NDB ID: 7JRR PDB ID: 7JRR 
RNA Base-Pairs, Stacking and other pairwise interactions
CSV FormatNucleotide 1 | Nucleotide 2 | Base-Pairs | Base-Stacking | Base-Phosphate |
---|
7JRR|1|A|A|13 | 7JRR|1|A|A|13 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|A|13 | 7JRR|1|A|A|14 | | s35 | |
7JRR|1|A|A|13 | 7JRR|1|A|C|47||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|A|13 | 7JRR|1|A|G|39||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|A|13 | 7JRR|1|A|U|46||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|A|13||||7_555 | 7JRR|1|A|A|13||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|A|13||||7_555 | 7JRR|1|A|A|14||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|A|13||||7_555 | 7JRR|1|A|C|47 | | s55 | |
7JRR|1|A|A|13||||7_555 | 7JRR|1|A|G|39 | | s53 | |
7JRR|1|A|A|13||||7_555 | 7JRR|1|A|U|46 | cWW | | |
7JRR|1|A|A|14 | 7JRR|1|A|A|13 | | s53 | |
7JRR|1|A|A|14 | 7JRR|1|A|A|14 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|A|14 | 7JRR|1|A|C|15 | | s35 | |
7JRR|1|A|A|14 | 7JRR|1|A|U|45||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|A|14 | 7JRR|1|A|U|46||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|A|14||||7_555 | 7JRR|1|A|A|13||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|A|14||||7_555 | 7JRR|1|A|A|14||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|A|14||||7_555 | 7JRR|1|A|C|15||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|A|14||||7_555 | 7JRR|1|A|U|45 | cWW | | |
7JRR|1|A|A|14||||7_555 | 7JRR|1|A|U|46 | | s55 | |
7JRR|1|A|A|17 | 7JRR|1|A|A|17 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|A|17 | 7JRR|1|A|C|16 | | s53 | |
7JRR|1|A|A|17 | 7JRR|1|A|G|43||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|A|17 | 7JRR|1|A|U|18 | | s35 | |
7JRR|1|A|A|17 | 7JRR|1|A|U|42||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|A|17||||7_555 | 7JRR|1|A|A|17||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|A|17||||7_555 | 7JRR|1|A|C|16||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|A|17||||7_555 | 7JRR|1|A|G|43 | | s55 | |
7JRR|1|A|A|17||||7_555 | 7JRR|1|A|U|18||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|A|17||||7_555 | 7JRR|1|A|U|42 | cWW | | |
7JRR|1|A|A|21 | 7JRR|1|A|A|21 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|A|21 | 7JRR|1|A|C|20 | | s53 | |
7JRR|1|A|A|21 | 7JRR|1|A|G|12 | | s55 | |
7JRR|1|A|A|21 | 7JRR|1|A|G|22 | | s35 | |
7JRR|1|A|A|21 | 7JRR|1|A|U|11 | cWW | | |
7JRR|1|A|A|21||||7_555 | 7JRR|1|A|A|21||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|A|21||||7_555 | 7JRR|1|A|C|20||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|A|21||||7_555 | 7JRR|1|A|G|12||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|A|21||||7_555 | 7JRR|1|A|G|22||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|A|21||||7_555 | 7JRR|1|A|U|11||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|A|25 | 7JRR|1|A|A|8 | | s33 | |
7JRR|1|A|A|25 | 7JRR|1|A|G|27 | | s35 | |
7JRR|1|A|A|25||||7_555 | 7JRR|1|A|A|8||||7_555 | | s33 | |
7JRR|1|A|A|25||||7_555 | 7JRR|1|A|G|27||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|A|26 | 7JRR|1|A|A|26 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|A|26||||7_555 | 7JRR|1|A|A|26||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|A|28 | 7JRR|1|A|A|28 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|A|28 | 7JRR|1|A|A|29 | | s35 | |
7JRR|1|A|A|28 | 7JRR|1|A|A|8 | | s55 | |
7JRR|1|A|A|28 | 7JRR|1|A|G|24 | | | |
7JRR|1|A|A|28 | 7JRR|1|A|G|6 | | ns33 | |
7JRR|1|A|A|28 | 7JRR|1|A|G|7 | tHS | | |
7JRR|1|A|A|28||||7_555 | 7JRR|1|A|A|28||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|A|28||||7_555 | 7JRR|1|A|A|29||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|A|28||||7_555 | 7JRR|1|A|A|8||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|A|28||||7_555 | 7JRR|1|A|G|24||||7_555 | | | |
7JRR|1|A|A|28||||7_555 | 7JRR|1|A|G|6||||7_555 | | ns33 | |
7JRR|1|A|A|28||||7_555 | 7JRR|1|A|G|7||||7_555 | tHS | | |
7JRR|1|A|A|29 | 7JRR|1|A|A|28 | | s53 | |
7JRR|1|A|A|29 | 7JRR|1|A|C|30 | | s35 | |
7JRR|1|A|A|29 | 7JRR|1|A|G|6 | tHS | | |
7JRR|1|A|A|29||||7_555 | 7JRR|1|A|A|28||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|A|29||||7_555 | 7JRR|1|A|C|30||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|A|29||||7_555 | 7JRR|1|A|G|6||||7_555 | tHS | | |
