A Portal for Three-dimensional Structural Information about Nucleic Acids
As of 18-May-2022 number of released structures: 12082
Search for released structures

NDB ID: UR0097  PDB ID: 2HO7 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
2HO7|1|A|A|02HO7|1|A|C|2ncSS
2HO7|1|A|A|02HO7|1|B|G|65tSS
2HO7|1|A|A|132HO7|1|A|A|130BPh
2HO7|1|A|A|132HO7|1|A|A|14s35
2HO7|1|A|A|132HO7|1|A|U|12s53
2HO7|1|A|A|132HO7|1|B|A|29s55
2HO7|1|A|A|132HO7|1|B|U|28cWW
2HO7|1|A|A|142HO7|1|A|A|13s53
2HO7|1|A|A|142HO7|1|A|A|140BPh
2HO7|1|A|A|142HO7|1|A|A|15s35
2HO7|1|A|A|142HO7|1|B|U|27cWW
2HO7|1|A|A|142HO7|1|B|U|28ns55
2HO7|1|A|A|152HO7|1|A|A|14s53
2HO7|1|A|A|152HO7|1|A|A|150BPh
2HO7|1|A|A|152HO7|1|A|G|16s35
2HO7|1|A|A|152HO7|1|B|U|26cWW
2HO7|1|A|A|152HO7|1|B|U|27ns55
2HO7|1|A|A|192HO7|1|A|A|190BPh
2HO7|1|A|A|192HO7|1|A|C|18ns53
2HO7|1|A|A|192HO7|1|A|U|20s35
2HO7|1|A|A|192HO7|1|B|G|23s55
2HO7|1|A|A|92HO7|1|A|A|90BPh
2HO7|1|A|A|92HO7|1|A|C|10s35
2HO7|1|A|A|92HO7|1|A|G|8s53
2HO7|1|A|A|92HO7|1|B|U|32cWW
2HO7|1|A|A|92HO7|1|B|U|33ns55
2HO7|1|A|C|102HO7|1|A|A|9s53
2HO7|1|A|C|102HO7|1|A|C|100BPh
2HO7|1|A|C|102HO7|1|A|U|11s35
2HO7|1|A|C|102HO7|1|B|A|117cSS
2HO7|1|A|C|102HO7|1|B|G|31cWW
2HO7|1|A|C|172HO7|1|A|C|170BPh
2HO7|1|A|C|172HO7|1|A|C|18s35
2HO7|1|A|C|172HO7|1|A|G|16s53
2HO7|1|A|C|172HO7|1|B|G|24cWW
2HO7|1|A|C|182HO7|1|A|A|19ns35
2HO7|1|A|C|182HO7|1|A|C|17s53
2HO7|1|A|C|182HO7|1|A|C|180BPh
2HO7|1|A|C|182HO7|1|B|G|23cWW
2HO7|1|A|C|182HO7|1|B|G|24s55
2HO7|1|A|C|22HO7|1|A|A|0ncSS
2HO7|1|A|C|22HO7|1|A|C|2n0BP
2HO7|1|A|C|22HO7|1|A|G|1n0BP
2HO7|1|A|C|22HO7|1|B|G|64cWW
2HO7|1|A|C|22HO7|1|B|G|65s55
2HO7|1|A|C|42HO7|1|A|C|40BPh
2HO7|1|A|C|42HO7|1|A|C|5s35
2HO7|1|A|C|42HO7|1|A|G|3s53
2HO7|1|A|C|42HO7|1|B|G|62cWW
2HO7|1|A|C|52HO7|1|A|C|4s53
2HO7|1|A|C|52HO7|1|A|C|50BPh
2HO7|1|A|C|52HO7|1|B|G|34s33
2HO7|1|A|C|52HO7|1|B|G|61cWW
2HO7|1|A|C|52HO7|1|B|G|62s55
2HO7|1|A|G|12HO7|1|B|A|35s33
2HO7|1|A|G|12HO7|1|B|G|37cHH
2HO7|1|A|G|162HO7|1|A|A|15s53
2HO7|1|A|G|162HO7|1|A|C|17s35
2HO7|1|A|G|162HO7|1|A|G|160BPh
2HO7|1|A|G|162HO7|1|B|C|25cWW
2HO7|1|A|G|162HO7|1|B|U|26s55
2HO7|1|A|G|32HO7|1|A|C|4s35
2HO7|1|A|G|32HO7|1|A|G|30BPh
2HO7|1|A|G|32HO7|1|B|C|63cWW
2HO7|1|A|G|32HO7|1|B|G|64s55
2HO7|1|A|G|72HO7|1|A|G|70BPh
2HO7|1|A|G|72HO7|1|A|G|8s35
2HO7|1|A|G|72HO7|1|B|C|60cWW
2HO7|1|A|G|72HO7|1|B|G|34tHS
2HO7|1|A|G|72HO7|1|B|G|61s55
2HO7|1|A|G|82HO7|1|A|A|9s35
2HO7|1|A|G|82HO7|1|A|G|7s53
2HO7|1|A|G|82HO7|1|A|G|80BPh
2HO7|1|A|G|82HO7|1|B|C|60s55
2HO7|1|A|G|82HO7|1|B|U|33cWW
2HO7|1|A|U|112HO7|1|A|C|10s53
2HO7|1|A|U|112HO7|1|A|U|110BPh
2HO7|1|A|U|112HO7|1|A|U|12s35
2HO7|1|A|U|112HO7|1|B|A|117ncSS
2HO7|1|A|U|112HO7|1|B|A|30cWW
