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As of 18-May-2022 number of released structures: 12082
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NDB ID: PR0254  PDB ID: 2BYT 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
2BYT|1|B|A|142BYT|1|B|A|14n0BP
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2BYT|1|E|U|82BYT|1|E|U|80BPh


Base-PairsCount (63)Relative Frequency
cWW440.698
tWW20.032
cWH20.032
tWH40.063
cWS40.063
tHS20.032
cSS20.032
tSS30.048
Base-PhosphateCount (123)Relative Frequency
3BPh40.033
5BPh20.016
8BPh30.024
9BPh10.008
0BPh1130.919
Base-StackingCount (87)Relative Frequency
s3370.080
s53420.483
s55380.437

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)