A Portal for Three-dimensional Structural Information about Nucleic Acids
As of 1-Apr-2020 number of released structures: 10687
Search for released structures

NDB ID: 2JYH  PDB ID: 2JYH 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
2JYH|1|A|A|102JYH|1|A|A|100BPh
2JYH|1|A|A|102JYH|1|A|A|11s35
2JYH|1|A|A|102JYH|1|A|G|9s53
2JYH|1|A|A|102JYH|1|A|U|33cWW
2JYH|1|A|A|112JYH|1|A|A|10s53
2JYH|1|A|A|112JYH|1|A|A|110BPh
2JYH|1|A|A|112JYH|1|A|G|12s35
2JYH|1|A|A|112JYH|1|A|U|32cWW
2JYH|1|A|A|112JYH|1|A|U|33ns55
2JYH|1|A|A|132JYH|1|A|A|130BPh
2JYH|1|A|A|132JYH|1|A|A|14s35
2JYH|1|A|A|132JYH|1|A|G|12s53
2JYH|1|A|A|132JYH|1|A|U|30cWW
2JYH|1|A|A|142JYH|1|A|A|13s53
2JYH|1|A|A|142JYH|1|A|A|140BPh
2JYH|1|A|A|142JYH|1|A|C|15s35
2JYH|1|A|A|142JYH|1|A|U|29cWW
2JYH|1|A|A|212JYH|1|A|A|210BPh
2JYH|1|A|A|212JYH|1|A|A|22s35
2JYH|1|A|A|212JYH|1|B|A|49tWW
2JYH|1|A|A|212JYH|1|B|A|81ns55
2JYH|1|A|A|212JYH|1|B|G|51ns35
2JYH|1|A|A|212JYH|1|B|U|79ncWS
2JYH|1|A|A|222JYH|1|A|A|21s53
2JYH|1|A|A|222JYH|1|A|A|220BPh
2JYH|1|A|A|222JYH|1|A|A|23s35
2JYH|1|A|A|222JYH|1|A|G|20
2JYH|1|A|A|222JYH|1|B|G|51
2JYH|1|A|A|222JYH|1|B|U|79ncSS
2JYH|1|A|A|232JYH|1|A|A|22s53
2JYH|1|A|A|232JYH|1|A|A|230BPh
2JYH|1|A|A|232JYH|1|A|C|24s35
2JYH|1|A|A|232JYH|1|A|G|20tHS
2JYH|1|A|A|232JYH|1|B|C|78cSS
2JYH|1|A|A|232JYH|1|B|G|51tSS
2JYH|1|A|A|372JYH|1|A|A|370BPh
2JYH|1|A|A|372JYH|1|A|A|38cSH
2JYH|1|A|A|372JYH|1|A|A|6s55
2JYH|1|A|A|372JYH|1|A|U|36s53
2JYH|1|A|A|372JYH|1|A|U|5ns33
2JYH|1|A|A|382JYH|1|A|A|37cHS
2JYH|1|A|A|382JYH|1|A|A|380BPh
2JYH|1|A|A|382JYH|1|A|G|39ns35
2JYH|1|A|A|382JYH|1|B|A|64s55
2JYH|1|A|A|42JYH|1|A|A|40BPh
2JYH|1|A|A|42JYH|1|A|G|3s53
2JYH|1|A|A|42JYH|1|A|U|40cWW
2JYH|1|A|A|42JYH|1|A|U|5s35
2JYH|1|A|A|62JYH|1|A|A|37s55
2JYH|1|A|A|62JYH|1|A|A|6n0BP
2JYH|1|A|A|62JYH|1|A|G|8s35
2JYH|1|A|A|62JYH|1|A|U|36tHW
2JYH|1|A|A|62JYH|1|A|U|7ns33
2JYH|1|A|A|62JYH|1|B|A|64ntWW
2JYH|1|A|C|152JYH|1|A|A|14s53
2JYH|1|A|C|152JYH|1|A|C|150BPh
2JYH|1|A|C|152JYH|1|A|C|16s35
2JYH|1|A|C|152JYH|1|A|G|28cWW
2JYH|1|A|C|162JYH|1|A|C|15s53
2JYH|1|A|C|162JYH|1|A|C|160BPh