2HO7|1|A|U|112HO7|1|B|G|116cSS
2HO7|1|A|U|112HO7|1|B|G|31s55
2HO7|1|A|U|122HO7|1|A|A|13s35
2HO7|1|A|U|122HO7|1|A|U|11s53
2HO7|1|A|U|122HO7|1|A|U|120BPh
2HO7|1|A|U|122HO7|1|B|A|29cWW
2HO7|1|A|U|122HO7|1|B|A|30s55
2HO7|1|A|U|202HO7|1|A|A|19s53
2HO7|1|A|U|202HO7|1|A|U|200BPh
2HO7|1|B|A|1042HO7|1|B|A|1040BPh
2HO7|1|B|A|1042HO7|1|B|A|105s35
2HO7|1|B|A|1042HO7|1|B|A|127s55
2HO7|1|B|A|1042HO7|1|B|A|54
2HO7|1|B|A|1042HO7|1|B|G|37ncSS
2HO7|1|B|A|1042HO7|1|B|G|53ntWS
2HO7|1|B|A|1052HO7|1|B|A|104s53
2HO7|1|B|A|1052HO7|1|B|A|105n0BP
2HO7|1|B|A|1052HO7|1|B|A|106s35
2HO7|1|B|A|1052HO7|1|B|A|54
2HO7|1|B|A|1052HO7|1|B|C|36ncSS
2HO7|1|B|A|1052HO7|1|B|U|126tHW
2HO7|1|B|A|1062HO7|1|B|A|105s53
2HO7|1|B|A|1062HO7|1|B|A|1060BPh
2HO7|1|B|A|1062HO7|1|B|A|107s35
2HO7|1|B|A|1062HO7|1|B|A|125tHW
2HO7|1|B|A|1062HO7|1|B|A|54ntSS
2HO7|1|B|A|1072HO7|1|B|A|106s53
2HO7|1|B|A|1072HO7|1|B|A|1070BPh
2HO7|1|B|A|1072HO7|1|B|A|125s55
2HO7|1|B|A|1072HO7|1|B|C|108s35
2HO7|1|B|A|1072HO7|1|B|C|124tHW
2HO7|1|B|A|1072HO7|1|B|G|55
2HO7|1|B|A|1102HO7|1|B|A|1100BPh
2HO7|1|B|A|1102HO7|1|B|C|109s53
2HO7|1|B|A|1102HO7|1|B|C|111s35
2HO7|1|B|A|1102HO7|1|B|G|122s55
2HO7|1|B|A|1102HO7|1|B|U|121cWW
2HO7|1|B|A|1122HO7|1|B|A|1120BPh
2HO7|1|B|A|1122HO7|1|B|C|111s53
2HO7|1|B|A|1122HO7|1|B|G|113s35
2HO7|1|B|A|1122HO7|1|B|G|120s55
2HO7|1|B|A|1122HO7|1|B|U|119cWW
2HO7|1|B|A|1172HO7|1|A|C|10cSS
2HO7|1|B|A|1172HO7|1|A|U|11ncSS
2HO7|1|B|A|1172HO7|1|B|A|1170BPh
2HO7|1|B|A|1172HO7|1|B|C|118
2HO7|1|B|A|1172HO7|1|B|G|114ntHS
2HO7|1|B|A|1172HO7|1|B|G|116s53
2HO7|1|B|A|1172HO7|1|B|G|31tSS
2HO7|1|B|A|1252HO7|1|B|A|106tWH
2HO7|1|B|A|1252HO7|1|B|A|107s55
2HO7|1|B|A|1252HO7|1|B|A|1250BPh
2HO7|1|B|A|1252HO7|1|B|C|124ns53
2HO7|1|B|A|1252HO7|1|B|U|126s35
2HO7|1|B|A|1272HO7|1|B|A|104s55
2HO7|1|B|A|1272HO7|1|B|A|38
2HO7|1|B|A|1272HO7|1|B|G|128s35
2HO7|1|B|A|1272HO7|1|B|G|37ntWS
2HO7|1|B|A|1272HO7|1|B|G|53ncSS
2HO7|1|B|A|1292HO7|1|B|A|1290BPh
2HO7|1|B|A|1292HO7|1|B|A|38
2HO7|1|B|A|1292HO7|1|B|C|131s35
2HO7|1|B|A|1292HO7|1|B|G|102ntHS
2HO7|1|B|A|1292HO7|1|B|G|128s53
2HO7|1|B|A|1292HO7|1|B|G|39
2HO7|1|B|A|1322HO7|1|B|A|1320BPh
2HO7|1|B|A|1322HO7|1|B|C|131s53
2HO7|1|B|A|1322HO7|1|B|G|101s55
2HO7|1|B|A|1322HO7|1|B|G|133s35
2HO7|1|B|A|1322HO7|1|B|U|100cWW
2HO7|1|B|A|1412HO7|1|B|A|1410BPh
2HO7|1|B|A|1412HO7|1|B|C|140s53
2HO7|1|B|A|1412HO7|1|B|G|142s35
2HO7|1|B|A|1412HO7|1|B|G|84s55
2HO7|1|B|A|1412HO7|1|B|U|83cWW
2HO7|1|B|A|1442HO7|1|B|A|1440BPh
2HO7|1|B|A|1442HO7|1|B|C|81ns55
2HO7|1|B|A|1442HO7|1|B|G|143s53
2HO7|1|B|A|1442HO7|1|B|U|80cWW
2HO7|1|B|A|292HO7|1|A|A|13s55
2HO7|1|B|A|292HO7|1|A|U|12cWW
2HO7|1|B|A|292HO7|1|B|A|290BPh
2HO7|1|B|A|292HO7|1|B|A|30s35
2HO7|1|B|A|292HO7|1|B|U|28s53
