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NDB ID: 2L8W  PDB ID: 2L8W 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
2L8W|1|A|C|12L8W|1|A|C|2s35
2L8W|1|A|C|12L8W|1|B|G|18cWW
2L8W|1|A|C|22L8W|1|A|C|1s53
2L8W|1|A|C|22L8W|1|A|C|20BPh
2L8W|1|A|C|22L8W|1|A|G|3ns35
2L8W|1|A|C|22L8W|1|B|G|17cWW
2L8W|1|A|C|22L8W|1|B|G|18s55
2L8W|1|A|C|42L8W|1|A|C|40BPh
2L8W|1|A|C|42L8W|1|A|G|3s53
2L8W|1|A|C|42L8W|1|A|U|5s35
2L8W|1|A|C|42L8W|1|B|G|15cWW
2L8W|1|A|C|72L8W|1|A|C|70BPh
2L8W|1|A|C|72L8W|1|A|G|6s53
2L8W|1|A|C|72L8W|1|A|G|8ns35
2L8W|1|A|C|72L8W|1|B|G|12cWW
2L8W|1|A|G|32L8W|1|A|C|2ns53
2L8W|1|A|G|32L8W|1|A|C|4s35
2L8W|1|A|G|32L8W|1|B|C|16cWW
2L8W|1|A|G|32L8W|1|B|G|17s55
2L8W|1|A|G|62L8W|1|A|C|7s35
2L8W|1|A|G|62L8W|1|A|G|60BPh
2L8W|1|A|G|62L8W|1|A|U|5
2L8W|1|A|G|62L8W|1|B|C|13cWW
2L8W|1|A|G|62L8W|1|B|U|14s55
2L8W|1|A|G|82L8W|1|A|C|7ns53
2L8W|1|A|G|82L8W|1|A|G|80BPh
2L8W|1|A|G|82L8W|1|A|G|9s35
2L8W|1|A|G|82L8W|1|B|C|11cWW
2L8W|1|A|G|82L8W|1|B|G|12s55
2L8W|1|A|G|92L8W|1|A|G|8s53
2L8W|1|A|G|92L8W|1|A|G|90BPh
2L8W|1|A|G|92L8W|1|B|C|10cWW
2L8W|1|A|G|92L8W|1|B|C|11s55
2L8W|1|A|U|52L8W|1|A|C|4s53
2L8W|1|A|U|52L8W|1|A|U|50BPh
2L8W|1|A|U|52L8W|1|B|G|15s55
2L8W|1|A|U|52L8W|1|B|U|14cWW
2L8W|1|B|C|102L8W|1|A|G|9cWW
2L8W|1|B|C|102L8W|1|B|C|10n0BP
2L8W|1|B|C|112L8W|1|A|G|8cWW
2L8W|1|B|C|112L8W|1|A|G|9s55
2L8W|1|B|C|112L8W|1|B|C|10
2L8W|1|B|C|112L8W|1|B|C|110BPh
2L8W|1|B|C|112L8W|1|B|G|12s35
2L8W|1|B|C|132L8W|1|A|G|6cWW
2L8W|1|B|C|132L8W|1|B|C|130BPh
2L8W|1|B|C|132L8W|1|B|G|12s53
2L8W|1|B|C|132L8W|1|B|U|14ns35
2L8W|1|B|C|162L8W|1|A|G|3cWW
2L8W|1|B|C|162L8W|1|B|C|160BPh
2L8W|1|B|C|162L8W|1|B|G|15s53
2L8W|1|B|C|162L8W|1|B|G|17ns35
2L8W|1|B|G|122L8W|1|A|C|7cWW
2L8W|1|B|G|122L8W|1|A|G|8s55
2L8W|1|B|G|122L8W|1|B|C|11s53
2L8W|1|B|G|122L8W|1|B|C|13s35
2L8W|1|B|G|152L8W|1|A|C|4cWW
2L8W|1|B|G|152L8W|1|A|U|5s55
2L8W|1|B|G|152L8W|1|B|C|16s35
2L8W|1|B|G|152L8W|1|B|G|150BPh
2L8W|1|B|G|152L8W|1|B|U|14s53
2L8W|1|B|G|172L8W|1|A|C|2cWW
2L8W|1|B|G|172L8W|1|A|G|3s55
2L8W|1|B|G|172L8W|1|B|C|16ns53
2L8W|1|B|G|172L8W|1|B|G|18s35
2L8W|1|B|G|182L8W|1|A|C|1cWW
2L8W|1|B|G|182L8W|1|A|C|2s55
2L8W|1|B|G|182L8W|1|B|G|17s53
2L8W|1|B|G|182L8W|1|B|G|180BPh
2L8W|1|B|U|142L8W|1|A|G|6s55
2L8W|1|B|U|142L8W|1|A|U|5cWW
2L8W|1|B|U|142L8W|1|B|C|13ns53
2L8W|1|B|U|142L8W|1|B|G|15s35


Base-PairsCount (9)Relative Frequency
cWW91.000
Base-PhosphateCount (12)Relative Frequency
0BPh121.000
Base-StackingCount (11)Relative Frequency
s5350.455
s5560.545

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)