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NDB ID: 6VMY  PDB ID: 6VMY 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

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Base-PairsCount (55)Relative Frequency
cWW460.836
tWH20.036
cWS10.018
tHS20.036
cSS20.036
tSS20.036
Base-PhosphateCount (124)Relative Frequency
1BPh10.008
2BPh30.024
5BPh10.008
6BPh10.008
7BPh10.008
9BPh20.016
0BPh1150.927
Base-StackingCount (76)Relative Frequency
s3360.079
s53360.474
s55340.447

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)