2HO7|1|B|A|302HO7|1|A|U|11cWW
2HO7|1|B|A|302HO7|1|A|U|12s55
2HO7|1|B|A|302HO7|1|B|A|29s53
2HO7|1|B|A|302HO7|1|B|A|300BPh
2HO7|1|B|A|302HO7|1|B|G|31s35
2HO7|1|B|A|352HO7|1|A|G|1s33
2HO7|1|B|A|352HO7|1|B|A|350BPh
2HO7|1|B|A|352HO7|1|B|A|54ncSW
2HO7|1|B|A|352HO7|1|B|C|36cSH
2HO7|1|B|A|352HO7|1|B|U|59s55
2HO7|1|B|A|382HO7|1|B|A|380BPh
2HO7|1|B|A|382HO7|1|B|C|52s55
2HO7|1|B|A|382HO7|1|B|G|37s53
2HO7|1|B|A|382HO7|1|B|G|39s35
2HO7|1|B|A|382HO7|1|B|U|51cWW
2HO7|1|B|A|432HO7|1|B|A|430BPh
2HO7|1|B|A|432HO7|1|B|C|42s53
2HO7|1|B|A|432HO7|1|B|G|44s35
2HO7|1|B|A|432HO7|1|B|G|73s55
2HO7|1|B|A|432HO7|1|B|U|72cWW
2HO7|1|B|A|502HO7|1|B|A|50n0BP
2HO7|1|B|A|502HO7|1|B|G|66s33
2HO7|1|B|A|502HO7|1|B|G|68s55
2HO7|1|B|A|502HO7|1|B|U|48cHW
2HO7|1|B|A|502HO7|1|B|U|676BPh
2HO7|1|B|A|542HO7|1|B|A|106ntSS
2HO7|1|B|A|542HO7|1|B|A|35ncWS
2HO7|1|B|A|542HO7|1|B|A|540BPh
2HO7|1|B|A|542HO7|1|B|A|56s35
2HO7|1|B|A|542HO7|1|B|C|36s55
2HO7|1|B|A|542HO7|1|B|G|53s53
2HO7|1|B|A|542HO7|1|B|U|59tWW
2HO7|1|B|A|562HO7|1|B|A|54s53
2HO7|1|B|A|562HO7|1|B|A|56n0BP
2HO7|1|B|A|562HO7|1|B|C|57s35
2HO7|1|B|A|562HO7|1|B|G|557BPh
2HO7|1|B|A|582HO7|1|A|G|8
2HO7|1|B|A|582HO7|1|B|A|580BPh
2HO7|1|B|A|582HO7|1|B|C|60
2HO7|1|B|A|872HO7|1|B|A|870BPh
2HO7|1|B|A|872HO7|1|B|C|78ns55
2HO7|1|B|A|872HO7|1|B|C|88s35
2HO7|1|B|A|872HO7|1|B|G|86s53
2HO7|1|B|A|872HO7|1|B|U|77cWW
2HO7|1|B|A|932HO7|1|B|A|930BPh
2HO7|1|B|A|932HO7|1|B|G|75tSS
2HO7|1|B|A|932HO7|1|B|G|76ns35
2HO7|1|B|A|932HO7|1|B|U|91s55
2HO7|1|B|A|952HO7|1|B|A|950BPh
2HO7|1|B|A|952HO7|1|B|G|137tHS
2HO7|1|B|A|952HO7|1|B|G|94s53
2HO7|1|B|A|952HO7|1|B|G|96s35
2HO7|1|B|A|982HO7|1|B|A|980BPh
2HO7|1|B|A|982HO7|1|B|C|99s35
2HO7|1|B|A|982HO7|1|B|G|97s53
2HO7|1|B|A|982HO7|1|B|U|134cWW
2HO7|1|B|C|1082HO7|1|B|A|107s538BPh
2HO7|1|B|C|1082HO7|1|B|C|1080BPh
2HO7|1|B|C|1082HO7|1|B|C|109s35
2HO7|1|B|C|1082HO7|1|B|G|123cWW
2HO7|1|B|C|1092HO7|1|B|A|110s35
2HO7|1|B|C|1092HO7|1|B|C|108s53
2HO7|1|B|C|1092HO7|1|B|C|1090BPh
2HO7|1|B|C|1092HO7|1|B|G|122cWW
2HO7|1|B|C|1092HO7|1|B|G|123s55
2HO7|1|B|C|1112HO7|1|B|A|110s53
2HO7|1|B|C|1112HO7|1|B|A|112s35
2HO7|1|B|C|1112HO7|1|B|C|1110BPh
2HO7|1|B|C|1112HO7|1|B|G|120cWW
2HO7|1|B|C|1152HO7|1|A|U|12
2HO7|1|B|C|1152HO7|1|B|C|1150BPh
2HO7|1|B|C|1152HO7|1|B|G|116s35
2HO7|1|B|C|1182HO7|1|B|C|1180BPh
2HO7|1|B|C|1182HO7|1|B|G|113cWW
2HO7|1|B|C|1182HO7|1|B|G|114s55
2HO7|1|B|C|1182HO7|1|B|U|119s35
2HO7|1|B|C|1242HO7|1|B|A|1067BPh
2HO7|1|B|C|1242HO7|1|B|A|107tWH
2HO7|1|B|C|1242HO7|1|B|A|125ns35
2HO7|1|B|C|1242HO7|1|B|C|124n0BP
2HO7|1|B|C|1242HO7|1|B|G|123s53
2HO7|1|B|C|1312HO7|1|B|A|129s53
2HO7|1|B|C|1312HO7|1|B|A|132s35
2HO7|1|B|C|1312HO7|1|B|C|1310BPh
2HO7|1|B|C|1312HO7|1|B|G|101cWW
