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As of 1-Dec-2021 number of released structures: 11785
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NDB ID: 5WWF  PDB ID: 5WWF 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
5WWF|1|B|A|15WWF|1|B|A|10BPh
5WWF|1|B|A|15WWF|1|B|A|2
5WWF|1|B|A|25WWF|1|B|A|1
5WWF|1|B|A|55WWF|1|B|A|50BPh
5WWF|1|B|A|55WWF|1|B|C|6s35
5WWF|1|B|A|55WWF|1|B|G|4s53
5WWF|1|B|A|85WWF|1|B|G|9ns55
5WWF|1|B|C|65WWF|1|B|A|5s53
5WWF|1|B|C|65WWF|1|B|C|60BPh
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5WWF|1|B|G|35WWF|1|B|A|2
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5WWF|1|B|G|35WWF|1|B|G|4s35
5WWF|1|B|G|45WWF|1|B|A|5s35
5WWF|1|B|G|45WWF|1|B|G|3s53
5WWF|1|B|G|45WWF|1|B|G|40BPh
5WWF|1|B|G|75WWF|1|B|C|6s33
5WWF|1|B|G|75WWF|1|B|G|70BPh
5WWF|1|B|G|95WWF|1|B|A|8ns55
5WWF|1|D|A|15WWF|1|D|A|10BPh
5WWF|1|D|A|15WWF|1|D|A|2
5WWF|1|D|A|25WWF|1|D|A|1
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5WWF|1|D|A|55WWF|1|D|C|6s35
5WWF|1|D|A|55WWF|1|D|G|4s53
5WWF|1|D|A|85WWF|1|D|G|9ns55
5WWF|1|D|C|65WWF|1|D|A|5s53
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5WWF|1|D|C|65WWF|1|D|G|7s33
5WWF|1|D|G|35WWF|1|D|A|2
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5WWF|1|D|G|75WWF|1|D|C|6s33
5WWF|1|D|G|75WWF|1|D|G|70BPh
5WWF|1|D|G|95WWF|1|D|A|8ns55


Base-PairsCount (0)Relative Frequency
Base-PhosphateCount (12)Relative Frequency
0BPh121.000
Base-StackingCount (4)Relative Frequency
s3320.500
s5320.500

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)