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As of 18-May-2022 number of released structures: 12082
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NDB ID: PR0128  PDB ID: 1TFW 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
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1TFW|1|J|C|691TFW|1|G|G|4cWW
1TFW|1|J|C|691TFW|1|G|G|5s55
1TFW|1|J|C|691TFW|1|J|C|68s53
1TFW|1|J|C|691TFW|1|J|C|69n0BP
1TFW|1|J|C|691TFW|1|J|G|70ns35
1TFW|1|J|C|711TFW|1|J|A|72ns35
1TFW|1|J|C|711TFW|1|J|C|71n0BP
1TFW|1|J|C|731TFW|1|J|A|72s53
1TFW|1|J|C|731TFW|1|J|C|730BPh
1TFW|1|J|G|621TFW|1|G|A|12s55
1TFW|1|J|G|621TFW|1|G|C|11cWW
1TFW|1|J|G|621TFW|1|J|C|61s53
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1TFW|1|J|G|621TFW|1|J|G|620BPh
1TFW|1|J|G|641TFW|1|G|C|9cWW
1TFW|1|J|G|641TFW|1|G|G|10s55
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1TFW|1|J|G|641TFW|1|J|G|640BPh
1TFW|1|J|G|641TFW|1|J|G|65s35
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1TFW|1|J|G|651TFW|1|G|C|9s55
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1TFW|1|J|G|701TFW|1|G|G|4s55
1TFW|1|J|G|701TFW|1|J|A|72
1TFW|1|J|G|701TFW|1|J|C|69ns53
1TFW|1|J|G|701TFW|1|J|C|71
1TFW|1|J|G|701TFW|1|J|G|700BPh
1TFW|1|J|U|671TFW|1|G|A|6cWW
1TFW|1|J|U|671TFW|1|J|A|66s53
1TFW|1|J|U|671TFW|1|J|C|68s35
1TFW|1|J|U|671TFW|1|J|U|670BPh


Base-PairsCount (28)Relative Frequency
cWW281.000
Base-PhosphateCount (64)Relative Frequency
0BPh641.000
Base-StackingCount (43)Relative Frequency
s53260.605
s55170.395

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)