2HO7|1|B|C|1312HO7|1|B|G|1307BPh
2HO7|1|B|C|1352HO7|1|B|C|1350BPh
2HO7|1|B|C|1352HO7|1|B|C|136s35
2HO7|1|B|C|1352HO7|1|B|G|97cWW
2HO7|1|B|C|1352HO7|1|B|U|134s53
2HO7|1|B|C|1362HO7|1|B|C|135s53
2HO7|1|B|C|1362HO7|1|B|C|1360BPh
2HO7|1|B|C|1362HO7|1|B|G|137s35
2HO7|1|B|C|1362HO7|1|B|G|96cWW
2HO7|1|B|C|1362HO7|1|B|G|97s55
2HO7|1|B|C|1402HO7|1|B|A|141s35
2HO7|1|B|C|1402HO7|1|B|C|1400BPh
2HO7|1|B|C|1402HO7|1|B|G|139s53
2HO7|1|B|C|1402HO7|1|B|G|84cWW
2HO7|1|B|C|252HO7|1|A|G|16cWW
2HO7|1|B|C|252HO7|1|B|C|250BPh
2HO7|1|B|C|252HO7|1|B|G|24s53
2HO7|1|B|C|252HO7|1|B|U|26s35
2HO7|1|B|C|362HO7|1|B|A|105ncSS
2HO7|1|B|C|362HO7|1|B|A|35cHS
2HO7|1|B|C|362HO7|1|B|A|54s55
2HO7|1|B|C|362HO7|1|B|C|360BPh
2HO7|1|B|C|362HO7|1|B|G|37s35
2HO7|1|B|C|362HO7|1|B|G|53cWW
2HO7|1|B|C|362HO7|1|B|U|59s55
2HO7|1|B|C|422HO7|1|B|A|43s35
2HO7|1|B|C|422HO7|1|B|C|420BPh
2HO7|1|B|C|422HO7|1|B|G|73cWW
2HO7|1|B|C|422HO7|1|B|G|90s53
2HO7|1|B|C|522HO7|1|B|A|38s55
2HO7|1|B|C|522HO7|1|B|C|520BPh
2HO7|1|B|C|522HO7|1|B|G|128ncSS
2HO7|1|B|C|522HO7|1|B|G|37cWW
2HO7|1|B|C|522HO7|1|B|G|53s35
2HO7|1|B|C|522HO7|1|B|U|51s53
2HO7|1|B|C|572HO7|1|B|A|56s539BPh
2HO7|1|B|C|572HO7|1|B|C|570BPh
2HO7|1|B|C|572HO7|1|B|G|55n7BP
2HO7|1|B|C|602HO7|1|A|G|7cWW
2HO7|1|B|C|602HO7|1|A|G|8s55
2HO7|1|B|C|602HO7|1|B|A|58
2HO7|1|B|C|602HO7|1|B|C|600BPh
2HO7|1|B|C|602HO7|1|B|G|34cHS
2HO7|1|B|C|602HO7|1|B|G|61s35
2HO7|1|B|C|602HO7|1|B|U|599BPh
2HO7|1|B|C|632HO7|1|A|G|3cWW
2HO7|1|B|C|632HO7|1|B|C|630BPh
2HO7|1|B|C|632HO7|1|B|G|62s53
2HO7|1|B|C|632HO7|1|B|G|64s35
2HO7|1|B|C|692HO7|1|B|C|690BPh
2HO7|1|B|C|692HO7|1|B|C|70s35
2HO7|1|B|C|692HO7|1|B|G|46cWW
2HO7|1|B|C|692HO7|1|B|G|68s53
2HO7|1|B|C|702HO7|1|B|C|69s53
2HO7|1|B|C|702HO7|1|B|C|700BPh
2HO7|1|B|C|702HO7|1|B|C|71s35
2HO7|1|B|C|702HO7|1|B|G|45cWW
2HO7|1|B|C|702HO7|1|B|G|46s55
2HO7|1|B|C|712HO7|1|B|C|70s53
2HO7|1|B|C|712HO7|1|B|C|710BPh
2HO7|1|B|C|712HO7|1|B|G|44cWW
2HO7|1|B|C|712HO7|1|B|G|45s55
2HO7|1|B|C|712HO7|1|B|U|72s35
2HO7|1|B|C|742HO7|1|B|C|740BPh
2HO7|1|B|C|742HO7|1|B|G|73s53
2HO7|1|B|C|742HO7|1|B|G|75s35
2HO7|1|B|C|742HO7|1|B|G|90cWW
2HO7|1|B|C|782HO7|1|B|A|87ns55
2HO7|1|B|C|782HO7|1|B|C|780BPh
2HO7|1|B|C|782HO7|1|B|G|138ns53
2HO7|1|B|C|782HO7|1|B|G|86cWW
2HO7|1|B|C|782HO7|1|B|U|77s53
2HO7|1|B|C|812HO7|1|B|A|144ns55
2HO7|1|B|C|812HO7|1|B|C|810BPh
2HO7|1|B|C|812HO7|1|B|C|82s35
2HO7|1|B|C|812HO7|1|B|G|143cWW
2HO7|1|B|C|812HO7|1|B|U|79
2HO7|1|B|C|812HO7|1|B|U|80s53
2HO7|1|B|C|822HO7|1|B|C|81s53
2HO7|1|B|C|822HO7|1|B|C|820BPh
2HO7|1|B|C|822HO7|1|B|G|142cWW
2HO7|1|B|C|822HO7|1|B|G|143s55
2HO7|1|B|C|822HO7|1|B|U|79ncHS
2HO7|1|B|C|822HO7|1|B|U|83s35
2HO7|1|B|C|852HO7|1|B|C|850BPh
2HO7|1|B|C|852HO7|1|B|G|139cWW
