NDB ID: 2L6I PDB ID: 2L6I 
RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions
CSV FormatNucleotide 1 | Nucleotide 2 | Base-Pairs | Base-Stacking | Base-Phosphate |
---|
2L6I|1|A|A|43 | 2L6I|1|A|A|43 | | | 0BPh |
2L6I|1|A|A|43 | 2L6I|1|A|C|56 | | ns55 | |
2L6I|1|A|A|43 | 2L6I|1|A|G|42 | | s53 | |
2L6I|1|A|A|43 | 2L6I|1|A|U|44 | | s35 | |
2L6I|1|A|A|43 | 2L6I|1|A|U|55 | cWW | | |
2L6I|1|A|A|52 | 2L6I|1|A|A|52 | | | 0BPh |
2L6I|1|A|A|52 | 2L6I|1|A|C|47 | | ns55 | |
2L6I|1|A|A|52 | 2L6I|1|A|G|50 | | s53 | |
2L6I|1|A|A|52 | 2L6I|1|A|G|53 | | s35 | |
2L6I|1|A|A|52 | 2L6I|1|A|U|46 | cWW | | |
2L6I|1|A|A|54 | 2L6I|1|A|A|54 | | | 0BPh |
2L6I|1|A|A|54 | 2L6I|1|A|C|45 | | ns55 | |
2L6I|1|A|A|54 | 2L6I|1|A|G|53 | | s53 | |
2L6I|1|A|A|54 | 2L6I|1|A|U|44 | cWW | | |
2L6I|1|A|A|54 | 2L6I|1|A|U|55 | | s35 | |
2L6I|1|A|A|57 | 2L6I|1|A|A|57 | | | 0BPh |
2L6I|1|A|A|57 | 2L6I|1|A|C|56 | | s53 | |
2L6I|1|A|C|45 | 2L6I|1|A|A|54 | | ns55 | |
2L6I|1|A|C|45 | 2L6I|1|A|C|45 | | | 0BPh |
2L6I|1|A|C|45 | 2L6I|1|A|G|53 | cWW | | |
2L6I|1|A|C|45 | 2L6I|1|A|U|44 | | s53 | |
2L6I|1|A|C|45 | 2L6I|1|A|U|46 | | s35 | |
2L6I|1|A|C|47 | 2L6I|1|A|A|52 | | ns55 | |
2L6I|1|A|C|47 | 2L6I|1|A|C|47 | | | 0BPh |
2L6I|1|A|C|47 | 2L6I|1|A|G|50 | cWW | | |
2L6I|1|A|C|47 | 2L6I|1|A|U|46 | | s53 | |
2L6I|1|A|C|47 | 2L6I|1|A|U|49 | | s35 | |
2L6I|1|A|C|56 | 2L6I|1|A|A|43 | | ns55 | |
2L6I|1|A|C|56 | 2L6I|1|A|A|57 | | s35 | |
2L6I|1|A|C|56 | 2L6I|1|A|C|56 | | | 0BPh |
2L6I|1|A|C|56 | 2L6I|1|A|G|42 | cWW | | |
2L6I|1|A|C|56 | 2L6I|1|A|U|55 | | s53 | |
2L6I|1|A|G|42 | 2L6I|1|A|A|43 | | s35 | |
2L6I|1|A|G|42 | 2L6I|1|A|C|56 | cWW | | |
2L6I|1|A|G|42 | 2L6I|1|A|G|42 | | | 0BPh |
2L6I|1|A|G|50 | 2L6I|1|A|A|52 | | s35 | |
2L6I|1|A|G|50 | 2L6I|1|A|C|47 | cWW | | |
2L6I|1|A|G|50 | 2L6I|1|A|U|49 | | ns55 | |
2L6I|1|A|G|53 | 2L6I|1|A|A|52 | | s53 | |
2L6I|1|A|G|53 | 2L6I|1|A|A|54 | | s35 | |
2L6I|1|A|G|53 | 2L6I|1|A|C|45 | cWW | | |
2L6I|1|A|G|53 | 2L6I|1|A|G|53 | | | 0BPh |
2L6I|1|A|G|53 | 2L6I|1|A|U|46 | | s55 | |
2L6I|1|A|U|44 | 2L6I|1|A|A|43 | | s53 | |
2L6I|1|A|U|44 | 2L6I|1|A|A|54 | cWW | | |
2L6I|1|A|U|44 | 2L6I|1|A|C|45 | | s35 | |
2L6I|1|A|U|44 | 2L6I|1|A|U|44 | | | 0BPh |
2L6I|1|A|U|46 | 2L6I|1|A|A|52 | cWW | | |
2L6I|1|A|U|46 | 2L6I|1|A|C|45 | | s53 | |
2L6I|1|A|U|46 | 2L6I|1|A|C|47 | | s35 | |
2L6I|1|A|U|46 | 2L6I|1|A|G|53 | | s55 | |
2L6I|1|A|U|46 | 2L6I|1|A|U|46 | | | 0BPh |
2L6I|1|A|U|48 | 2L6I|1|A|C|47 | | | |
2L6I|1|A|U|48 | 2L6I|1|A|U|48 | | | 0BPh |
2L6I|1|A|U|49 | 2L6I|1|A|C|47 | | s53 | |
2L6I|1|A|U|49 | 2L6I|1|A|G|50 | | ns55 | |
2L6I|1|A|U|49 | 2L6I|1|A|U|48 | | | n9BP |
2L6I|1|A|U|49 | 2L6I|1|A|U|49 | | | 0BPh |
2L6I|1|A|U|51 | 2L6I|1|A|G|50 | | | |
2L6I|1|A|U|51 | 2L6I|1|A|U|51 | | | 0BPh |
2L6I|1|A|U|55 | 2L6I|1|A|A|43 | cWW | | |
2L6I|1|A|U|55 | 2L6I|1|A|A|54 | | s53 | |
2L6I|1|A|U|55 | 2L6I|1|A|C|56 | | s35 | |
2L6I|1|A|U|55 | 2L6I|1|A|U|55 | | | 0BPh |
Base-Pairs | Count (6) | Relative Frequency |
---|
cWW | 6 | 1.000 |
Base-Phosphate | Count (15) | Relative Frequency |
---|
0BPh | 15 | 1.000 |
Base-Stacking | Count (8) | Relative Frequency |
---|
s53 | 7 | 0.875 |
s55 | 1 | 0.125 |