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As of 19-Jan-2022 number of released structures: 11891
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NDB ID: PR0209  PDB ID: 2C51 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
2C51|1|R|A|12||||P_12C51|1|R|A|12||||P_1n0BP
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2C51|1|S|U|10||||P_P2C51|1|S|U|10||||P_Pn0BP
2C51|1|S|U|4||||P_12C51|1|S|A|16||||P_1cWW
2C51|1|S|U|4||||P_12C51|1|S|G|5||||P_1s35
2C51|1|S|U|4||||P_12C51|1|S|U|4||||P_10BPh
2C51|1|S|U|4||||P_P2C51|1|S|A|16||||P_PcWW
2C51|1|S|U|4||||P_P2C51|1|S|G|5||||P_Ps35
2C51|1|S|U|4||||P_P2C51|1|S|U|4||||P_P0BPh


Base-PairsCount (18)Relative Frequency
cWW181.000
Base-PhosphateCount (40)Relative Frequency
0BPh401.000
Base-StackingCount (24)Relative Frequency
s53120.500
s55120.500

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)