2HO7|1|B|C|852HO7|1|B|G|84s53
2HO7|1|B|C|852HO7|1|B|G|86s35
2HO7|1|B|C|882HO7|1|B|A|87s53
2HO7|1|B|C|882HO7|1|B|C|880BPh
2HO7|1|B|C|882HO7|1|B|C|89s35
2HO7|1|B|C|882HO7|1|B|G|76cWW
2HO7|1|B|C|892HO7|1|B|C|88s53
2HO7|1|B|C|892HO7|1|B|C|89n0BP
2HO7|1|B|C|892HO7|1|B|G|75cWW
2HO7|1|B|C|892HO7|1|B|G|76s55
2HO7|1|B|C|892HO7|1|B|G|90ns35
2HO7|1|B|C|992HO7|1|B|A|98s53
2HO7|1|B|C|992HO7|1|B|C|990BPh
2HO7|1|B|C|992HO7|1|B|G|133cWW
2HO7|1|B|C|992HO7|1|B|U|100s35
2HO7|1|B|G|1012HO7|1|B|A|132s55
2HO7|1|B|G|1012HO7|1|B|C|131cWW
2HO7|1|B|G|1012HO7|1|B|G|102s35
2HO7|1|B|G|1012HO7|1|B|U|100s53
2HO7|1|B|G|1022HO7|1|B|A|129ntSH4BPh
2HO7|1|B|G|1022HO7|1|B|G|101s53
2HO7|1|B|G|1022HO7|1|B|G|1020BPh
2HO7|1|B|G|1022HO7|1|B|G|128s33
2HO7|1|B|G|1132HO7|1|B|A|112s53
2HO7|1|B|G|1132HO7|1|B|C|118cWW
2HO7|1|B|G|1132HO7|1|B|G|1130BPh
2HO7|1|B|G|1132HO7|1|B|G|114s35
2HO7|1|B|G|1132HO7|1|B|U|119s55
2HO7|1|B|G|1142HO7|1|B|A|117ntSH3BPh
2HO7|1|B|G|1142HO7|1|B|C|118s55
2HO7|1|B|G|1142HO7|1|B|G|113s53
2HO7|1|B|G|1142HO7|1|B|G|1140BPh
2HO7|1|B|G|1142HO7|1|B|G|116s33
2HO7|1|B|G|1162HO7|1|A|U|11cSS
2HO7|1|B|G|1162HO7|1|A|U|12
2HO7|1|B|G|1162HO7|1|B|A|117s35
2HO7|1|B|G|1162HO7|1|B|C|115s53
2HO7|1|B|G|1162HO7|1|B|G|114s33
2HO7|1|B|G|1162HO7|1|B|G|1160BPh
2HO7|1|B|G|1162HO7|1|B|G|31
2HO7|1|B|G|1202HO7|1|B|A|112s55
2HO7|1|B|G|1202HO7|1|B|C|111cWW
2HO7|1|B|G|1202HO7|1|B|G|1200BPh
2HO7|1|B|G|1202HO7|1|B|U|119s53
2HO7|1|B|G|1202HO7|1|B|U|121s35
2HO7|1|B|G|1222HO7|1|B|A|110s55
2HO7|1|B|G|1222HO7|1|B|C|109cWW
2HO7|1|B|G|1222HO7|1|B|G|1220BPh
2HO7|1|B|G|1222HO7|1|B|G|123s35
2HO7|1|B|G|1222HO7|1|B|U|121s53
2HO7|1|B|G|1232HO7|1|B|C|108cWW
2HO7|1|B|G|1232HO7|1|B|C|109s55
2HO7|1|B|G|1232HO7|1|B|C|124s35
2HO7|1|B|G|1232HO7|1|B|G|122s53
2HO7|1|B|G|1232HO7|1|B|G|1230BPh
2HO7|1|B|G|1282HO7|1|B|A|127s53
2HO7|1|B|G|1282HO7|1|B|A|129s35
2HO7|1|B|G|1282HO7|1|B|A|38
2HO7|1|B|G|1282HO7|1|B|C|52ncSS
2HO7|1|B|G|1282HO7|1|B|G|102s33
2HO7|1|B|G|1282HO7|1|B|G|1280BPh
2HO7|1|B|G|1282HO7|1|B|G|37ns35
2HO7|1|B|G|1282HO7|1|B|G|53ns55
2HO7|1|B|G|1302HO7|1|B|G|1301BPh
2HO7|1|B|G|1332HO7|1|B|A|132s53
2HO7|1|B|G|1332HO7|1|B|C|99cWW
2HO7|1|B|G|1332HO7|1|B|G|1330BPh
2HO7|1|B|G|1332HO7|1|B|U|100s55
2HO7|1|B|G|1332HO7|1|B|U|134s35
2HO7|1|B|G|1372HO7|1|B|A|95tSH
2HO7|1|B|G|1372HO7|1|B|C|136s53
2HO7|1|B|G|1372HO7|1|B|G|1370BPh
2HO7|1|B|G|1372HO7|1|B|G|94s33
2HO7|1|B|G|1372HO7|1|B|G|96ns55
2HO7|1|B|G|1382HO7|1|B|C|78ns35
2HO7|1|B|G|1382HO7|1|B|G|94s55
2HO7|1|B|G|1382HO7|1|B|U|77
2HO7|1|B|G|1392HO7|1|B|C|140s35
2HO7|1|B|G|1392HO7|1|B|C|78
2HO7|1|B|G|1392HO7|1|B|C|85cWW
2HO7|1|B|G|1392HO7|1|B|G|86s55
2HO7|1|B|G|1392HO7|1|B|U|79n0BP
2HO7|1|B|G|1422HO7|1|B|A|141s53
