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NDB ID: 2KY0  PDB ID: 2KY0 

RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
2KY0|1|A|A|112KY0|1|A|A|110BPh
2KY0|1|A|A|112KY0|1|A|C|10s53
2KY0|1|A|A|112KY0|1|B|G|12s55n2BP
2KY0|1|A|A|22KY0|1|A|A|20BPh
2KY0|1|A|A|22KY0|1|A|C|3s35
2KY0|1|A|A|22KY0|1|A|G|1s53
2KY0|1|A|A|22KY0|1|B|C|21s55
2KY0|1|A|A|22KY0|1|B|U|20cWW
2KY0|1|A|A|52KY0|1|A|A|50BPh
2KY0|1|A|A|52KY0|1|A|G|4s53
2KY0|1|A|A|52KY0|1|A|G|6s35
2KY0|1|A|A|52KY0|1|B|G|17cWW
2KY0|1|A|C|102KY0|1|A|A|11s35
2KY0|1|A|C|102KY0|1|A|C|100BPh
2KY0|1|A|C|102KY0|1|A|U|9s53
2KY0|1|A|C|102KY0|1|B|A|13s55
2KY0|1|A|C|102KY0|1|B|G|12cWW
2KY0|1|A|C|32KY0|1|A|A|2s53
2KY0|1|A|C|32KY0|1|A|C|30BPh
2KY0|1|A|C|32KY0|1|A|G|4s35
2KY0|1|A|C|32KY0|1|B|G|19cWW
2KY0|1|A|C|72KY0|1|A|C|70BPh
2KY0|1|A|C|72KY0|1|A|G|6s53
2KY0|1|A|C|72KY0|1|A|G|8ns35
2KY0|1|A|C|72KY0|1|B|G|15cWW
2KY0|1|A|G|12KY0|1|A|A|2s35
2KY0|1|A|G|12KY0|1|A|G|10BPh
2KY0|1|A|G|12KY0|1|B|A|22s55
2KY0|1|A|G|12KY0|1|B|C|21cWW
2KY0|1|A|G|42KY0|1|A|A|5s35
2KY0|1|A|G|42KY0|1|A|C|3s53
2KY0|1|A|G|42KY0|1|A|G|40BPh
2KY0|1|A|G|42KY0|1|B|C|18cWW
2KY0|1|A|G|42KY0|1|B|G|19s55
2KY0|1|A|G|62KY0|1|A|A|5s53
2KY0|1|A|G|62KY0|1|A|C|7s35
2KY0|1|A|G|62KY0|1|B|A|16cWW
2KY0|1|A|G|62KY0|1|B|G|17s55
2KY0|1|A|G|82KY0|1|A|C|7ns53
2KY0|1|A|G|82KY0|1|A|G|80BPh
2KY0|1|A|G|82KY0|1|A|U|9s35
2KY0|1|A|G|82KY0|1|B|C|14cWW
2KY0|1|A|G|82KY0|1|B|G|15s55
2KY0|1|A|U|92KY0|1|A|C|10s35
2KY0|1|A|U|92KY0|1|A|G|8s53
2KY0|1|A|U|92KY0|1|A|U|90BPh
2KY0|1|A|U|92KY0|1|B|A|13cWW
2KY0|1|B|A|132KY0|1|A|C|10s55
2KY0|1|B|A|132KY0|1|A|U|9cWW
2KY0|1|B|A|132KY0|1|B|A|130BPh
2KY0|1|B|A|132KY0|1|B|C|14s35
2KY0|1|B|A|132KY0|1|B|G|12s53
2KY0|1|B|A|162KY0|1|A|G|6cWW
2KY0|1|B|A|162KY0|1|B|A|160BPh
2KY0|1|B|A|162KY0|1|B|G|15s53
2KY0|1|B|A|162KY0|1|B|G|17s35
2KY0|1|B|A|222KY0|1|A|G|1s55
2KY0|1|B|A|222KY0|1|B|A|220BPh
2KY0|1|B|A|222KY0|1|B|C|21s53
2KY0|1|B|C|142KY0|1|A|G|8cWW
2KY0|1|B|C|142KY0|1|B|A|13s53
2KY0|1|B|C|142KY0|1|B|C|140BPh
2KY0|1|B|C|142KY0|1|B|G|15s35
2KY0|1|B|C|182KY0|1|A|G|4cWW
2KY0|1|B|C|182KY0|1|B|C|180BPh
2KY0|1|B|C|182KY0|1|B|G|17s53
2KY0|1|B|C|182KY0|1|B|G|19s35
2KY0|1|B|C|212KY0|1|A|A|2s55
2KY0|1|B|C|212KY0|1|A|G|1cWW
2KY0|1|B|C|212KY0|1|B|A|22s35
2KY0|1|B|C|212KY0|1|B|C|210BPh
2KY0|1|B|C|212KY0|1|B|U|20s53
2KY0|1|B|G|122KY0|1|A|A|11s55
2KY0|1|B|G|122KY0|1|A|C|10cWW
2KY0|1|B|G|122KY0|1|B|A|13s35
2KY0|1|B|G|122KY0|1|B|G|120BPh
2KY0|1|B|G|152KY0|1|A|C|7cWW
2KY0|1|B|G|152KY0|1|A|G|8s55
2KY0|1|B|G|152KY0|1|B|A|16s35
2KY0|1|B|G|152KY0|1|B|C|14s53
2KY0|1|B|G|152KY0|1|B|G|150BPh
2KY0|1|B|G|172KY0|1|A|A|5cWW
2KY0|1|B|G|172KY0|1|A|G|6s55
2KY0|1|B|G|172KY0|1|B|A|16s53
2KY0|1|B|G|172KY0|1|B|C|18s35
2KY0|1|B|G|192KY0|1|A|C|3cWW
2KY0|1|B|G|192KY0|1|A|G|4s55
2KY0|1|B|G|192KY0|1|B|C|18s53
2KY0|1|B|G|192KY0|1|B|G|190BPh
2KY0|1|B|G|192KY0|1|B|U|20s35
2KY0|1|B|U|202KY0|1|A|A|2cWW
2KY0|1|B|U|202KY0|1|B|C|21s35
2KY0|1|B|U|202KY0|1|B|G|19s53
2KY0|1|B|U|202KY0|1|B|U|200BPh


Base-PairsCount (10)Relative Frequency
cWW101.000
Base-PhosphateCount (20)Relative Frequency
0BPh201.000
Base-StackingCount (17)Relative Frequency
s53100.588
s5570.412

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)

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