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NDB ID: 4X4S  PDB ID: 4X4S 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
4X4S|1|B|A|104X4S|1|B|A|100BPh
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4X4S|1|B|A|104X4S|1|B|U|22cWW
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4X4S|1|B|A|174X4S|1|B|U|19
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4X4S|1|B|A|354X4S|1|B|C|36s35
4X4S|1|B|A|354X4S|1|B|G|1s55
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4X4S|1|D|U|224X4S|1|D|G|23s35


Base-PairsCount (21)Relative Frequency
cWW200.952
tWH10.048
Base-PhosphateCount (58)Relative Frequency
5BPh20.034
9BPh10.017
0BPh550.948
Base-StackingCount (36)Relative Frequency
s53190.528
s55170.472

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)