2HO7|1|B|G|1422HO7|1|B|C|82cWW
2HO7|1|B|G|1422HO7|1|B|G|1420BPh
2HO7|1|B|G|1422HO7|1|B|G|143s35
2HO7|1|B|G|1422HO7|1|B|U|83s55
2HO7|1|B|G|1432HO7|1|B|A|144s35
2HO7|1|B|G|1432HO7|1|B|C|81cWW
2HO7|1|B|G|1432HO7|1|B|C|82s55
2HO7|1|B|G|1432HO7|1|B|G|142s53
2HO7|1|B|G|1432HO7|1|B|G|1430BPh
2HO7|1|B|G|232HO7|1|A|A|19s55
2HO7|1|B|G|232HO7|1|A|C|18cWW
2HO7|1|B|G|232HO7|1|B|G|230BPh
2HO7|1|B|G|232HO7|1|B|G|24s35
2HO7|1|B|G|242HO7|1|A|C|17cWW
2HO7|1|B|G|242HO7|1|A|C|18s55
2HO7|1|B|G|242HO7|1|B|C|25s35
2HO7|1|B|G|242HO7|1|B|G|23s53
2HO7|1|B|G|242HO7|1|B|G|240BPh
2HO7|1|B|G|312HO7|1|A|C|10cWW
2HO7|1|B|G|312HO7|1|A|U|11s55
2HO7|1|B|G|312HO7|1|B|A|117tSS
2HO7|1|B|G|312HO7|1|B|A|30s53
2HO7|1|B|G|312HO7|1|B|U|32s35
2HO7|1|B|G|342HO7|1|A|C|5s33
2HO7|1|B|G|342HO7|1|A|G|7tSH
2HO7|1|B|G|342HO7|1|B|C|60cSH
2HO7|1|B|G|342HO7|1|B|G|340BPh
2HO7|1|B|G|342HO7|1|B|U|33s53
2HO7|1|B|G|372HO7|1|A|G|1cHH
2HO7|1|B|G|372HO7|1|B|A|104ncSS
2HO7|1|B|G|372HO7|1|B|A|127ntSW
2HO7|1|B|G|372HO7|1|B|A|38s35
2HO7|1|B|G|372HO7|1|B|C|36s53
2HO7|1|B|G|372HO7|1|B|C|52cWW
2HO7|1|B|G|372HO7|1|B|G|128ns53
2HO7|1|B|G|372HO7|1|B|G|370BPh
2HO7|1|B|G|372HO7|1|B|G|53s55
2HO7|1|B|G|392HO7|1|A|G|14BPh
2HO7|1|B|G|392HO7|1|B|A|38s53
2HO7|1|B|G|392HO7|1|B|G|390BPh
2HO7|1|B|G|392HO7|1|B|G|40s35
2HO7|1|B|G|392HO7|1|B|U|51s55
2HO7|1|B|G|402HO7|1|A|A|0
2HO7|1|B|G|402HO7|1|A|G|1n5BP
2HO7|1|B|G|402HO7|1|B|G|39s53
2HO7|1|B|G|402HO7|1|B|G|400BPh
2HO7|1|B|G|402HO7|1|B|G|66
2HO7|1|B|G|402HO7|1|B|U|67s33
2HO7|1|B|G|412HO7|1|B|U|67s551BPh
2HO7|1|B|G|442HO7|1|B|A|43s53
2HO7|1|B|G|442HO7|1|B|C|71cWW
2HO7|1|B|G|442HO7|1|B|G|440BPh
2HO7|1|B|G|442HO7|1|B|G|45s35
2HO7|1|B|G|442HO7|1|B|U|72s55
2HO7|1|B|G|452HO7|1|B|C|70cWW
2HO7|1|B|G|452HO7|1|B|C|71s55
2HO7|1|B|G|452HO7|1|B|G|44s53
2HO7|1|B|G|452HO7|1|B|G|450BPh
2HO7|1|B|G|452HO7|1|B|G|46s35
2HO7|1|B|G|462HO7|1|B|C|69cWW
2HO7|1|B|G|462HO7|1|B|C|70s55
2HO7|1|B|G|462HO7|1|B|G|45s53
2HO7|1|B|G|462HO7|1|B|G|460BPh
2HO7|1|B|G|462HO7|1|B|U|47s35
2HO7|1|B|G|532HO7|1|B|A|104ntSW
2HO7|1|B|G|532HO7|1|B|A|127ncSS
2HO7|1|B|G|532HO7|1|B|A|54s35
2HO7|1|B|G|532HO7|1|B|C|36cWW
2HO7|1|B|G|532HO7|1|B|C|52s53
2HO7|1|B|G|532HO7|1|B|G|128ns55
2HO7|1|B|G|532HO7|1|B|G|37s55
2HO7|1|B|G|532HO7|1|B|G|530BPh
2HO7|1|B|G|552HO7|1|B|A|107
2HO7|1|B|G|552HO7|1|B|A|54
2HO7|1|B|G|552HO7|1|B|G|55n1BP
2HO7|1|B|G|552HO7|1|B|U|126
2HO7|1|B|G|612HO7|1|A|C|5cWW
2HO7|1|B|G|612HO7|1|A|G|7s55
2HO7|1|B|G|612HO7|1|B|C|60s53
2HO7|1|B|G|612HO7|1|B|G|610BPh
2HO7|1|B|G|612HO7|1|B|G|62s35
2HO7|1|B|G|622HO7|1|A|C|4cWW
2HO7|1|B|G|622HO7|1|A|C|5s55
2HO7|1|B|G|622HO7|1|B|C|63s35
2HO7|1|B|G|622HO7|1|B|G|61s53
2HO7|1|B|G|622HO7|1|B|G|620BPh
2HO7|1|B|G|642HO7|1|A|C|2cWW
