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NDB ID: PR0185  PDB ID: 2EZ6 

RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
2EZ6|1|C|A|12EZ6|1|C|A|10BPh
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2EZ6|1|D|U|282EZ6|1|C|A|1s35
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2EZ6|1|D|U|282EZ6|1|D|A|27s53
2EZ6|1|D|U|282EZ6|1|D|U|280BPh
2EZ6|1|D|U|62EZ6|1|D|C|7s35
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2EZ6|1|D|U|92EZ6|1|D|U|10s35
2EZ6|1|D|U|92EZ6|1|D|U|90BPh


Base-PairsCount (26)Relative Frequency
cWW240.923
tHS20.077
Base-PhosphateCount (58)Relative Frequency
3BPh20.034
0BPh560.966
Base-StackingCount (39)Relative Frequency
s53190.487
s55200.513

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)

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