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NDB ID: 7EI9  PDB ID: 7EI9 

RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
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Base-PairsCount (16)Relative Frequency
cWW100.625
tHS60.375
Base-PhosphateCount (34)Relative Frequency
3BPh20.059
4BPh10.029
9BPh10.029
0BPh300.882
Base-StackingCount (18)Relative Frequency
s3340.222
s5350.278
s5590.500

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)

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