2HO7|1|B|G|642HO7|1|A|G|3s55
2HO7|1|B|G|642HO7|1|B|C|63s53
2HO7|1|B|G|642HO7|1|B|G|640BPh
2HO7|1|B|G|642HO7|1|B|G|65s35
2HO7|1|B|G|652HO7|1|A|A|0tSS
2HO7|1|B|G|652HO7|1|A|C|2s55
2HO7|1|B|G|652HO7|1|A|G|13BPh
2HO7|1|B|G|652HO7|1|B|G|64s53
2HO7|1|B|G|652HO7|1|B|G|650BPh
2HO7|1|B|G|652HO7|1|B|G|66s35
2HO7|1|B|G|662HO7|1|B|A|50s33
2HO7|1|B|G|662HO7|1|B|G|65s53
2HO7|1|B|G|662HO7|1|B|G|660BPh
2HO7|1|B|G|662HO7|1|B|U|48s33
2HO7|1|B|G|682HO7|1|B|A|50s55
2HO7|1|B|G|682HO7|1|B|C|69s35
2HO7|1|B|G|682HO7|1|B|G|680BPh
2HO7|1|B|G|682HO7|1|B|U|47cWW
2HO7|1|B|G|682HO7|1|B|U|48ns55
2HO7|1|B|G|732HO7|1|B|A|43s55
2HO7|1|B|G|732HO7|1|B|C|42cWW
2HO7|1|B|G|732HO7|1|B|C|74s35
2HO7|1|B|G|732HO7|1|B|G|730BPh
2HO7|1|B|G|732HO7|1|B|U|72s53
2HO7|1|B|G|752HO7|1|B|A|93tSS
2HO7|1|B|G|752HO7|1|B|C|74s53
2HO7|1|B|G|752HO7|1|B|C|89cWW
2HO7|1|B|G|752HO7|1|B|G|750BPh
2HO7|1|B|G|752HO7|1|B|G|76s35
2HO7|1|B|G|752HO7|1|B|G|90s55
2HO7|1|B|G|762HO7|1|B|A|93ns53
2HO7|1|B|G|762HO7|1|B|C|88cWW
2HO7|1|B|G|762HO7|1|B|C|89s55
2HO7|1|B|G|762HO7|1|B|G|75s53
2HO7|1|B|G|762HO7|1|B|G|760BPh
2HO7|1|B|G|762HO7|1|B|G|941BPh
2HO7|1|B|G|762HO7|1|B|U|77s35
2HO7|1|B|G|842HO7|1|B|A|141s55
2HO7|1|B|G|842HO7|1|B|C|140cWW
2HO7|1|B|G|842HO7|1|B|C|85s35
2HO7|1|B|G|842HO7|1|B|G|840BPh
2HO7|1|B|G|842HO7|1|B|U|83s53
2HO7|1|B|G|862HO7|1|B|A|87s35
2HO7|1|B|G|862HO7|1|B|C|78cWW
2HO7|1|B|G|862HO7|1|B|C|85s53
2HO7|1|B|G|862HO7|1|B|G|139s55
2HO7|1|B|G|862HO7|1|B|G|860BPh
2HO7|1|B|G|902HO7|1|B|C|42s35
2HO7|1|B|G|902HO7|1|B|C|74cWW
2HO7|1|B|G|902HO7|1|B|C|89ns53
2HO7|1|B|G|902HO7|1|B|G|75s55
2HO7|1|B|G|902HO7|1|B|G|900BPh
2HO7|1|B|G|902HO7|1|B|U|91cSH
2HO7|1|B|G|942HO7|1|B|A|95s35
2HO7|1|B|G|942HO7|1|B|G|137s33
2HO7|1|B|G|942HO7|1|B|G|138s55
2HO7|1|B|G|942HO7|1|B|G|94n0BP
2HO7|1|B|G|962HO7|1|B|A|95s53
2HO7|1|B|G|962HO7|1|B|C|136cWW
2HO7|1|B|G|962HO7|1|B|G|137ns55
2HO7|1|B|G|962HO7|1|B|G|960BPh
2HO7|1|B|G|962HO7|1|B|G|97s35
2HO7|1|B|G|972HO7|1|B|A|98s35
2HO7|1|B|G|972HO7|1|B|C|135cWW
2HO7|1|B|G|972HO7|1|B|C|136s55
2HO7|1|B|G|972HO7|1|B|G|96s53
2HO7|1|B|G|972HO7|1|B|G|970BPh
2HO7|1|B|U|1002HO7|1|B|A|132cWW
2HO7|1|B|U|1002HO7|1|B|C|99s53
2HO7|1|B|U|1002HO7|1|B|G|101s35
2HO7|1|B|U|1002HO7|1|B|G|133s55
2HO7|1|B|U|1002HO7|1|B|U|1000BPh
2HO7|1|B|U|1192HO7|1|B|A|112cWW
2HO7|1|B|U|1192HO7|1|B|C|118s53
2HO7|1|B|U|1192HO7|1|B|G|113s55
2HO7|1|B|U|1192HO7|1|B|G|120s35
2HO7|1|B|U|1192HO7|1|B|U|1190BPh
2HO7|1|B|U|1212HO7|1|B|A|110cWW
2HO7|1|B|U|1212HO7|1|B|G|120s53
2HO7|1|B|U|1212HO7|1|B|G|122s35
2HO7|1|B|U|1212HO7|1|B|U|1210BPh
2HO7|1|B|U|1262HO7|1|B|A|105tWH
2HO7|1|B|U|1262HO7|1|B|A|125s53
2HO7|1|B|U|1262HO7|1|B|G|55
2HO7|1|B|U|1262HO7|1|B|U|1260BPh