7JRR|1|A|A|3 | 7JRR|1|A|A|3 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|A|3 | 7JRR|1|A|C|33 | | ns55 | |
7JRR|1|A|A|3 | 7JRR|1|A|C|4 | | s35 | |
7JRR|1|A|A|3 | 7JRR|1|A|G|2 | | s53 | |
7JRR|1|A|A|3 | 7JRR|1|A|U|32 | cWW | | |
7JRR|1|A|A|37 | 7JRR|1|A|A|37 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|A|37 | 7JRR|1|A|C|38 | | s35 | |
7JRR|1|A|A|37 | 7JRR|1|A|C|50 | | ns55 | |
7JRR|1|A|A|37 | 7JRR|1|A|G|36 | | s53 | |
7JRR|1|A|A|37 | 7JRR|1|A|U|49 | cWW | | |
7JRR|1|A|A|37||||7_555 | 7JRR|1|A|A|37||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|A|37||||7_555 | 7JRR|1|A|C|38||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|A|37||||7_555 | 7JRR|1|A|C|50||||7_555 | | ns55 | |
7JRR|1|A|A|37||||7_555 | 7JRR|1|A|G|36||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|A|37||||7_555 | 7JRR|1|A|U|49||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|A|3||||7_555 | 7JRR|1|A|A|3||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|A|3||||7_555 | 7JRR|1|A|C|33||||7_555 | | ns55 | |
7JRR|1|A|A|3||||7_555 | 7JRR|1|A|C|4||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|A|3||||7_555 | 7JRR|1|A|G|2||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|A|3||||7_555 | 7JRR|1|A|U|32||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|A|41 | 7JRR|1|A|A|41 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|A|41 | 7JRR|1|A|C|19||||7_555 | | ns55 | |
7JRR|1|A|A|41 | 7JRR|1|A|G|40 | | s53 | |
7JRR|1|A|A|41 | 7JRR|1|A|U|18||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|A|41 | 7JRR|1|A|U|42 | | s35 | |
7JRR|1|A|A|41||||7_555 | 7JRR|1|A|A|41||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|A|41||||7_555 | 7JRR|1|A|C|19 | | ns55 | |
7JRR|1|A|A|41||||7_555 | 7JRR|1|A|G|40||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|A|41||||7_555 | 7JRR|1|A|U|18 | cWW | | |
7JRR|1|A|A|41||||7_555 | 7JRR|1|A|U|42||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|A|8 | 7JRR|1|A|A|25 | | s33 | |
7JRR|1|A|A|8 | 7JRR|1|A|A|28 | | s55 | |
7JRR|1|A|A|8 | 7JRR|1|A|A|8 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|A|8 | 7JRR|1|A|G|24 | ntSS | | |
7JRR|1|A|A|8 | 7JRR|1|A|G|27 | tHS | | |
7JRR|1|A|A|8 | 7JRR|1|A|G|7 | | | |
7JRR|1|A|A|8 | 7JRR|1|A|G|9 | | ns55 | |
7JRR|1|A|A|8||||7_555 | 7JRR|1|A|A|25||||7_555 | | s33 | |
7JRR|1|A|A|8||||7_555 | 7JRR|1|A|A|28||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|A|8||||7_555 | 7JRR|1|A|A|8||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|A|8||||7_555 | 7JRR|1|A|G|24||||7_555 | ntSS | | |
7JRR|1|A|A|8||||7_555 | 7JRR|1|A|G|27||||7_555 | tHS | | |
7JRR|1|A|A|8||||7_555 | 7JRR|1|A|G|7||||7_555 | | | |
7JRR|1|A|A|8||||7_555 | 7JRR|1|A|G|9||||7_555 | | ns55 | |
7JRR|1|A|C|10 | 7JRR|1|A|C|10 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|10 | 7JRR|1|A|G|22 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|10 | 7JRR|1|A|G|9 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|10 | 7JRR|1|A|U|11 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|10||||7_555 | 7JRR|1|A|C|10||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|10||||7_555 | 7JRR|1|A|G|22||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|10||||7_555 | 7JRR|1|A|G|9||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|10||||7_555 | 7JRR|1|A|U|11||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|15 | 7JRR|1|A|A|14 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|15 | 7JRR|1|A|C|15 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|15 | 7JRR|1|A|C|16 | | ns35 | |
7JRR|1|A|C|15 | 7JRR|1|A|G|44||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|15||||7_555 | 7JRR|1|A|A|14||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|15||||7_555 | 7JRR|1|A|C|15||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|15||||7_555 | 7JRR|1|A|C|16||||7_555 | | ns35 | |
7JRR|1|A|C|15||||7_555 | 7JRR|1|A|G|44 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|16 | 7JRR|1|A|A|17 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|16 | 7JRR|1|A|C|15 | | ns53 | |
7JRR|1|A|C|16 | 7JRR|1|A|C|16 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|16 | 7JRR|1|A|G|43||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|16 | 7JRR|1|A|G|44||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|C|16||||7_555 | 7JRR|1|A|A|17||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|16||||7_555 | 7JRR|1|A|C|15||||7_555 | | ns53 | |
