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As of 18-May-2022 number of released structures: 12082
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NDB ID: UR0113  PDB ID: 2EEU 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
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2EEU|1|A|U|512EEU|1|A|U|75ncSS
2EEU|1|A|U|522EEU|1|A|A|22cWW
2EEU|1|A|U|522EEU|1|A|C|53s35
2EEU|1|A|U|522EEU|1|A|U|51s53
2EEU|1|A|U|522EEU|1|A|U|52n9BP
2EEU|1|A|U|632EEU|1|A|A|35s535BPh
2EEU|1|A|U|632EEU|1|A|A|64s55
2EEU|1|A|U|632EEU|1|A|G|62cHS
2EEU|1|A|U|632EEU|1|A|U|630BPh
2EEU|1|A|U|672EEU|1|A|A|59cWW
2EEU|1|A|U|672EEU|1|A|A|66s53
2EEU|1|A|U|672EEU|1|A|G|38s53
2EEU|1|A|U|672EEU|1|A|G|68s35
2EEU|1|A|U|672EEU|1|A|U|67n0BP
2EEU|1|A|U|692EEU|1|A|C|70s35
2EEU|1|A|U|692EEU|1|A|G|57cWW
2EEU|1|A|U|692EEU|1|A|G|68s53
2EEU|1|A|U|692EEU|1|A|U|690BPh
2EEU|1|A|U|752EEU|1|A|A|21cWW
2EEU|1|A|U|752EEU|1|A|A|76s35
2EEU|1|A|U|752EEU|1|A|C|50cSW
2EEU|1|A|U|752EEU|1|A|C|74s53
2EEU|1|A|U|752EEU|1|A|U|51ncSS
2EEU|1|A|U|752EEU|1|A|U|750BPh
2EEU|1|A|U|772EEU|1|A|A|19cWW
2EEU|1|A|U|772EEU|1|A|A|76s53
2EEU|1|A|U|772EEU|1|A|G|78s35
2EEU|1|A|U|772EEU|1|A|U|770BPh
2EEU|1|A|U|792EEU|1|A|A|17cWW
2EEU|1|A|U|792EEU|1|A|C|80s35
2EEU|1|A|U|792EEU|1|A|G|78s53
2EEU|1|A|U|792EEU|1|A|U|790BPh


Base-PairsCount (33)Relative Frequency
cWW230.697
tWH30.091
cWS30.091
tWS20.061
cHS10.030
cSS10.030
Base-PhosphateCount (57)Relative Frequency
2BPh10.018
5BPh10.018
8BPh10.018
9BPh10.018
0BPh530.930
Base-StackingCount (37)Relative Frequency
s3320.054
s53200.541
s55150.405

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)