2JYH|1|A|C|162JYH|1|A|G|27cWW
2JYH|1|A|C|162JYH|1|A|G|28ns55
2JYH|1|A|C|242JYH|1|A|A|23s53
2JYH|1|A|C|242JYH|1|A|C|240BPh
2JYH|1|A|C|242JYH|1|A|G|19cWW
2JYH|1|A|C|242JYH|1|A|G|20ns55
2JYH|1|A|C|242JYH|1|A|U|25s35
2JYH|1|A|C|312JYH|1|A|C|310BPh
2JYH|1|A|C|312JYH|1|A|G|12cWW
2JYH|1|A|C|312JYH|1|A|U|30s53
2JYH|1|A|C|312JYH|1|A|U|32s35
2JYH|1|A|C|342JYH|1|A|C|35ns35
2JYH|1|A|C|342JYH|1|A|G|9cWW
2JYH|1|A|C|342JYH|1|A|U|33s53
2JYH|1|A|C|352JYH|1|A|C|34ns53
2JYH|1|A|C|352JYH|1|A|C|350BPh
2JYH|1|A|C|352JYH|1|A|G|8cWW
2JYH|1|A|C|352JYH|1|A|G|9s55
2JYH|1|A|C|352JYH|1|A|U|36s35
2JYH|1|A|C|412JYH|1|A|C|410BPh
2JYH|1|A|C|412JYH|1|A|C|42s35
2JYH|1|A|C|412JYH|1|A|G|3cWW
2JYH|1|A|C|412JYH|1|A|U|40s53
2JYH|1|A|C|422JYH|1|A|C|41s53
2JYH|1|A|C|422JYH|1|A|C|420BPh
2JYH|1|A|C|422JYH|1|A|G|2cWW
2JYH|1|A|C|422JYH|1|A|U|43s35
2JYH|1|A|G|12JYH|1|A|G|10BPh
2JYH|1|A|G|12JYH|1|A|G|2s35
2JYH|1|A|G|12JYH|1|A|U|43cWW
2JYH|1|A|G|122JYH|1|A|A|11s53
2JYH|1|A|G|122JYH|1|A|A|13s35
2JYH|1|A|G|122JYH|1|A|C|31cWW
2JYH|1|A|G|122JYH|1|A|G|120BPh
2JYH|1|A|G|122JYH|1|A|U|32ns55
2JYH|1|A|G|172JYH|1|A|C|16
2JYH|1|A|G|172JYH|1|A|G|170BPh
2JYH|1|A|G|172JYH|1|A|G|18s35
2JYH|1|A|G|172JYH|1|A|G|27s55
2JYH|1|A|G|172JYH|1|A|U|26cWW
2JYH|1|A|G|182JYH|1|A|G|17s53
2JYH|1|A|G|182JYH|1|A|G|180BPh
2JYH|1|A|G|182JYH|1|A|G|19s35
2JYH|1|A|G|182JYH|1|A|U|25cWW
2JYH|1|A|G|182JYH|1|A|U|26ns55
2JYH|1|A|G|192JYH|1|A|C|24cWW
2JYH|1|A|G|192JYH|1|A|G|18s53
2JYH|1|A|G|192JYH|1|A|G|190BPh
2JYH|1|A|G|192JYH|1|A|G|20s35
2JYH|1|A|G|22JYH|1|A|C|42cWW
2JYH|1|A|G|22JYH|1|A|G|1s53
2JYH|1|A|G|22JYH|1|A|G|20BPh
2JYH|1|A|G|22JYH|1|A|G|3ns35
2JYH|1|A|G|22JYH|1|A|U|43s55
2JYH|1|A|G|202JYH|1|A|A|23tSH
2JYH|1|A|G|202JYH|1|A|C|24ns55
2JYH|1|A|G|202JYH|1|A|G|19s53
2JYH|1|A|G|202JYH|1|A|G|20n0BP
2JYH|1|A|G|272JYH|1|A|C|16cWW
2JYH|1|A|G|272JYH|1|A|G|17s55
2JYH|1|A|G|272JYH|1|A|G|270BPh
2JYH|1|A|G|272JYH|1|A|G|28s35
2JYH|1|A|G|272JYH|1|A|U|26ns53
2JYH|1|A|G|282JYH|1|A|C|15cWW
2JYH|1|A|G|282JYH|1|A|C|16ns55
2JYH|1|A|G|282JYH|1|A|G|27s53
2JYH|1|A|G|282JYH|1|A|G|280BPh
2JYH|1|A|G|282JYH|1|A|U|29s35
2JYH|1|A|G|32JYH|1|A|A|4s35
