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NDB ID: 6OZN  PDB ID: 6OZN 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
6OZN|1|C|A|11||A6OZN|1|C|A|11||A0BPh
6OZN|1|C|A|11||A6OZN|1|C|U|12||As35
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6OZN|1|C|A|136OZN|1|C|U|12||As53
6OZN|1|C|A|136OZN|1|C|U|14s35
6OZN|1|C|A|136OZN|1|D|U|22cWW
6OZN|1|C|A|176OZN|1|C|A|170BPh
6OZN|1|C|A|176OZN|1|C|C|16s53
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6OZN|1|C|A|216OZN|1|C|U|22s35
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6OZN|1|C|C|96OZN|1|C|C|90BPh
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6OZN|1|C|G|156OZN|1|C|G|150BPh
6OZN|1|C|G|156OZN|1|C|U|14s53
6OZN|1|C|G|156OZN|1|D|A|21s55
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6OZN|1|C|G|196OZN|1|C|C|20s35
6OZN|1|C|G|196OZN|1|C|G|190BPh
6OZN|1|C|G|196OZN|1|C|U|18s53
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6OZN|1|C|U|146OZN|1|C|A|13s53
6OZN|1|C|U|146OZN|1|C|G|15s35
6OZN|1|C|U|146OZN|1|C|U|140BPh
6OZN|1|C|U|146OZN|1|D|A|21cWW
6OZN|1|C|U|186OZN|1|C|A|17s53
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6OZN|1|C|U|226OZN|1|C|U|23s35
6OZN|1|C|U|226OZN|1|D|A|13cWW
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6OZN|1|D|A|136OZN|1|D|U|12||As53
6OZN|1|D|A|136OZN|1|D|U|14s35
6OZN|1|D|A|176OZN|1|C|G|19s55
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6OZN|1|D|C|206OZN|1|D|G|19s53
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6OZN|1|D|G|156OZN|1|D|C|16s35
6OZN|1|D|G|156OZN|1|D|G|150BPh
6OZN|1|D|G|156OZN|1|D|U|14s53
6OZN|1|D|G|196OZN|1|C|A|17s55
6OZN|1|D|G|196OZN|1|C|C|16cWW
6OZN|1|D|G|196OZN|1|D|C|20s35
6OZN|1|D|G|196OZN|1|D|G|190BPh
6OZN|1|D|G|196OZN|1|D|U|18s53
6OZN|1|D|U|12||A6OZN|1|C|U|23cWW
6OZN|1|D|U|12||A6OZN|1|D|A|11||As53
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6OZN|1|D|U|226OZN|1|D|U|220BPh
6OZN|1|D|U|226OZN|1|D|U|23s35
6OZN|1|D|U|236OZN|1|C|U|12||AcWW
6OZN|1|D|U|236OZN|1|D|U|22s53
6OZN|1|D|U|236OZN|1|D|U|230BPh


Base-PairsCount (12)Relative Frequency
cWW121.000
Base-PhosphateCount (27)Relative Frequency
0BPh271.000
Base-StackingCount (18)Relative Frequency
s53140.778
s5540.222

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)