NDB ID: NA0403 PDB ID: 3KYL 
RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions
CSV FormatNucleotide 1 | Nucleotide 2 | Base-Pairs | Base-Stacking | Base-Phosphate |
---|
3KYL|1|E|A|4 | 3KYL|1|E|A|4 | | | 0BPh |
3KYL|1|E|A|4 | 3KYL|1|E|C|5 | | s35 | |
3KYL|1|E|A|4 | 3KYL|1|E|G|3 | | s53 | |
3KYL|1|E|A|9 | 3KYL|1|E|A|9 | | | 0BPh |
3KYL|1|E|A|9 | 3KYL|1|E|C|10 | | s35 | |
3KYL|1|E|A|9 | 3KYL|1|E|G|8 | | s53 | |
3KYL|1|E|C|1 | 3KYL|1|E|C|1 | | | 0BPh |
3KYL|1|E|C|1 | 3KYL|1|E|U|2 | | s35 | |
3KYL|1|E|C|10 | 3KYL|1|E|A|9 | | s53 | |
3KYL|1|E|C|10 | 3KYL|1|E|C|10 | | | 0BPh |
3KYL|1|E|C|5 | 3KYL|1|E|A|4 | | s53 | |
3KYL|1|E|C|5 | 3KYL|1|E|C|5 | | | 0BPh |
3KYL|1|E|C|5 | 3KYL|1|E|C|6 | | s35 | |
3KYL|1|E|C|6 | 3KYL|1|E|C|5 | | s53 | |
3KYL|1|E|C|6 | 3KYL|1|E|C|6 | | | 0BPh |
3KYL|1|E|C|6 | 3KYL|1|E|U|7 | | s35 | |
3KYL|1|E|G|3 | 3KYL|1|E|A|4 | | s35 | |
3KYL|1|E|G|3 | 3KYL|1|E|G|3 | | | 0BPh |
3KYL|1|E|G|3 | 3KYL|1|E|U|2 | | ns53 | |
3KYL|1|E|G|8 | 3KYL|1|E|A|9 | | s35 | |
3KYL|1|E|G|8 | 3KYL|1|E|U|7 | | s53 | |
3KYL|1|E|U|2 | 3KYL|1|E|C|1 | | s53 | |
3KYL|1|E|U|2 | 3KYL|1|E|G|3 | | ns35 | |
3KYL|1|E|U|2 | 3KYL|1|E|U|2 | | | 0BPh |
3KYL|1|E|U|7 | 3KYL|1|E|C|6 | | s53 | |
3KYL|1|E|U|7 | 3KYL|1|E|G|8 | | s35 | |
3KYL|1|E|U|7 | 3KYL|1|E|U|7 | | | 0BPh |
Base-Pairs | Count (0) | Relative Frequency |
---|
Base-Phosphate | Count (9) | Relative Frequency |
---|
0BPh | 9 | 1.000 |
Base-Stacking | Count (3) | Relative Frequency |
---|
s53 | 3 | 1.000 |