7JRR|1|A|C|16||||7_555 | 7JRR|1|A|C|16||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|16||||7_555 | 7JRR|1|A|G|43 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|16||||7_555 | 7JRR|1|A|G|44 | | s55 | |
7JRR|1|A|C|19 | 7JRR|1|A|A|41||||7_555 | | ns55 | |
7JRR|1|A|C|19 | 7JRR|1|A|C|19 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|19 | 7JRR|1|A|C|20 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|19 | 7JRR|1|A|G|40||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|19 | 7JRR|1|A|U|18 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|19||||7_555 | 7JRR|1|A|A|41 | | ns55 | |
7JRR|1|A|C|19||||7_555 | 7JRR|1|A|C|19||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|19||||7_555 | 7JRR|1|A|C|20||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|19||||7_555 | 7JRR|1|A|G|40 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|19||||7_555 | 7JRR|1|A|U|18||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|20 | 7JRR|1|A|A|21 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|20 | 7JRR|1|A|C|19 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|20 | 7JRR|1|A|C|20 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|20 | 7JRR|1|A|G|12 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|20 | 7JRR|1|A|G|40||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|C|20||||7_555 | 7JRR|1|A|A|21||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|20||||7_555 | 7JRR|1|A|C|19||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|20||||7_555 | 7JRR|1|A|C|20||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|20||||7_555 | 7JRR|1|A|G|12||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|20||||7_555 | 7JRR|1|A|G|40 | | s55 | |
7JRR|1|A|C|23 | 7JRR|1|A|C|23 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|23 | 7JRR|1|A|G|22 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|23 | 7JRR|1|A|G|24 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|23 | 7JRR|1|A|G|9 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|23||||7_555 | 7JRR|1|A|C|23||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|23||||7_555 | 7JRR|1|A|G|22||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|23||||7_555 | 7JRR|1|A|G|24||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|23||||7_555 | 7JRR|1|A|G|9||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|30 | 7JRR|1|A|A|29 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|30 | 7JRR|1|A|C|30 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|30 | 7JRR|1|A|G|31 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|30 | 7JRR|1|A|G|5 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|30 | 7JRR|1|A|G|6 | | s55 | |
7JRR|1|A|C|30||||7_555 | 7JRR|1|A|A|29||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|30||||7_555 | 7JRR|1|A|C|30||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|30||||7_555 | 7JRR|1|A|G|31||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|30||||7_555 | 7JRR|1|A|G|5||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|30||||7_555 | 7JRR|1|A|G|6||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|C|33 | 7JRR|1|A|A|3 | | ns55 | |
7JRR|1|A|C|33 | 7JRR|1|A|C|33 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|33 | 7JRR|1|A|C|34 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|33 | 7JRR|1|A|G|2 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|33 | 7JRR|1|A|U|32 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|33||||7_555 | 7JRR|1|A|A|3||||7_555 | | ns55 | |
7JRR|1|A|C|33||||7_555 | 7JRR|1|A|C|33||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|33||||7_555 | 7JRR|1|A|C|34||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|33||||7_555 | 7JRR|1|A|G|2||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|33||||7_555 | 7JRR|1|A|U|32||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|34 | 7JRR|1|A|C|33 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|34 | 7JRR|1|A|C|34 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|34 | 7JRR|1|A|C|35 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|34 | 7JRR|1|A|G|2 | | s55 | |
