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NDB ID: PR0173  PDB ID: 2ANR 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
2ANR|1|B|A|2082ANR|1|B|A|2080BPh
2ANR|1|B|A|2082ANR|1|B|A|219s55
2ANR|1|B|A|2082ANR|1|B|C|218
2ANR|1|B|A|2082ANR|1|B|U|209s35
2ANR|1|B|A|2112ANR|1|B|A|2110BPh
2ANR|1|B|A|2112ANR|1|B|A|2152BPh
2ANR|1|B|A|2112ANR|1|B|C|210s53
2ANR|1|B|A|2112ANR|1|B|G|212s35
2ANR|1|B|A|2152ANR|1|B|A|2150BPh
2ANR|1|B|A|2152ANR|1|B|C|214
2ANR|1|B|A|2152ANR|1|B|C|216s35
2ANR|1|B|A|2192ANR|1|B|A|208s55
2ANR|1|B|A|2192ANR|1|B|A|219n0BP
2ANR|1|B|A|2192ANR|1|B|A|220s35
2ANR|1|B|A|2192ANR|1|B|C|218ns53
2ANR|1|B|A|2192ANR|1|B|G|206s33
2ANR|1|B|A|2192ANR|1|B|G|207tHS
2ANR|1|B|A|2202ANR|1|B|A|219s53
2ANR|1|B|A|2202ANR|1|B|A|2200BPh
2ANR|1|B|A|2202ANR|1|B|G|206tHS
2ANR|1|B|A|2202ANR|1|B|G|221s35
2ANR|1|B|A|2242ANR|1|B|A|2240BPh
2ANR|1|B|A|2242ANR|1|B|C|203ns55
2ANR|1|B|A|2242ANR|1|B|G|223s53
2ANR|1|B|A|2242ANR|1|B|G|225s35
2ANR|1|B|C|2012ANR|1|B|C|2010BPh
2ANR|1|B|C|2012ANR|1|B|G|225cWW
2ANR|1|B|C|2032ANR|1|B|A|224ns55
2ANR|1|B|C|2032ANR|1|B|C|2030BPh
2ANR|1|B|C|2032ANR|1|B|G|204s35
2ANR|1|B|C|2032ANR|1|B|G|223cWW
2ANR|1|B|C|2052ANR|1|B|C|2050BPh
2ANR|1|B|C|2052ANR|1|B|G|204s53
2ANR|1|B|C|2052ANR|1|B|G|206s35
2ANR|1|B|C|2052ANR|1|B|G|221cWW
2ANR|1|B|C|2102ANR|1|B|A|211s35
2ANR|1|B|C|2102ANR|1|B|C|2100BPh
2ANR|1|B|C|2102ANR|1|B|U|209s53
2ANR|1|B|C|2142ANR|1|B|A|215
2ANR|1|B|C|2142ANR|1|B|C|2140BPh
2ANR|1|B|C|2142ANR|1|B|U|213
2ANR|1|B|C|2162ANR|1|B|A|215s53
2ANR|1|B|C|2162ANR|1|B|C|2160BPh
2ANR|1|B|C|2162ANR|1|B|C|217s35
2ANR|1|B|C|2172ANR|1|B|C|216s53
2ANR|1|B|C|2172ANR|1|B|C|2170BPh
2ANR|1|B|C|2172ANR|1|B|C|218s35
2ANR|1|B|C|2182ANR|1|B|A|208
2ANR|1|B|C|2182ANR|1|B|A|219ns35
2ANR|1|B|C|2182ANR|1|B|C|217s53
2ANR|1|B|C|2182ANR|1|B|C|2180BPh
2ANR|1|B|C|2182ANR|1|B|G|207s33
2ANR|1|B|C|2182ANR|1|B|U|209ncWW
2ANR|1|B|C|2222ANR|1|B|C|2220BPh
2ANR|1|B|C|2222ANR|1|B|G|204cWW
2ANR|1|B|C|2222ANR|1|B|G|221s53
2ANR|1|B|C|2222ANR|1|B|G|223s35
2ANR|1|B|G|2042ANR|1|B|C|203s53
2ANR|1|B|G|2042ANR|1|B|C|205s35
2ANR|1|B|G|2042ANR|1|B|C|222cWW
2ANR|1|B|G|2042ANR|1|B|G|2040BPh
2ANR|1|B|G|2042ANR|1|B|G|223s55
2ANR|1|B|G|2062ANR|1|B|A|219s33
2ANR|1|B|G|2062ANR|1|B|A|220tSH
2ANR|1|B|G|2062ANR|1|B|C|205s53
2ANR|1|B|G|2062ANR|1|B|G|2060BPh
2ANR|1|B|G|2062ANR|1|B|G|207s35
2ANR|1|B|G|2062ANR|1|B|G|221s55
2ANR|1|B|G|2072ANR|1|B|A|219tSH
2ANR|1|B|G|2072ANR|1|B|C|218s33
2ANR|1|B|G|2072ANR|1|B|G|206s53
2ANR|1|B|G|2072ANR|1|B|G|2070BPh
2ANR|1|B|G|2122ANR|1|B|A|211s53
2ANR|1|B|G|2122ANR|1|B|G|2120BPh
2ANR|1|B|G|2212ANR|1|B|A|220s53
2ANR|1|B|G|2212ANR|1|B|C|205cWW
2ANR|1|B|G|2212ANR|1|B|C|222s35
2ANR|1|B|G|2212ANR|1|B|G|206s55
2ANR|1|B|G|2212ANR|1|B|G|2210BPh
2ANR|1|B|G|2232ANR|1|B|A|224s35
2ANR|1|B|G|2232ANR|1|B|C|203cWW
2ANR|1|B|G|2232ANR|1|B|C|222s53
2ANR|1|B|G|2232ANR|1|B|G|204s55
2ANR|1|B|G|2232ANR|1|B|G|2230BPh
2ANR|1|B|G|2252ANR|1|B|A|224s53
2ANR|1|B|G|2252ANR|1|B|C|201cWW
2ANR|1|B|G|2252ANR|1|B|G|2250BPh
2ANR|1|B|U|2092ANR|1|B|A|208s539BPh
2ANR|1|B|U|2092ANR|1|B|C|210s35
2ANR|1|B|U|2092ANR|1|B|C|218ncWW
2ANR|1|B|U|2092ANR|1|B|U|2090BPh
2ANR|1|B|U|2132ANR|1|B|U|2130BPh


Base-PairsCount (6)Relative Frequency
cWW40.667
tHS20.333
Base-PhosphateCount (25)Relative Frequency
2BPh10.040
9BPh10.040
0BPh230.920
Base-StackingCount (10)Relative Frequency
s3320.200
s5350.500
s5530.300

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)