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NDB ID: 2U2A  PDB ID: 2U2A 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
2U2A|1|A|A|102U2A|1|A|A|100BPh
2U2A|1|A|A|102U2A|1|A|A|11s35
2U2A|1|A|A|112U2A|1|A|A|10s53n0BP
2U2A|1|A|A|112U2A|1|A|A|110BPh
2U2A|1|A|A|112U2A|1|A|C|12s35
2U2A|1|A|A|112U2A|1|A|U|9s33
2U2A|1|A|A|132U2A|1|A|A|130BPh
2U2A|1|A|A|132U2A|1|A|A|14s35
2U2A|1|A|A|132U2A|1|A|C|12s53
2U2A|1|A|A|132U2A|1|A|G|8ntHS
2U2A|1|A|A|132U2A|1|A|U|7ntHS
2U2A|1|A|A|142U2A|1|A|A|13s53
2U2A|1|A|A|142U2A|1|A|A|140BPh
2U2A|1|A|A|142U2A|1|A|C|15s35
2U2A|1|A|A|142U2A|1|A|G|8s55
2U2A|1|A|A|142U2A|1|A|U|7cWW
2U2A|1|A|A|182U2A|1|A|A|180BPh
2U2A|1|A|A|182U2A|1|A|C|19s35
2U2A|1|A|A|182U2A|1|A|G|17s53
2U2A|1|A|A|182U2A|1|A|U|3cWW
2U2A|1|A|A|52U2A|1|A|A|50BPh
2U2A|1|A|A|52U2A|1|A|C|4s53
2U2A|1|A|A|52U2A|1|A|G|17s55
2U2A|1|A|A|52U2A|1|A|G|6s35
2U2A|1|A|A|52U2A|1|A|U|16cWW
2U2A|1|A|C|122U2A|1|A|A|11s53
2U2A|1|A|C|122U2A|1|A|A|13s35
2U2A|1|A|C|152U2A|1|A|A|14s53
2U2A|1|A|C|152U2A|1|A|C|150BPh
2U2A|1|A|C|152U2A|1|A|G|6cWW
2U2A|1|A|C|152U2A|1|A|U|16s35
2U2A|1|A|C|192U2A|1|A|A|18s53
2U2A|1|A|C|192U2A|1|A|C|190BPh
2U2A|1|A|C|192U2A|1|A|C|20s35
2U2A|1|A|C|192U2A|1|A|G|2cWW
2U2A|1|A|C|202U2A|1|A|C|19s53
2U2A|1|A|C|202U2A|1|A|C|200BPh
2U2A|1|A|C|202U2A|1|A|G|1cWW
2U2A|1|A|C|202U2A|1|A|G|2s55
2U2A|1|A|C|42U2A|1|A|A|5s35
2U2A|1|A|C|42U2A|1|A|C|40BPh
2U2A|1|A|C|42U2A|1|A|G|17cWW
2U2A|1|A|C|42U2A|1|A|U|3s53
2U2A|1|A|G|12U2A|1|A|C|20cWW
2U2A|1|A|G|12U2A|1|A|G|10BPh
2U2A|1|A|G|12U2A|1|A|G|2s35
2U2A|1|A|G|172U2A|1|A|A|18s35
2U2A|1|A|G|172U2A|1|A|A|5s55
2U2A|1|A|G|172U2A|1|A|C|4cWW
2U2A|1|A|G|172U2A|1|A|G|170BPh
2U2A|1|A|G|172U2A|1|A|U|16s53
2U2A|1|A|G|22U2A|1|A|C|19cWW
2U2A|1|A|G|22U2A|1|A|C|20s55
2U2A|1|A|G|22U2A|1|A|G|1s53
2U2A|1|A|G|22U2A|1|A|G|20BPh
2U2A|1|A|G|22U2A|1|A|U|3s35
2U2A|1|A|G|62U2A|1|A|A|5s53
2U2A|1|A|G|62U2A|1|A|C|15cWW
2U2A|1|A|G|62U2A|1|A|G|60BPh
2U2A|1|A|G|62U2A|1|A|U|16s55
2U2A|1|A|G|62U2A|1|A|U|7s35
2U2A|1|A|G|82U2A|1|A|A|13ntSH
2U2A|1|A|G|82U2A|1|A|A|14s55
2U2A|1|A|G|82U2A|1|A|C|12n3BP
2U2A|1|A|G|82U2A|1|A|G|80BPh
2U2A|1|A|G|82U2A|1|A|U|7s53
2U2A|1|A|G|82U2A|1|A|U|9s35
2U2A|1|A|U|162U2A|1|A|A|5cWW
2U2A|1|A|U|162U2A|1|A|C|15s53
2U2A|1|A|U|162U2A|1|A|G|17s35
2U2A|1|A|U|162U2A|1|A|G|6s55
2U2A|1|A|U|162U2A|1|A|U|160BPh
2U2A|1|A|U|32U2A|1|A|A|18cWW
2U2A|1|A|U|32U2A|1|A|C|4s35
2U2A|1|A|U|32U2A|1|A|G|2s53
2U2A|1|A|U|32U2A|1|A|U|30BPh
2U2A|1|A|U|72U2A|1|A|A|13ntSH
2U2A|1|A|U|72U2A|1|A|A|14cWW
2U2A|1|A|U|72U2A|1|A|G|6s53
2U2A|1|A|U|72U2A|1|A|G|8s35
2U2A|1|A|U|72U2A|1|A|U|70BPh
2U2A|1|A|U|92U2A|1|A|A|11s33
2U2A|1|A|U|92U2A|1|A|C|125BPh
2U2A|1|A|U|92U2A|1|A|G|8s53
2U2A|1|A|U|92U2A|1|A|U|90BPh


Base-PairsCount (7)Relative Frequency
cWW71.000
Base-PhosphateCount (20)Relative Frequency
5BPh10.050
0BPh190.950
Base-StackingCount (11)Relative Frequency
s3310.091
s5360.545
s5540.364

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)