2HO7|1|B|U|1342HO7|1|B|A|98cWW
2HO7|1|B|U|1342HO7|1|B|C|135s35
2HO7|1|B|U|1342HO7|1|B|G|133s53
2HO7|1|B|U|1342HO7|1|B|U|1340BPh
2HO7|1|B|U|262HO7|1|A|A|15cWW
2HO7|1|B|U|262HO7|1|A|G|16s55
2HO7|1|B|U|262HO7|1|B|C|25s53
2HO7|1|B|U|262HO7|1|B|U|260BPh
2HO7|1|B|U|262HO7|1|B|U|27s35
2HO7|1|B|U|272HO7|1|A|A|14cWW
2HO7|1|B|U|272HO7|1|A|A|15ns55
2HO7|1|B|U|272HO7|1|B|U|26s53
2HO7|1|B|U|272HO7|1|B|U|270BPh
2HO7|1|B|U|272HO7|1|B|U|28s35
2HO7|1|B|U|282HO7|1|A|A|13cWW
2HO7|1|B|U|282HO7|1|A|A|14ns55
2HO7|1|B|U|282HO7|1|B|A|29s35
2HO7|1|B|U|282HO7|1|B|U|27s53
2HO7|1|B|U|282HO7|1|B|U|280BPh
2HO7|1|B|U|322HO7|1|A|A|9cWW
2HO7|1|B|U|322HO7|1|B|G|31s53
2HO7|1|B|U|322HO7|1|B|U|320BPh
2HO7|1|B|U|322HO7|1|B|U|33s35
2HO7|1|B|U|332HO7|1|A|A|9ns55
2HO7|1|B|U|332HO7|1|A|G|8cWW
2HO7|1|B|U|332HO7|1|B|G|34s35
2HO7|1|B|U|332HO7|1|B|U|32s53
2HO7|1|B|U|332HO7|1|B|U|330BPh
2HO7|1|B|U|472HO7|1|B|G|46s53
2HO7|1|B|U|472HO7|1|B|G|68cWW
2HO7|1|B|U|472HO7|1|B|U|470BPh
2HO7|1|B|U|472HO7|1|B|U|48s35
2HO7|1|B|U|482HO7|1|B|A|50cWH
2HO7|1|B|U|482HO7|1|B|G|66s33
2HO7|1|B|U|482HO7|1|B|G|68ns55
2HO7|1|B|U|482HO7|1|B|U|47s53
2HO7|1|B|U|482HO7|1|B|U|480BPh
2HO7|1|B|U|492HO7|1|B|U|49n0BP
2HO7|1|B|U|512HO7|1|B|A|38cWW
2HO7|1|B|U|512HO7|1|B|C|52s35
2HO7|1|B|U|512HO7|1|B|G|39s55
2HO7|1|B|U|512HO7|1|B|U|510BPh
2HO7|1|B|U|592HO7|1|B|A|35s55
2HO7|1|B|U|592HO7|1|B|A|54tWW
2HO7|1|B|U|592HO7|1|B|C|36s55
2HO7|1|B|U|592HO7|1|B|U|590BPh
2HO7|1|B|U|672HO7|1|A|A|0n9BP
2HO7|1|B|U|672HO7|1|B|G|40s33
2HO7|1|B|U|672HO7|1|B|G|41s55
2HO7|1|B|U|672HO7|1|B|U|670BPh
2HO7|1|B|U|722HO7|1|B|A|43cWW
2HO7|1|B|U|722HO7|1|B|C|71s53
2HO7|1|B|U|722HO7|1|B|G|44s55
2HO7|1|B|U|722HO7|1|B|G|73s35
2HO7|1|B|U|722HO7|1|B|U|720BPh
2HO7|1|B|U|772HO7|1|B|A|87cWW
2HO7|1|B|U|772HO7|1|B|C|78s35
2HO7|1|B|U|772HO7|1|B|G|138
2HO7|1|B|U|772HO7|1|B|G|76s53
2HO7|1|B|U|772HO7|1|B|U|770BPh
2HO7|1|B|U|792HO7|1|B|C|82ncSH
2HO7|1|B|U|792HO7|1|B|U|79n0BP
2HO7|1|B|U|802HO7|1|B|A|144cWW
2HO7|1|B|U|802HO7|1|B|C|81s35
2HO7|1|B|U|802HO7|1|B|U|800BPh
2HO7|1|B|U|832HO7|1|B|A|141cWW
2HO7|1|B|U|832HO7|1|B|C|82s53
2HO7|1|B|U|832HO7|1|B|G|142s55
2HO7|1|B|U|832HO7|1|B|G|84s35
2HO7|1|B|U|832HO7|1|B|U|830BPh
2HO7|1|B|U|912HO7|1|B|A|93s55
2HO7|1|B|U|912HO7|1|B|G|90cHS
2HO7|1|B|U|912HO7|1|B|U|910BPh
2HO7|1|B|U|922HO7|1|B|U|920BPh


Base-PairsCount (64)Relative Frequency
cWW480.750
tWW10.016
cWH10.016
tWH30.047
cHH10.016
cHS30.047
tHS20.031
cSS20.031
tSS30.047
Base-PhosphateCount (136)Relative Frequency
1BPh30.022
3BPh20.015
4BPh20.015
6BPh10.007
7BPh30.022
8BPh10.007
9BPh20.015
0BPh1220.897
Base-StackingCount (85)Relative Frequency
s3380.094
s53360.424
s55410.482

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)