NDB ID: 2KYE PDB ID: 2KYE 
RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions
CSV FormatNucleotide 1 | Nucleotide 2 | Base-Pairs | Base-Stacking | Base-Phosphate |
---|
2KYE|1|A|A|2 | 2KYE|1|A|A|2 | | | 0BPh |
2KYE|1|A|A|2 | 2KYE|1|A|G|1 | | ns53 | |
2KYE|1|A|A|2 | 2KYE|1|A|G|3 | | s35 | |
2KYE|1|A|A|4 | 2KYE|1|A|A|4 | | | 0BPh |
2KYE|1|A|A|4 | 2KYE|1|A|G|3 | | s53 | |
2KYE|1|A|A|4 | 2KYE|1|A|G|5 | | s35 | |
2KYE|1|A|C|11 | 2KYE|1|A|C|11 | | | 0BPh |
2KYE|1|A|C|11 | 2KYE|1|A|G|10 | | s53 | |
2KYE|1|A|C|11 | 2KYE|1|A|G|5 | cWW | | |
2KYE|1|A|C|13 | 2KYE|1|A|C|13 | | | 0BPh |
2KYE|1|A|C|13 | 2KYE|1|A|G|3 | cWW | | |
2KYE|1|A|C|15 | 2KYE|1|A|C|15 | | | 0BPh |
2KYE|1|A|C|15 | 2KYE|1|A|G|1 | cWW | | |
2KYE|1|A|G|1 | 2KYE|1|A|A|2 | | ns35 | |
2KYE|1|A|G|1 | 2KYE|1|A|C|15 | cWW | | |
2KYE|1|A|G|1 | 2KYE|1|A|G|1 | | | 0BPh |
2KYE|1|A|G|10 | 2KYE|1|A|C|11 | | s35 | |
2KYE|1|A|G|10 | 2KYE|1|A|G|10 | | | 0BPh |
2KYE|1|A|G|10 | 2KYE|1|A|G|9 | | s55 | |
2KYE|1|A|G|3 | 2KYE|1|A|A|2 | | s53 | |
2KYE|1|A|G|3 | 2KYE|1|A|A|4 | | s35 | |
2KYE|1|A|G|3 | 2KYE|1|A|C|13 | cWW | | |
2KYE|1|A|G|3 | 2KYE|1|A|G|3 | | | 0BPh |
2KYE|1|A|G|5 | 2KYE|1|A|A|4 | | s53 | |
2KYE|1|A|G|5 | 2KYE|1|A|C|11 | cWW | | |
2KYE|1|A|G|5 | 2KYE|1|A|G|5 | | | 0BPh |
2KYE|1|A|G|8 | 2KYE|1|A|G|8 | | | n0BP |
2KYE|1|A|G|9 | 2KYE|1|A|G|10 | | s55 | n1BP |
2KYE|1|A|G|9 | 2KYE|1|A|G|8 | | | 5BPh |
Base-Pairs | Count (3) | Relative Frequency |
---|
cWW | 3 | 1.000 |
Base-Phosphate | Count (10) | Relative Frequency |
---|
5BPh | 1 | 0.100 |
0BPh | 9 | 0.900 |
Base-Stacking | Count (3) | Relative Frequency |
---|
s53 | 2 | 0.667 |
s55 | 1 | 0.333 |