A Portal for Three-dimensional Structural Information about Nucleic Acids
As of 17-Apr-2018 number of released structures: 9452
Search for released structures

NDB ID: 6AR3  PDB ID: 6AR3 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
6AR3|1|C|A|136AR3|1|C|A|130BPh
6AR3|1|C|A|136AR3|1|C|G|12s53
6AR3|1|C|A|136AR3|1|C|G|14s35
6AR3|1|C|C|86AR3|1|C|C|80BPh
6AR3|1|C|C|86AR3|1|C|C|9s35
6AR3|1|C|C|86AR3|1|C|G|7s53
6AR3|1|C|C|96AR3|1|C|C|8s53
6AR3|1|C|C|96AR3|1|C|C|90BPh
6AR3|1|C|C|96AR3|1|C|U|10s35
6AR3|1|C|G|116AR3|1|C|G|110BPh
6AR3|1|C|G|116AR3|1|C|G|12s35
6AR3|1|C|G|116AR3|1|C|U|10s53
6AR3|1|C|G|126AR3|1|C|A|13s35
6AR3|1|C|G|126AR3|1|C|G|11s53
6AR3|1|C|G|126AR3|1|C|G|120BPh
6AR3|1|C|G|146AR3|1|C|A|13s53
6AR3|1|C|G|46AR3|1|C|G|40BPh
6AR3|1|C|G|46AR3|1|C|U|3s53
6AR3|1|C|G|46AR3|1|C|U|5s35
6AR3|1|C|G|76AR3|1|C|C|8s35
6AR3|1|C|G|76AR3|1|C|G|70BPh
6AR3|1|C|G|76AR3|1|C|U|6s53
6AR3|1|C|U|16AR3|1|C|U|1
6AR3|1|C|U|16AR3|1|C|U|2
6AR3|1|C|U|106AR3|1|C|C|9s53
6AR3|1|C|U|106AR3|1|C|G|11s35
6AR3|1|C|U|106AR3|1|C|U|100BPh
6AR3|1|C|U|26AR3|1|C|U|1
6AR3|1|C|U|26AR3|1|C|U|20BPh
6AR3|1|C|U|26AR3|1|C|U|3
6AR3|1|C|U|36AR3|1|C|G|4s35
6AR3|1|C|U|36AR3|1|C|U|2
6AR3|1|C|U|36AR3|1|C|U|30BPh
6AR3|1|C|U|56AR3|1|C|G|4s53
6AR3|1|C|U|56AR3|1|C|U|50BPh
6AR3|1|C|U|56AR3|1|C|U|6s35
6AR3|1|C|U|66AR3|1|C|G|7s35
6AR3|1|C|U|66AR3|1|C|U|5s53
6AR3|1|C|U|66AR3|1|C|U|60BPh
6AR3|1|F|A|136AR3|1|F|A|130BPh
6AR3|1|F|A|136AR3|1|F|G|12s53
6AR3|1|F|A|136AR3|1|F|G|14s35
6AR3|1|F|C|86AR3|1|F|C|80BPh
6AR3|1|F|C|86AR3|1|F|C|9s35
6AR3|1|F|C|86AR3|1|F|G|7s53
6AR3|1|F|C|96AR3|1|F|C|8s53
6AR3|1|F|C|96AR3|1|F|C|90BPh
6AR3|1|F|C|96AR3|1|F|U|10s35
6AR3|1|F|G|116AR3|1|F|G|110BPh
6AR3|1|F|G|116AR3|1|F|G|12s35
6AR3|1|F|G|116AR3|1|F|U|10s53
6AR3|1|F|G|126AR3|1|F|A|13s35
6AR3|1|F|G|126AR3|1|F|G|11s53
6AR3|1|F|G|126AR3|1|F|G|120BPh
6AR3|1|F|G|146AR3|1|F|A|13s53
6AR3|1|F|G|46AR3|1|F|G|40BPh
6AR3|1|F|G|46AR3|1|F|U|3s53
6AR3|1|F|G|46AR3|1|F|U|5s35
6AR3|1|F|G|76AR3|1|F|C|8s35
6AR3|1|F|G|76AR3|1|F|G|70BPh
6AR3|1|F|G|76AR3|1|F|U|6s53
6AR3|1|F|U|16AR3|1|F|U|10BPh
6AR3|1|F|U|16AR3|1|F|U|2s33
6AR3|1|F|U|106AR3|1|F|C|9s53
6AR3|1|F|U|106AR3|1|F|G|11s35
6AR3|1|F|U|106AR3|1|F|U|100BPh
6AR3|1|F|U|26AR3|1|F|U|1s33
6AR3|1|F|U|26AR3|1|F|U|20BPh
6AR3|1|F|U|26AR3|1|F|U|3
6AR3|1|F|U|36AR3|1|F|G|4s35
6AR3|1|F|U|36AR3|1|F|U|2
6AR3|1|F|U|36AR3|1|F|U|30BPh
6AR3|1|F|U|56AR3|1|F|G|4s53
6AR3|1|F|U|56AR3|1|F|U|50BPh
6AR3|1|F|U|56AR3|1|F|U|6s35
6AR3|1|F|U|66AR3|1|F|G|7s35
6AR3|1|F|U|66AR3|1|F|U|5s53
6AR3|1|F|U|66AR3|1|F|U|60BPh


Base-PairsCount (0)Relative Frequency
Base-PhosphateCount (25)Relative Frequency
0BPh251.000
Base-StackingCount (11)Relative Frequency
s3310.091
s53100.909

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)