2JYH|1|A|G|32JYH|1|A|C|41cWW
2JYH|1|A|G|32JYH|1|A|G|2ns53
2JYH|1|A|G|32JYH|1|A|G|30BPh
2JYH|1|A|G|392JYH|1|A|A|38ns53
2JYH|1|A|G|392JYH|1|A|G|390BPh
2JYH|1|A|G|392JYH|1|A|U|40ns35
2JYH|1|A|G|392JYH|1|A|U|5cWW
2JYH|1|A|G|82JYH|1|A|A|6s53
2JYH|1|A|G|82JYH|1|A|C|35cWW
2JYH|1|A|G|82JYH|1|A|G|80BPh
2JYH|1|A|G|82JYH|1|A|G|9s35
2JYH|1|A|G|82JYH|1|A|U|36s55
2JYH|1|A|G|82JYH|1|B|A|66tSS
2JYH|1|A|G|92JYH|1|A|A|10s35
2JYH|1|A|G|92JYH|1|A|C|34cWW
2JYH|1|A|G|92JYH|1|A|C|35s55
2JYH|1|A|G|92JYH|1|A|G|8s53
2JYH|1|A|G|92JYH|1|A|G|90BPh
2JYH|1|A|G|92JYH|1|A|U|7ns55
2JYH|1|A|U|252JYH|1|A|C|24s53
2JYH|1|A|U|252JYH|1|A|G|18cWW
2JYH|1|A|U|252JYH|1|A|U|250BPh
2JYH|1|A|U|252JYH|1|A|U|26s35
2JYH|1|A|U|262JYH|1|A|G|17cWW
2JYH|1|A|U|262JYH|1|A|G|18ns55
2JYH|1|A|U|262JYH|1|A|G|27ns35
2JYH|1|A|U|262JYH|1|A|U|25s53
2JYH|1|A|U|262JYH|1|A|U|260BPh
2JYH|1|A|U|292JYH|1|A|A|14cWW
2JYH|1|A|U|292JYH|1|A|G|28s53
2JYH|1|A|U|292JYH|1|A|U|290BPh
2JYH|1|A|U|292JYH|1|A|U|30s35
2JYH|1|A|U|302JYH|1|A|A|13cWW
2JYH|1|A|U|302JYH|1|A|C|31s35
2JYH|1|A|U|302JYH|1|A|U|29s53
2JYH|1|A|U|302JYH|1|A|U|300BPh
2JYH|1|A|U|322JYH|1|A|A|11cWW
2JYH|1|A|U|322JYH|1|A|C|31s53
2JYH|1|A|U|322JYH|1|A|G|12ns55
2JYH|1|A|U|322JYH|1|A|U|320BPh
2JYH|1|A|U|322JYH|1|A|U|33s35
2JYH|1|A|U|332JYH|1|A|A|10cWW
2JYH|1|A|U|332JYH|1|A|A|11ns55
2JYH|1|A|U|332JYH|1|A|C|34s35
2JYH|1|A|U|332JYH|1|A|U|32s53
2JYH|1|A|U|332JYH|1|A|U|330BPh
2JYH|1|A|U|362JYH|1|A|A|37s35
2JYH|1|A|U|362JYH|1|A|A|6tWH
2JYH|1|A|U|362JYH|1|A|C|35s53
2JYH|1|A|U|362JYH|1|A|G|8s55
2JYH|1|A|U|402JYH|1|A|A|4cWW
2JYH|1|A|U|402JYH|1|A|C|41s35
2JYH|1|A|U|402JYH|1|A|G|39ns53
2JYH|1|A|U|402JYH|1|A|U|400BPh
2JYH|1|A|U|432JYH|1|A|C|42s53
2JYH|1|A|U|432JYH|1|A|G|1cWW
2JYH|1|A|U|432JYH|1|A|G|2s55
2JYH|1|A|U|432JYH|1|A|U|43n0BP
2JYH|1|A|U|52JYH|1|A|A|37ns33
2JYH|1|A|U|52JYH|1|A|A|4s53
2JYH|1|A|U|52JYH|1|A|G|39cWW
2JYH|1|A|U|52JYH|1|A|U|50BPh
2JYH|1|A|U|72JYH|1|A|A|6ns33
2JYH|1|A|U|72JYH|1|A|G|9ns55
2JYH|1|B|A|472JYH|1|B|A|470BPh
2JYH|1|B|A|472JYH|1|B|G|46s53
2JYH|1|B|A|472JYH|1|B|U|48s35
2JYH|1|B|A|472JYH|1|B|U|83cWW