7JRR|1|A|C|34||||7_555 | 7JRR|1|A|C|33||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|34||||7_555 | 7JRR|1|A|C|34||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|34||||7_555 | 7JRR|1|A|C|35||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|34||||7_555 | 7JRR|1|A|G|2||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|C|35 | 7JRR|1|A|C|34 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|35 | 7JRR|1|A|C|35 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|35 | 7JRR|1|A|G|36 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|35 | 7JRR|1|A|G|51 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|35||||7_555 | 7JRR|1|A|C|34||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|35||||7_555 | 7JRR|1|A|C|35||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|35||||7_555 | 7JRR|1|A|G|36||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|35||||7_555 | 7JRR|1|A|G|51||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|38 | 7JRR|1|A|A|37 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|38 | 7JRR|1|A|C|38 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|38 | 7JRR|1|A|G|39 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|38 | 7JRR|1|A|G|48 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|38||||7_555 | 7JRR|1|A|A|37||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|38||||7_555 | 7JRR|1|A|C|38||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|38||||7_555 | 7JRR|1|A|G|39||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|38||||7_555 | 7JRR|1|A|G|48||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|4 | 7JRR|1|A|A|3 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|4 | 7JRR|1|A|C|4 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|4 | 7JRR|1|A|G|31 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|4 | 7JRR|1|A|G|5 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|47 | 7JRR|1|A|A|13||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|C|47 | 7JRR|1|A|C|47 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|47 | 7JRR|1|A|G|39 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|47 | 7JRR|1|A|G|48 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|47 | 7JRR|1|A|U|46 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|47||||7_555 | 7JRR|1|A|A|13 | | s55 | |
7JRR|1|A|C|47||||7_555 | 7JRR|1|A|C|47||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|47||||7_555 | 7JRR|1|A|G|39||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|47||||7_555 | 7JRR|1|A|G|48||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|47||||7_555 | 7JRR|1|A|U|46||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|4||||7_555 | 7JRR|1|A|A|3||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|4||||7_555 | 7JRR|1|A|C|4||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|4||||7_555 | 7JRR|1|A|G|31||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|4||||7_555 | 7JRR|1|A|G|5||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|50 | 7JRR|1|A|A|37 | | ns55 | |
7JRR|1|A|C|50 | 7JRR|1|A|C|50 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|50 | 7JRR|1|A|G|36 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|50 | 7JRR|1|A|G|51 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|50 | 7JRR|1|A|U|49 | | s53 | |
7JRR|1|A|C|50||||7_555 | 7JRR|1|A|A|37||||7_555 | | ns55 | |
7JRR|1|A|C|50||||7_555 | 7JRR|1|A|C|50||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|C|50||||7_555 | 7JRR|1|A|G|36||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|C|50||||7_555 | 7JRR|1|A|G|51||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|C|50||||7_555 | 7JRR|1|A|U|49||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|12 | 7JRR|1|A|A|21 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|12 | 7JRR|1|A|C|20 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|12 | 7JRR|1|A|G|12 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|12 | 7JRR|1|A|G|40||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|12 | 7JRR|1|A|U|11 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|12||||7_555 | 7JRR|1|A|A|21||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|12||||7_555 | 7JRR|1|A|C|20||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|12||||7_555 | 7JRR|1|A|G|12||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|12||||7_555 | 7JRR|1|A|G|40 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|12||||7_555 | 7JRR|1|A|U|11||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|2 | 7JRR|1|A|A|3 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|2 | 7JRR|1|A|C|33 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|2 | 7JRR|1|A|C|34 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|2 | 7JRR|1|A|G|2 