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NDB ID: 7JRR  PDB ID: 7JRR 

RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions

CSV Format

Nucleotide 1Nucleotide 2Base-PairsBase-StackingBase-Phosphate
7JRR|1|A|A|137JRR|1|A|A|130BPh
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7JRR|1|A|A|13||||7_5557JRR|1|A|A|14||||7_555s35
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7JRR|1|A|C|47||||7_5557JRR|1|A|G|39||||7_555cWW
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7JRR|1|A|U|49||||7_5557JRR|1|A|U|49||||7_5550BPh


Base-PairsCount (46)Relative Frequency
cWW400.870
tHS60.130
Base-PhosphateCount (94)Relative Frequency
0BPh941.000
Base-StackingCount (60)Relative Frequency
s3340.067
s53280.467
s55280.467

Leontis/Westhof Classification Legend

Base-Phosphate Interactions Legend

Base-Stacking Interactions Legend

Saenger Classification Legend

Correspondence of Leontis/Westhof names to Saenger numbering (table)

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