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NDB ID: UR0065  PDB ID: 2A64 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

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2A64|1|A|U|3972A64|1|A|C|396s53
2A64|1|A|U|3972A64|1|A|G|51s55
2A64|1|A|U|3972A64|1|A|U|3970BPh
2A64|1|A|U|3972A64|1|A|U|398s35
2A64|1|A|U|3982A64|1|A|A|399ns35
2A64|1|A|U|3982A64|1|A|A|48tWH
2A64|1|A|U|3982A64|1|A|U|397s53
2A64|1|A|U|3982A64|1|A|U|3980BPh
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2A64|1|A|U|4002A64|1|A|A|399s53
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2A64|1|A|U|4072A64|1|A|C|7ncWW
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2A64|1|A|U|4102A64|1|A|A|409s53
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2A64|1|A|U|4112A64|1|A|A|412s35
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2A64|1|A|U|422A64|1|A|G|41s53
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2A64|1|A|U|592A64|1|A|A|253cWW
2A64|1|A|U|592A64|1|A|C|58s53
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2A64|1|A|U|592A64|1|A|U|590BPh
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2A64|1|A|U|62A64|1|A|A|5s53
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2A64|1|A|U|62A64|1|A|U|60BPh
2A64|1|A|U|672A64|1|A|G|66
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2A64|1|A|U|702A64|1|A|A|74ntWH
2A64|1|A|U|702A64|1|A|C|69s53
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2A64|1|A|U|702A64|1|A|U|700BPh
2A64|1|A|U|752A64|1|A|A|291
2A64|1|A|U|812A64|1|A|A|63cWW
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2A64|1|A|U|812A64|1|A|G|80s53
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2A64|1|A|U|862A64|1|A|U|86n0BP
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2A64|1|A|U|872A64|1|A|A|249cWW
2A64|1|A|U|872A64|1|A|C|88s35
2A64|1|A|U|872A64|1|A|G|85ns55
2A64|1|A|U|872A64|1|A|U|86ns53n9BP
2A64|1|A|U|872A64|1|A|U|870BPh
2A64|1|A|U|92A64|1|A|A|406cWW
2A64|1|A|U|92A64|1|A|A|8s53
2A64|1|A|U|92A64|1|A|G|10s35
2A64|1|A|U|92A64|1|A|U|9n0BP
2A64|1|A|U|902A64|1|A|A|246cWW
2A64|1|A|U|902A64|1|A|G|89s53
2A64|1|A|U|902A64|1|A|G|91ns35
2A64|1|A|U|902A64|1|A|U|900BPh
2A64|1|A|U|942A64|1|A|A|111cWW
2A64|1|A|U|942A64|1|A|A|95s35
2A64|1|A|U|942A64|1|A|C|93s53
2A64|1|A|U|942A64|1|A|G|112s55
2A64|1|A|U|942A64|1|A|U|940BPh


Base-PairsCount (118)Relative Frequency
cWW910.771
tWH30.025
cWS20.017
tWS10.008
cHS10.008
tHS60.051
cSS100.085
tSS40.034
Base-PhosphateCount (222)Relative Frequency
1BPh10.005
2BPh20.009
5BPh30.014
7BPh10.005
9BPh30.014
0BPh2120.955
Base-StackingCount (148)Relative Frequency
s33100.068
s53680.459
s55700.473

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)