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|22 | 7JRR|1|A|A|21 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|22 | 7JRR|1|A|C|10 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|22 | 7JRR|1|A|C|23 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|22 | 7JRR|1|A|G|22 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|22 | 7JRR|1|A|U|11 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|22||||7_555 | 7JRR|1|A|A|21||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|22||||7_555 | 7JRR|1|A|C|10||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|22||||7_555 | 7JRR|1|A|C|23||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|22||||7_555 | 7JRR|1|A|G|22||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|22||||7_555 | 7JRR|1|A|U|11||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|24 | 7JRR|1|A|A|8 | ntSS | | |
7JRR|1|A|G|24 | 7JRR|1|A|C|23 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|24 | 7JRR|1|A|G|24 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|24 | 7JRR|1|A|G|9 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|24||||7_555 | 7JRR|1|A|A|8||||7_555 | ntSS | | |
7JRR|1|A|G|24||||7_555 | 7JRR|1|A|C|23||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|24||||7_555 | 7JRR|1|A|G|24||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|24||||7_555 | 7JRR|1|A|G|9||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|27 | 7JRR|1|A|A|25 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|27 | 7JRR|1|A|A|8 | tSH | | |
7JRR|1|A|G|27 | 7JRR|1|A|G|27 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|27 | 7JRR|1|A|G|7 | | s33 | |
7JRR|1|A|G|27||||7_555 | 7JRR|1|A|A|25||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|27||||7_555 | 7JRR|1|A|A|8||||7_555 | tSH | | |
7JRR|1|A|G|27||||7_555 | 7JRR|1|A|G|27||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|27||||7_555 | 7JRR|1|A|G|7||||7_555 | | s33 | |
7JRR|1|A|G|2||||7_555 | 7JRR|1|A|A|3||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|2||||7_555 | 7JRR|1|A|C|33||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|2||||7_555 | 7JRR|1|A|C|34||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|2||||7_555 | 7JRR|1|A|G|2||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|31 | 7JRR|1|A|C|30 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|31 | 7JRR|1|A|C|4 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|31 | 7JRR|1|A|G|31 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|31 | 7JRR|1|A|G|5 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|31 | 7JRR|1|A|U|32 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|31||||7_555 | 7JRR|1|A|C|30||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|31||||7_555 | 7JRR|1|A|C|4||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|31||||7_555 | 7JRR|1|A|G|31||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|31||||7_555 | 7JRR|1|A|G|5||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|31||||7_555 | 7JRR|1|A|U|32||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|36 | 7JRR|1|A|A|37 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|36 | 7JRR|1|A|C|35 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|36 | 7JRR|1|A|C|50 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|36 | 7JRR|1|A|G|36 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|36 | 7JRR|1|A|G|51 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|36||||7_555 | 7JRR|1|A|A|37||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|36||||7_555 | 7JRR|1|A|C|35||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|36||||7_555 | 7JRR|1|A|C|50||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|36||||7_555 | 7JRR|1|A|G|36||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|36||||7_555 | 7JRR|1|A|G|51||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|39 | 7JRR|1|A|A|13||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|39 | 7JRR|1|A|C|38 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|39 | 7JRR|1|A|C|47 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|39 | 7JRR|1|A|G|39 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|39 | 7JRR|1|A|G|48 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|39||||7_555 | 7JRR|1|A|A|13 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|39||||7_555 | 7JRR|1|A|C|38||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|39||||7_555 | 