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NDB ID: PR0182  PDB ID: 2AZ2 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
2AZ2|1|C|A|152AZ2|1|C|A|150BPh
2AZ2|1|C|A|152AZ2|1|C|C|14s53
2AZ2|1|C|A|152AZ2|1|D|G|5s55
2AZ2|1|C|A|32AZ2|1|C|A|30BPh
2AZ2|1|C|A|32AZ2|1|C|C|2s53
2AZ2|1|C|A|32AZ2|1|D|G|17s55
2AZ2|1|C|A|72AZ2|1|C|A|70BPh
2AZ2|1|C|A|72AZ2|1|C|C|8s35
2AZ2|1|C|A|72AZ2|1|C|G|6s53
2AZ2|1|C|A|72AZ2|1|D|C|13ns55
2AZ2|1|C|C|102AZ2|1|C|C|100BPh
2AZ2|1|C|C|102AZ2|1|C|G|11s35
2AZ2|1|C|C|102AZ2|1|C|G|9s53
2AZ2|1|C|C|102AZ2|1|D|G|9cWW
2AZ2|1|C|C|132AZ2|1|C|C|130BPh
2AZ2|1|C|C|132AZ2|1|C|C|14s35
2AZ2|1|C|C|132AZ2|1|D|G|6cWW
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2AZ2|1|C|C|22AZ2|1|C|A|3s35
2AZ2|1|C|C|22AZ2|1|C|C|20BPh
2AZ2|1|C|C|22AZ2|1|C|G|1s53
2AZ2|1|C|C|22AZ2|1|D|G|17cWW
2AZ2|1|C|C|82AZ2|1|C|A|7s53
2AZ2|1|C|C|82AZ2|1|C|C|80BPh
2AZ2|1|C|C|82AZ2|1|C|G|9s35
2AZ2|1|C|C|82AZ2|1|D|G|11cWW
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2AZ2|1|C|G|12AZ2|1|C|G|10BPh
2AZ2|1|C|G|12AZ2|1|D|C|18cWW
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2AZ2|1|C|G|112AZ2|1|D|C|8cWW
2AZ2|1|C|G|112AZ2|1|D|G|9s55
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2AZ2|1|C|G|52AZ2|1|C|G|50BPh
2AZ2|1|C|G|52AZ2|1|C|G|6s35
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2AZ2|1|C|G|62AZ2|1|C|G|5s53
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2AZ2|1|C|G|62AZ2|1|D|C|14s55
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2AZ2|1|C|G|92AZ2|1|D|G|11s55
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2AZ2|1|D|A|32AZ2|1|C|G|17s55
2AZ2|1|D|A|32AZ2|1|D|A|30BPh
2AZ2|1|D|A|32AZ2|1|D|C|2s53
2AZ2|1|D|A|72AZ2|1|D|A|70BPh
2AZ2|1|D|A|72AZ2|1|D|C|8s35
2AZ2|1|D|A|72AZ2|1|D|G|6s53
2AZ2|1|D|C|102AZ2|1|C|G|9cWW
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2AZ2|1|D|C|102AZ2|1|D|G|11s35
2AZ2|1|D|C|102AZ2|1|D|G|9s53
2AZ2|1|D|C|132AZ2|1|C|A|7ns55
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2AZ2|1|D|C|142AZ2|1|D|C|13s53
2AZ2|1|D|C|142AZ2|1|D|C|140BPh
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2AZ2|1|D|C|22AZ2|1|C|G|17cWW
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2AZ2|1|D|G|52AZ2|1|D|G|50BPh
2AZ2|1|D|G|52AZ2|1|D|G|6s35
2AZ2|1|D|G|62AZ2|1|C|C|13cWW
2AZ2|1|D|G|62AZ2|1|C|C|14s55
2AZ2|1|D|G|62AZ2|1|D|A|7s35
2AZ2|1|D|G|62AZ2|1|D|G|5s53
2AZ2|1|D|G|62AZ2|1|D|G|60BPh
2AZ2|1|D|G|92AZ2|1|C|C|10cWW
2AZ2|1|D|G|92AZ2|1|C|G|11s55
2AZ2|1|D|G|92AZ2|1|D|C|10s35
2AZ2|1|D|G|92AZ2|1|D|C|8s53
2AZ2|1|D|G|92AZ2|1|D|G|90BPh


Base-PairsCount (12)Relative Frequency
cWW121.000
Base-PhosphateCount (30)Relative Frequency
0BPh301.000
Base-StackingCount (20)Relative Frequency
s53120.600
s5580.400

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)