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NDB ID: NA0403  PDB ID: 3KYL 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
3KYL|1|E|A|43KYL|1|E|A|40BPh
3KYL|1|E|A|43KYL|1|E|C|5s35
3KYL|1|E|A|43KYL|1|E|G|3s53
3KYL|1|E|A|93KYL|1|E|A|90BPh
3KYL|1|E|A|93KYL|1|E|C|10s35
3KYL|1|E|A|93KYL|1|E|G|8s53
3KYL|1|E|C|13KYL|1|E|C|10BPh
3KYL|1|E|C|13KYL|1|E|U|2s35
3KYL|1|E|C|103KYL|1|E|A|9s53
3KYL|1|E|C|103KYL|1|E|C|100BPh
3KYL|1|E|C|53KYL|1|E|A|4s53
3KYL|1|E|C|53KYL|1|E|C|50BPh
3KYL|1|E|C|53KYL|1|E|C|6s35
3KYL|1|E|C|63KYL|1|E|C|5s53
3KYL|1|E|C|63KYL|1|E|C|60BPh
3KYL|1|E|C|63KYL|1|E|U|7s35
3KYL|1|E|G|33KYL|1|E|A|4s35
3KYL|1|E|G|33KYL|1|E|G|30BPh
3KYL|1|E|G|33KYL|1|E|U|2ns53
3KYL|1|E|G|83KYL|1|E|A|9s35
3KYL|1|E|G|83KYL|1|E|U|7s53
3KYL|1|E|U|23KYL|1|E|C|1s53
3KYL|1|E|U|23KYL|1|E|G|3ns35
3KYL|1|E|U|23KYL|1|E|U|20BPh
3KYL|1|E|U|73KYL|1|E|C|6s53
3KYL|1|E|U|73KYL|1|E|G|8s35
3KYL|1|E|U|73KYL|1|E|U|70BPh


Base-PairsCount (0)Relative Frequency
Base-PhosphateCount (9)Relative Frequency
0BPh91.000
Base-StackingCount (3)Relative Frequency
s5331.000

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)