7JRR|1|A|C|47||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|39||||7_555 | 7JRR|1|A|G|39||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|39||||7_555 | 7JRR|1|A|G|48||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|40 | 7JRR|1|A|A|41 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|40 | 7JRR|1|A|C|19||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|40 | 7JRR|1|A|C|20||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|40 | 7JRR|1|A|G|12||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|40 | 7JRR|1|A|G|40 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|40||||7_555 | 7JRR|1|A|A|41||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|40||||7_555 | 7JRR|1|A|C|19 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|40||||7_555 | 7JRR|1|A|C|20 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|40||||7_555 | 7JRR|1|A|G|12 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|40||||7_555 | 7JRR|1|A|G|40||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|43 | 7JRR|1|A|A|17||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|43 | 7JRR|1|A|C|16||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|43 | 7JRR|1|A|G|43 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|43 | 7JRR|1|A|G|44 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|43 | 7JRR|1|A|U|42 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|43||||7_555 | 7JRR|1|A|A|17 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|43||||7_555 | 7JRR|1|A|C|16 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|43||||7_555 | 7JRR|1|A|G|43||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|43||||7_555 | 7JRR|1|A|G|44||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|43||||7_555 | 7JRR|1|A|U|42||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|44 | 7JRR|1|A|C|15||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|44 | 7JRR|1|A|C|16||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|44 | 7JRR|1|A|G|43 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|44 | 7JRR|1|A|G|44 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|44 | 7JRR|1|A|U|45 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|44||||7_555 | 7JRR|1|A|C|15 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|44||||7_555 | 7JRR|1|A|C|16 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|44||||7_555 | 7JRR|1|A|G|43||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|44||||7_555 | 7JRR|1|A|G|44||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|44||||7_555 | 7JRR|1|A|U|45||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|48 | 7JRR|1|A|C|38 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|48 | 7JRR|1|A|C|47 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|48 | 7JRR|1|A|G|39 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|48 | 7JRR|1|A|G|48 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|48 | 7JRR|1|A|U|49 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|48||||7_555 | 7JRR|1|A|C|38||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|48||||7_555 | 7JRR|1|A|C|47||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|48||||7_555 | 7JRR|1|A|G|39||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|48||||7_555 | 7JRR|1|A|G|48||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|48||||7_555 | 7JRR|1|A|U|49||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|5 | 7JRR|1|A|C|30 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|5 | 7JRR|1|A|C|4 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|5 | 7JRR|1|A|G|31 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|5 | 7JRR|1|A|G|6 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|51 | 7JRR|1|A|C|35 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|51 | 7JRR|1|A|C|50 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|51 | 7JRR|1|A|G|36 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|51 | 7JRR|1|A|G|51 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|51||||7_555 | 7JRR|1|A|C|35||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|51||||7_555 | 7JRR|1|A|C|50||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|51||||7_555 | 7JRR|1|A|G|36||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|51||||7_555 | 7JRR|1|A|G|51||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|5||||7_555 | 7JRR|1|A|C|30||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|5||||7_555 | 7JRR|1|A|C|4||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|5||||7_555 | 7JRR|1|A|G|31||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|5||||7_555 | 7JRR|1|A|G|6||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|6 | 7JRR|1|A|A|28 | | ns33 | |