2JYH|1|B|A|492JYH|1|A|A|21tWW
2JYH|1|B|A|492JYH|1|B|A|49n0BP
2JYH|1|B|A|492JYH|1|B|A|80s55
2JYH|1|B|A|492JYH|1|B|G|51s35
2JYH|1|B|A|492JYH|1|B|U|50ns33
2JYH|1|B|A|492JYH|1|B|U|79tHW
2JYH|1|B|A|532JYH|1|B|A|530BPh
2JYH|1|B|A|532JYH|1|B|A|54s35
2JYH|1|B|A|532JYH|1|B|G|52s53
2JYH|1|B|A|532JYH|1|B|U|76cWW
2JYH|1|B|A|542JYH|1|B|A|53s53
2JYH|1|B|A|542JYH|1|B|A|540BPh
2JYH|1|B|A|542JYH|1|B|G|55s35
2JYH|1|B|A|542JYH|1|B|U|75cWW
2JYH|1|B|A|542JYH|1|B|U|76ns55
2JYH|1|B|A|562JYH|1|B|A|560BPh
2JYH|1|B|A|562JYH|1|B|A|57s35
2JYH|1|B|A|562JYH|1|B|G|55s53
2JYH|1|B|A|562JYH|1|B|U|73cWW
2JYH|1|B|A|572JYH|1|B|A|56s53
2JYH|1|B|A|572JYH|1|B|A|570BPh
2JYH|1|B|A|572JYH|1|B|C|58s35
2JYH|1|B|A|572JYH|1|B|U|72cWW
2JYH|1|B|A|642JYH|1|A|A|37
2JYH|1|B|A|642JYH|1|A|A|38s55
2JYH|1|B|A|642JYH|1|A|A|6ntWW
2JYH|1|B|A|642JYH|1|A|G|8
2JYH|1|B|A|642JYH|1|B|A|640BPh
2JYH|1|B|A|642JYH|1|B|A|65s35
2JYH|1|B|A|652JYH|1|A|G|8
2JYH|1|B|A|652JYH|1|B|A|64s53
2JYH|1|B|A|652JYH|1|B|A|650BPh
2JYH|1|B|A|652JYH|1|B|A|66s35
2JYH|1|B|A|652JYH|1|B|G|63
2JYH|1|B|A|662JYH|1|A|G|8tSS
2JYH|1|B|A|662JYH|1|A|G|9
2JYH|1|B|A|662JYH|1|B|A|65s53
2JYH|1|B|A|662JYH|1|B|A|660BPh
2JYH|1|B|A|662JYH|1|B|C|67s35
2JYH|1|B|A|662JYH|1|B|G|63tHS
2JYH|1|B|A|802JYH|1|B|A|49s55
2JYH|1|B|A|802JYH|1|B|A|800BPh
2JYH|1|B|A|802JYH|1|B|A|81cSH
2JYH|1|B|A|802JYH|1|B|U|48ns33
2JYH|1|B|A|802JYH|1|B|U|79s53
2JYH|1|B|A|812JYH|1|A|A|21ns55
2JYH|1|B|A|812JYH|1|B|A|80cHS
2JYH|1|B|A|812JYH|1|B|A|810BPh
2JYH|1|B|A|812JYH|1|B|G|82ns35
2JYH|1|B|C|582JYH|1|B|A|57s53
2JYH|1|B|C|582JYH|1|B|C|580BPh
2JYH|1|B|C|582JYH|1|B|C|59s35
2JYH|1|B|C|582JYH|1|B|G|71cWW
2JYH|1|B|C|592JYH|1|B|C|58s53
2JYH|1|B|C|592JYH|1|B|C|590BPh
2JYH|1|B|C|592JYH|1|B|G|60ns35
2JYH|1|B|C|592JYH|1|B|G|70cWW
2JYH|1|B|C|592JYH|1|B|G|71ns55
2JYH|1|B|C|672JYH|1|B|A|66s53
2JYH|1|B|C|672JYH|1|B|C|670BPh
2JYH|1|B|C|672JYH|1|B|G|62cWW
2JYH|1|B|C|672JYH|1|B|G|63ns55
2JYH|1|B|C|672JYH|1|B|U|68s35
2JYH|1|B|C|742JYH|1|B|C|740BPh
2JYH|1|B|C|742JYH|1|B|G|55cWW
2JYH|1|B|C|742JYH|1|B|U|73s53
2JYH|1|B|C|742JYH|1|B|U|75s35
2JYH|1|B|C|772JYH|1|B|C|78ns35
