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NDB ID: 2D19  PDB ID: 2D19 

RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
2D19|1|A|A|112D19|1|A|A|110BPh
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2D19|1|B|G|92D19|1|B|U|8s53
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2D19|1|B|U|32D19|1|B|G|16s55
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Base-PairsCount (15)Relative Frequency
cWW140.933
tWW10.067
Base-PhosphateCount (28)Relative Frequency
0BPh281.000
Base-StackingCount (23)Relative Frequency
s3320.087
s53110.478
s55100.435

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)

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