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NDB ID: 7ELP  PDB ID: 7ELP 


RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
7ELP|1|A|A|167ELP|1|A|A|160BPh
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7ELP|1|B|C|15||||1_6577ELP|1|B|A|37||||1_657s55
7ELP|1|B|C|15||||1_6577ELP|1|B|G|36||||1_657cWW
7ELP|1|B|C|15||||1_6577ELP|1|B|U|14||||1_657s53
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7ELP|1|B|G|17||||1_6577ELP|1|B|C|33||||1_657s55
7ELP|1|B|G|17||||1_6577ELP|1|B|G|17||||1_6570BPh
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7ELP|1|B|G|31||||1_6577ELP|1|B|G|19||||1_657s55
7ELP|1|B|G|31||||1_6577ELP|1|B|G|31||||1_6570BPh
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7ELP|1|B|U|13||||1_6577ELP|1|B|U|13||||1_6570BPh
7ELP|1|B|U|13||||1_6577ELP|1|B|U|14||||1_657s35
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7ELP|1|B|U|14||||1_6577ELP|1|B|U|13||||1_657s53
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7ELP|1|B|U|40||||1_6577ELP|1|B|A|39||||1_657s53
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7ELP|1|B|U|40||||1_6577ELP|1|B|U|40||||1_6570BPh
7ELP|1|B|U|40||||1_6577ELP|1|B|U|41||||1_657s35
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7ELP|1|B|U|41||||1_6577ELP|1|B|A|9||||1_657cSW
7ELP|1|B|U|41||||1_6577ELP|1|B|G|42||||1_657s35
7ELP|1|B|U|41||||1_6577ELP|1|B|U|40||||1_657s53
7ELP|1|B|U|41||||1_6577ELP|1|B|U|41||||1_6570BPh
7ELP|1|B|U|44||||1_6577ELP|1|B|A|3||||1_657cWW
7ELP|1|B|U|44||||1_6577ELP|1|B|C|43||||1_657s53
7ELP|1|B|U|44||||1_6577ELP|1|B|C|45||||1_657s35
7ELP|1|B|U|44||||1_6577ELP|1|B|G|4||||1_657s55
7ELP|1|B|U|44||||1_6577ELP|1|B|U|44||||1_6570BPh
7ELP|1|B|U|5||||1_6577ELP|1|B|A|6||||1_657s35
7ELP|1|B|U|5||||1_6577ELP|1|B|G|42||||1_657cWW
7ELP|1|B|U|5||||1_6577ELP|1|B|G|4||||1_657s53
7ELP|1|B|U|5||||1_6577ELP|1|B|U|5||||1_6570BPh


Base-PairsCount (37)Relative Frequency
cWW300.811
cWS20.054
tWS20.054
cHS20.054
tHS10.027
Base-PhosphateCount (82)Relative Frequency
3BPh20.024
4BPh10.012
0BPh790.963
Base-StackingCount (54)Relative Frequency
s3320.037
s53280.519
s55240.444

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)