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NDB ID: PR0163  PDB ID: 2CV0 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
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2CV0|1|D|U|5712CV0|1|D|G|570s53
2CV0|1|D|U|5712CV0|1|D|U|5710BPh


Base-PairsCount (63)Relative Frequency
cWW450.714
tWW20.032
tWH60.095
cWS20.032
tWS20.032
tHH20.032
cHS20.032
tSS20.032
Base-PhosphateCount (135)Relative Frequency
5BPh40.030
7BPh40.030
9BPh20.015
0BPh1250.926
Base-StackingCount (75)Relative Frequency
s3380.107
s53260.347
s55410.547

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)