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As of 11-Jul-2018 number of released structures: 9584
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NDB ID: 5U0Q  PDB ID: 5U0Q 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
5U0Q|1|A|A|25U0Q|1|A|G|3s55
5U0Q|1|A|A|25U0Q|1|A|U|1s35
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5U0Q|1|D|G|95U0Q|1|C|C|7s55
5U0Q|1|D|G|95U0Q|1|D|A|10s35
5U0Q|1|D|G|95U0Q|1|D|G|8s53
5U0Q|1|D|G|95U0Q|1|D|G|90BPh


Base-PairsCount (10)Relative Frequency
cWW101.000
Base-PhosphateCount (22)Relative Frequency
0BPh221.000
Base-StackingCount (15)Relative Frequency
s5380.533
s5570.467

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)