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NDB ID: DR0039  PDB ID: 2O3X 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
2O3X|1|A|A|102O3X|1|A|A|100BPh
2O3X|1|A|A|102O3X|1|A|C|11s35
2O3X|1|A|A|102O3X|1|A|C|9s53
2O3X|1|A|A|102O3X|1|B|G|39s55
2O3X|1|A|A|102O3X|1|B|U|38cWW
2O3X|1|A|A|182O3X|1|A|A|17
2O3X|1|A|A|82O3X|1|A|A|80BPh
2O3X|1|A|A|82O3X|1|A|C|7s53
2O3X|1|A|A|82O3X|1|A|C|9s35
2O3X|1|A|A|82O3X|1|B|G|42s55
2O3X|1|A|C|112O3X|1|A|A|10s53
2O3X|1|A|C|112O3X|1|A|C|110BPh
2O3X|1|A|C|112O3X|1|A|C|12s35
2O3X|1|A|C|112O3X|1|B|G|37cWW
2O3X|1|A|C|122O3X|1|A|C|11s53
2O3X|1|A|C|122O3X|1|A|C|120BPh
2O3X|1|A|C|122O3X|1|A|G|13s35
2O3X|1|A|C|122O3X|1|B|G|36cWW
2O3X|1|A|C|122O3X|1|B|G|37s55
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2O3X|1|A|C|212O3X|1|B|G|28cWW
2O3X|1|A|C|232O3X|1|A|C|230BPh
2O3X|1|A|C|232O3X|1|A|G|22s53
2O3X|1|A|C|232O3X|1|B|G|26cWW
2O3X|1|A|C|42O3X|1|A|C|40BPh
2O3X|1|A|C|42O3X|1|A|G|3s53
2O3X|1|A|C|42O3X|1|A|G|5s35
2O3X|1|A|C|42O3X|1|B|G|45cWW
2O3X|1|A|C|72O3X|1|A|A|8s35
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2O3X|1|A|G|132O3X|1|A|C|12s53
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2O3X|1|A|G|132O3X|1|B|G|36s55
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2O3X|1|A|G|52O3X|1|B|G|45s55
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2O3X|1|B|C|462O3X|1|B|C|460BPh
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2O3X|1|B|G|372O3X|1|B|U|38s35
2O3X|1|B|G|392O3X|1|A|A|10s55
2O3X|1|B|G|392O3X|1|A|C|9cWW
2O3X|1|B|G|392O3X|1|B|G|390BPh
2O3X|1|B|G|392O3X|1|B|U|38s53
2O3X|1|B|G|422O3X|1|A|A|8s55
2O3X|1|B|G|422O3X|1|A|C|7cWW
2O3X|1|B|G|422O3X|1|B|G|420BPh
2O3X|1|B|G|422O3X|1|B|U|43s35
2O3X|1|B|G|452O3X|1|A|C|4cWW
2O3X|1|B|G|452O3X|1|A|G|5s55
2O3X|1|B|G|452O3X|1|B|C|44s53
2O3X|1|B|G|452O3X|1|B|C|46s35
2O3X|1|B|G|452O3X|1|B|G|450BPh
2O3X|1|B|U|292O3X|1|A|U|20cWW
2O3X|1|B|U|292O3X|1|B|C|30s35
2O3X|1|B|U|292O3X|1|B|G|28s53
2O3X|1|B|U|292O3X|1|B|U|290BPh
2O3X|1|B|U|382O3X|1|A|A|10cWW
2O3X|1|B|U|382O3X|1|B|G|37s53
2O3X|1|B|U|382O3X|1|B|G|39s35
2O3X|1|B|U|382O3X|1|B|U|380BPh
2O3X|1|B|U|432O3X|1|B|C|44s35
2O3X|1|B|U|432O3X|1|B|G|42s53
2O3X|1|B|U|432O3X|1|B|U|430BPh


Base-PairsCount (17)Relative Frequency
cWW171.000
Base-PhosphateCount (37)Relative Frequency
0BPh371.000
Base-StackingCount (23)Relative Frequency
s53130.565
s55100.435

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)