2JYH|1|B|C|772JYH|1|B|G|52cWW
2JYH|1|B|C|772JYH|1|B|U|76s53
2JYH|1|B|C|782JYH|1|A|A|23cSS
2JYH|1|B|C|782JYH|1|B|C|77ns53
2JYH|1|B|C|782JYH|1|B|C|780BPh
2JYH|1|B|C|782JYH|1|B|G|51cWW
2JYH|1|B|C|782JYH|1|B|G|52s55
2JYH|1|B|C|782JYH|1|B|U|79s35
2JYH|1|B|C|842JYH|1|B|C|840BPh
2JYH|1|B|C|842JYH|1|B|C|85s35
2JYH|1|B|C|842JYH|1|B|G|46cWW
2JYH|1|B|C|842JYH|1|B|U|83s53
2JYH|1|B|C|852JYH|1|B|C|84s53
2JYH|1|B|C|852JYH|1|B|C|850BPh
2JYH|1|B|C|852JYH|1|B|G|45cWW
2JYH|1|B|C|852JYH|1|B|U|86s35
2JYH|1|B|G|442JYH|1|B|G|440BPh
2JYH|1|B|G|442JYH|1|B|G|45s35
2JYH|1|B|G|442JYH|1|B|U|86cWW
2JYH|1|B|G|452JYH|1|B|C|85cWW
2JYH|1|B|G|452JYH|1|B|G|44s53
2JYH|1|B|G|452JYH|1|B|G|450BPh
2JYH|1|B|G|452JYH|1|B|G|46ns35
2JYH|1|B|G|452JYH|1|B|U|86s55
2JYH|1|B|G|462JYH|1|B|A|47s35
2JYH|1|B|G|462JYH|1|B|C|84cWW
2JYH|1|B|G|462JYH|1|B|G|45ns53
2JYH|1|B|G|462JYH|1|B|G|460BPh
2JYH|1|B|G|512JYH|1|A|A|21ns53
2JYH|1|B|G|512JYH|1|A|A|22
2JYH|1|B|G|512JYH|1|A|A|23tSS
2JYH|1|B|G|512JYH|1|B|A|49s53
2JYH|1|B|G|512JYH|1|B|C|78cWW
2JYH|1|B|G|512JYH|1|B|G|510BPh
2JYH|1|B|G|512JYH|1|B|G|52s35
2JYH|1|B|G|512JYH|1|B|U|79s55
2JYH|1|B|G|522JYH|1|B|A|53s35
2JYH|1|B|G|522JYH|1|B|C|77cWW
2JYH|1|B|G|522JYH|1|B|C|78s55
2JYH|1|B|G|522JYH|1|B|G|51s53
2JYH|1|B|G|522JYH|1|B|G|520BPh
2JYH|1|B|G|522JYH|1|B|U|50ns55
2JYH|1|B|G|552JYH|1|B|A|54s53
2JYH|1|B|G|552JYH|1|B|A|56s35
2JYH|1|B|G|552JYH|1|B|C|74cWW
2JYH|1|B|G|552JYH|1|B|G|550BPh
2JYH|1|B|G|552JYH|1|B|U|75ns55
2JYH|1|B|G|602JYH|1|B|C|59ns53
2JYH|1|B|G|602JYH|1|B|G|600BPh
2JYH|1|B|G|602JYH|1|B|G|61s35
2JYH|1|B|G|602JYH|1|B|G|70s55
2JYH|1|B|G|602JYH|1|B|U|69cWW
2JYH|1|B|G|612JYH|1|B|G|60s53
2JYH|1|B|G|612JYH|1|B|G|610BPh
2JYH|1|B|G|612JYH|1|B|G|62s35
2JYH|1|B|G|612JYH|1|B|U|68cWW
2JYH|1|B|G|612JYH|1|B|U|69ns55
2JYH|1|B|G|622JYH|1|B|C|67cWW
2JYH|1|B|G|622JYH|1|B|G|61s53
2JYH|1|B|G|622JYH|1|B|G|620BPh
2JYH|1|B|G|622JYH|1|B|G|63s35
2JYH|1|B|G|632JYH|1|B|A|66tSH
2JYH|1|B|G|632JYH|1|B|C|67ns55
2JYH|1|B|G|632JYH|1|B|G|62s53
2JYH|1|B|G|632JYH|1|B|G|63n0BP
2JYH|1|B|G|702JYH|1|B|C|59cWW
2JYH|1|B|G|702JYH|1|B|G|60s55
2JYH|1|B|G|702JYH|1|B|G|700BPh
