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NDB ID: 5ZEG  PDB ID: 5ZEG 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
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5ZEG|1|C|U|6||||2_5555ZEG|1|C|C|7||||2_555s35
5ZEG|1|C|U|6||||2_5555ZEG|1|C|G|5||||2_555s53
5ZEG|1|C|U|6||||2_5555ZEG|1|C|U|20cWW
5ZEG|1|C|U|6||||2_5555ZEG|1|C|U|6||||2_5550BPh


Base-PairsCount (38)Relative Frequency
cWW381.000
Base-PhosphateCount (82)Relative Frequency
9BPh10.012
0BPh810.988
Base-StackingCount (40)Relative Frequency
s3310.025
s53260.650
s55130.325

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)