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As of 18-May-2022 number of released structures: 12082
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NDB ID: PR0219  PDB ID: 2DU3 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
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Base-PairsCount (52)Relative Frequency
cWW400.769
tWW20.038
tWH40.077
tWS20.038
cSS20.038
tSS20.038
Base-PhosphateCount (118)Relative Frequency
5BPh40.034
7BPh40.034
9BPh20.017
0BPh1080.915
Base-StackingCount (66)Relative Frequency
s3340.061
s53280.424
s55340.515

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)