2JYH|1|B|G|702JYH|1|B|G|71s35
2JYH|1|B|G|702JYH|1|B|U|69ns53
2JYH|1|B|G|712JYH|1|B|C|58cWW
2JYH|1|B|G|712JYH|1|B|C|59ns55
2JYH|1|B|G|712JYH|1|B|G|70s53
2JYH|1|B|G|712JYH|1|B|G|710BPh
2JYH|1|B|G|712JYH|1|B|U|72s35
2JYH|1|B|G|822JYH|1|B|A|81ns53
2JYH|1|B|G|822JYH|1|B|G|820BPh
2JYH|1|B|G|822JYH|1|B|U|48cWW
2JYH|1|B|G|822JYH|1|B|U|83ns35
2JYH|1|B|U|482JYH|1|B|A|47s53
2JYH|1|B|U|482JYH|1|B|A|80ns33
2JYH|1|B|U|482JYH|1|B|G|82cWW
2JYH|1|B|U|482JYH|1|B|U|480BPh
2JYH|1|B|U|502JYH|1|B|A|49ns33
2JYH|1|B|U|502JYH|1|B|G|52ns55
2JYH|1|B|U|682JYH|1|B|C|67s53
2JYH|1|B|U|682JYH|1|B|G|61cWW
2JYH|1|B|U|682JYH|1|B|U|680BPh
2JYH|1|B|U|682JYH|1|B|U|69s35
2JYH|1|B|U|692JYH|1|B|G|60cWW
2JYH|1|B|U|692JYH|1|B|G|61ns55
2JYH|1|B|U|692JYH|1|B|G|70ns35
2JYH|1|B|U|692JYH|1|B|U|68s53
2JYH|1|B|U|692JYH|1|B|U|690BPh
2JYH|1|B|U|722JYH|1|B|A|57cWW
2JYH|1|B|U|722JYH|1|B|G|71s53
2JYH|1|B|U|722JYH|1|B|U|720BPh
2JYH|1|B|U|722JYH|1|B|U|73s35
2JYH|1|B|U|732JYH|1|B|A|56cWW
2JYH|1|B|U|732JYH|1|B|C|74s35
2JYH|1|B|U|732JYH|1|B|U|72s53
2JYH|1|B|U|732JYH|1|B|U|730BPh
2JYH|1|B|U|752JYH|1|B|A|54cWW
2JYH|1|B|U|752JYH|1|B|C|74s53
2JYH|1|B|U|752JYH|1|B|G|55ns55
2JYH|1|B|U|752JYH|1|B|U|750BPh
2JYH|1|B|U|752JYH|1|B|U|76s35
2JYH|1|B|U|762JYH|1|B|A|53cWW
2JYH|1|B|U|762JYH|1|B|A|54ns55
2JYH|1|B|U|762JYH|1|B|C|77s35
2JYH|1|B|U|762JYH|1|B|U|75s53
2JYH|1|B|U|762JYH|1|B|U|760BPh
2JYH|1|B|U|792JYH|1|A|A|21ncSW
2JYH|1|B|U|792JYH|1|A|A|22ncSS
2JYH|1|B|U|792JYH|1|B|A|49tWH
2JYH|1|B|U|792JYH|1|B|A|80s35
2JYH|1|B|U|792JYH|1|B|C|78s53
2JYH|1|B|U|792JYH|1|B|G|51s55
2JYH|1|B|U|832JYH|1|B|A|47cWW
2JYH|1|B|U|832JYH|1|B|C|84s35
2JYH|1|B|U|832JYH|1|B|G|82ns53
2JYH|1|B|U|832JYH|1|B|U|830BPh
2JYH|1|B|U|862JYH|1|B|C|85s53
2JYH|1|B|U|862JYH|1|B|G|44cWW
2JYH|1|B|U|862JYH|1|B|G|45s55
2JYH|1|B|U|862JYH|1|B|U|86n0BP


Base-PairsCount (44)Relative Frequency
cWW340.773
tWW10.023
tWH20.045
cHS20.045
tHS20.045
cSS10.023
tSS20.045
Base-PhosphateCount (74)Relative Frequency
0BPh741.000
Base-StackingCount (25)Relative Frequency
s53140.560
s55110.440

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)