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As of 12-Aug-2022 number of released structures: 12231
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NDB ID: PR0382  PDB ID: 3A2K 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
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3A2K|1|D|U|713A2K|1|D|C|72s35
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3A2K|1|D|U|713A2K|1|D|U|710BPh
3A2K|1|D|U|83A2K|1|D|A|14
3A2K|1|D|U|83A2K|1|D|C|13ns33
3A2K|1|D|U|83A2K|1|D|U|7n9BP


Base-PairsCount (52)Relative Frequency
cWW440.846
tWH40.077
cWS20.038
tWS20.038
Base-PhosphateCount (96)Relative Frequency
5BPh40.042
9BPh20.021
0BPh900.938
Base-StackingCount (72)Relative Frequency
s3360.083
s53280.389
s55380.528

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)