|F|G|31SZ1|1|F|C|2s53
1SZ1|1|F|G|31SZ1|1|F|C|70cWW
1SZ1|1|F|G|31SZ1|1|F|G|30BPh
1SZ1|1|F|G|31SZ1|1|F|G|4s35
1SZ1|1|F|G|31SZ1|1|F|G|71s55
1SZ1|1|F|G|301SZ1|1|F|A|29s53
1SZ1|1|F|G|301SZ1|1|F|A|31s35
1SZ1|1|F|G|301SZ1|1|F|G|300BPh
1SZ1|1|F|G|301SZ1|1|F|U|41s55
1SZ1|1|F|G|41SZ1|1|F|A|5s35
1SZ1|1|F|G|41SZ1|1|F|C|70s55
1SZ1|1|F|G|41SZ1|1|F|G|3s53
1SZ1|1|F|G|41SZ1|1|F|G|40BPh
1SZ1|1|F|G|41SZ1|1|F|U|69cWW
1SZ1|1|F|G|421SZ1|1|F|A|29s55
1SZ1|1|F|G|421SZ1|1|F|C|28cWW
1SZ1|1|F|G|421SZ1|1|F|G|420BPh
1SZ1|1|F|G|421SZ1|1|F|G|43s35
1SZ1|1|F|G|421SZ1|1|F|U|41s53
1SZ1|1|F|G|431SZ1|1|F|A|44s35
1SZ1|1|F|G|431SZ1|1|F|C|27cWW
1SZ1|1|F|G|431SZ1|1|F|C|28s55
1SZ1|1|F|G|431SZ1|1|F|G|42s53
1SZ1|1|F|G|431SZ1|1|F|G|430BPh
1SZ1|1|F|G|451SZ1|1|F|A|44s53
1SZ1|1|F|G|451SZ1|1|F|A|9s33
1SZ1|1|F|G|451SZ1|1|F|G|450BPh
1SZ1|1|F|G|511SZ1|1|F|A|64s55
1SZ1|1|F|G|511SZ1|1|F|C|63cWW
1SZ1|1|F|G|511SZ1|1|F|G|510BPh
1SZ1|1|F|G|511SZ1|1|F|U|50s53
1SZ1|1|F|G|511SZ1|1|F|U|52s35
1SZ1|1|F|G|531SZ1|1|F|A|62s55
1SZ1|1|F|G|531SZ1|1|F|C|61cWW
1SZ1|1|F|G|531SZ1|1|F|G|530BPh
1SZ1|1|F|G|531SZ1|1|F|U|52s53
1SZ1|1|F|G|571SZ1|1|F|C|56s53
1SZ1|1|F|G|571SZ1|1|F|G|18s33
1SZ1|1|F|G|571SZ1|1|F|G|19s55n3BP
1SZ1|1|F|G|571SZ1|1|F|G|570BPh
1SZ1|1|F|G|651SZ1|1|F|A|64s53
1SZ1|1|F|G|651SZ1|1|F|A|66s35
1SZ1|1|F|G|651SZ1|1|F|G|650BPh
1SZ1|1|F|G|651SZ1|1|F|U|50s55
1SZ1|1|F|G|711SZ1|1|F|C|2cWW
1SZ1|1|F|G|711SZ1|1|F|C|70s53
1SZ1|1|F|G|711SZ1|1|F|C|72s35
1SZ1|1|F|G|711SZ1|1|F|G|3s55
1SZ1|1|F|G|711SZ1|1|F|G|710BPh
1SZ1|1|F|U|121SZ1|1|F|A|23cWW
1SZ1|1|F|U|121SZ1|1|F|C|11s53
1SZ1|1|F|U|121SZ1|1|F|C|13s35
1SZ1|1|F|U|121SZ1|1|F|G|24s55
1SZ1|1|F|U|121SZ1|1|F|U|120BPh
1SZ1|1|F|U|331SZ1|1|F|A|36ntSHn5BP
1SZ1|1|F|U|331SZ1|1|F|U|330BPh
1SZ1|1|F|U|411SZ1|1|F|A|29cWW
1SZ1|1|F|U|411SZ1|1|F|G|30s55
1SZ1|1|F|U|411SZ1|1|F|G|42s35
1SZ1|1|F|U|411SZ1|1|F|U|410BPh
1SZ1|1|F|U|471SZ1|1|F|U|470BPh
1SZ1|1|F|U|501SZ1|1|F|A|64cWW
1SZ1|1|F|U|501SZ1|1|F|G|51s35
1SZ1|1|F|U|501SZ1|1|F|G|65s55
1SZ1|1|F|U|501SZ1|1|F|U|500BPh
1SZ1|1|F|U|521SZ1|1|F|A|62cWW
1SZ1|1|F|U|521SZ1|1|F|G|51s53
1SZ1|1|F|U|521SZ1|1|F|G|53s35
1SZ1|1|F|U|521SZ1|1|F|U|520BPh
1SZ1|1|F|U|591SZ1|1|F|C|48ns53
1SZ1|1|F|U|591SZ1|1|F|C|60s35
1SZ1|1|F|U|591SZ1|1|F|G|15s53
1SZ1|1|F|U|591SZ1|1|F|U|590BPh
1SZ1|1|F|U|61SZ1|1|F|A|5s53
1SZ1|1|F|U|61SZ1|1|F|A|67cWW
1SZ1|1|F|U|61SZ1|1|F|U|60BPh
1SZ1|1|F|U|61SZ1|1|F|U|7s35
1SZ1|1|F|U|681SZ1|1|F|A|5cWW
1SZ1|1|F|U|681SZ1|1|F|A|67s53
1SZ1|1|F|U|681SZ1|1|F|U|680BPh
1SZ1|1|F|U|681SZ1|1|F|U|69s35
1SZ1|1|F|U|691SZ1|1|F|A|5ns55
1SZ1|1|F|U|691SZ1|1|F|C|70s35
1SZ1|1|F|U|691SZ1|1|F|G|4cWW
1SZ1|1|F|U|691SZ1|1|F|U|68s53
1SZ1|1|F|U|691SZ1|1|F|U|690BPh
1SZ1|1|F|U|71SZ1|1|F|A|66cWW
1SZ1|1|F|U|71SZ1|1|F|A|67s55
1SZ1|1|F|U|71SZ1|1|F|U|6s53
1SZ1|1|F|U|71SZ1|1|F|U|70BPh
1SZ1|1|F|U|81SZ1|1|F|A|14tWH
1SZ1|1|F|U|81SZ1|1|F|A|21tSS
1SZ1|1|F|U|81SZ1|1|F|C|13s33
1SZ1|1|F|U|81SZ1|1|F|G|15s55
1SZ1|1|F|U|81SZ1|1|F|U|80BPh


Base-PairsCount (44)Relative Frequency
cWW360.818
tWW20.045
tWH20.045
tHH20.045
tSS20.045
Base-PhosphateCount (112)Relative Frequency
6BPh40.036
7BPh20.018
8BPh20.018
0BPh1040.929
Base-StackingCount (77)Relative Frequency
s3380.104
s53380.494
s55310.403

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)

ndbadmin@ndbserver.rutgers.edui ©1995-2022 The Nucleic Acid Database Project | Rutgers, The State University of New Jersey