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As of 30-Nov-2022 number of released structures: 12490
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NDB ID: 6XRQ  PDB ID: 6XRQ 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
6XRQ|1|A|C|36XRQ|1|A|C|30BPh
6XRQ|1|A|C|36XRQ|1|A|G|29BPh
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6XRQ|1|B|C|56XRQ|1|A|C|5tWW
6XRQ|1|B|C|56XRQ|1|B|C|50BPh
6XRQ|1|B|C|86XRQ|1|B|C|80BPh
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6XRQ|1|B|G|126XRQ|1|B|G|10s35
6XRQ|1|B|G|126XRQ|1|B|G|120BPh
6XRQ|1|B|G|126XRQ|1|B|G|13s35
6XRQ|1|B|G|126XRQ|1|B|G|2s55
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6XRQ|1|B|G|136XRQ|1|A|G|9s53
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6XRQ|1|B|G|96XRQ|1|B|G|10s35
6XRQ|1|B|G|96XRQ|1|B|G|12cWH
6XRQ|1|B|G|96XRQ|1|B|G|2ns55
6XRQ|1|B|G|96XRQ|1|B|G|7||As55
6XRQ|1|B|G|96XRQ|1|B|G|9n0BP
6XRQ|1|B|U|46XRQ|1|B|U|40BPh


Base-PairsCount (17)Relative Frequency
tWW10.059
cWH160.941
Base-PhosphateCount (17)Relative Frequency
1BPh10.059
9BPh10.059
0BPh150.882
Base-StackingCount (14)Relative Frequency
s53100.714
s5540.286

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)