7JRR|1|A|G|6 | 7JRR|1|A|A|29 | tSH | | |
7JRR|1|A|G|6 | 7JRR|1|A|C|30 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|6 | 7JRR|1|A|G|5 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|6 | 7JRR|1|A|G|6 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|6 | 7JRR|1|A|G|7 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|6||||7_555 | 7JRR|1|A|A|28||||7_555 | | ns33 | |
7JRR|1|A|G|6||||7_555 | 7JRR|1|A|A|29||||7_555 | tSH | | |
7JRR|1|A|G|6||||7_555 | 7JRR|1|A|C|30||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|6||||7_555 | 7JRR|1|A|G|5||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|6||||7_555 | 7JRR|1|A|G|6||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|6||||7_555 | 7JRR|1|A|G|7||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|7 | 7JRR|1|A|A|28 | tSH | | n3BP |
7JRR|1|A|G|7 | 7JRR|1|A|G|27 | | s33 | |
7JRR|1|A|G|7 | 7JRR|1|A|G|6 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|7 | 7JRR|1|A|G|7 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|7||||7_555 | 7JRR|1|A|A|28||||7_555 | tSH | | n3BP |
7JRR|1|A|G|7||||7_555 | 7JRR|1|A|G|27||||7_555 | | s33 | |
7JRR|1|A|G|7||||7_555 | 7JRR|1|A|G|6||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|G|7||||7_555 | 7JRR|1|A|G|7||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|9 | 7JRR|1|A|A|28 | | | |
7JRR|1|A|G|9 | 7JRR|1|A|A|8 | | ns55 | |
7JRR|1|A|G|9 | 7JRR|1|A|C|10 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|9 | 7JRR|1|A|C|23 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|9 | 7JRR|1|A|G|24 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|9 | 7JRR|1|A|G|9 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|G|9||||7_555 | 7JRR|1|A|A|28||||7_555 | | | |
7JRR|1|A|G|9||||7_555 | 7JRR|1|A|A|8||||7_555 | | ns55 | |
7JRR|1|A|G|9||||7_555 | 7JRR|1|A|C|10||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|G|9||||7_555 | 7JRR|1|A|C|23||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|G|9||||7_555 | 7JRR|1|A|G|24||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|G|9||||7_555 | 7JRR|1|A|G|9||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|U|11 | 7JRR|1|A|A|21 | cWW | | |
7JRR|1|A|U|11 | 7JRR|1|A|C|10 | | s53 | |
7JRR|1|A|U|11 | 7JRR|1|A|G|12 | | s35 | |
7JRR|1|A|U|11 | 7JRR|1|A|G|22 | | s55 | |
7JRR|1|A|U|11 | 7JRR|1|A|U|11 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|U|11||||7_555 | 7JRR|1|A|A|21||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|U|11||||7_555 | 7JRR|1|A|C|10||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|U|11||||7_555 | 7JRR|1|A|G|12||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|U|11||||7_555 | 7JRR|1|A|G|22||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|U|11||||7_555 | 7JRR|1|A|U|11||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|U|18 | 7JRR|1|A|A|17 | | s53 | |
7JRR|1|A|U|18 | 7JRR|1|A|A|41||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|U|18 | 7JRR|1|A|C|19 | | s35 | |
7JRR|1|A|U|18 | 7JRR|1|A|U|18 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|U|18||||7_555 | 7JRR|1|A|A|17||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|U|18||||7_555 | 7JRR|1|A|A|41 | cWW | | |
7JRR|1|A|U|18||||7_555 | 7JRR|1|A|C|19||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|U|18||||7_555 | 7JRR|1|A|U|18||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|U|32 | 7JRR|1|A|A|3 | cWW | | |
7JRR|1|A|U|32 | 7JRR|1|A|C|33 | | s35 | |
7JRR|1|A|U|32 | 7JRR|1|A|G|31 | | s53 | |
7JRR|1|A|U|32 | 7JRR|1|A|U|32 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|U|32||||7_555 | 7JRR|1|A|A|3||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|U|32||||7_555 | 7JRR|1|A|C|33||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|U|32||||7_555 | 7JRR|1|A|G|31||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|U|32||||7_555 | 7JRR|1|A|U|32||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|U|42 | 7JRR|1|A|A|17||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|U|42 | 7JRR|1|A|A|41 | | s53 | |
7JRR|1|A|U|42 | 7JRR|1|A|G|43 | | s35 | |
7JRR|1|A|U|42 | 7JRR|1|A|U|42 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|U|42||||7_555 | 7JRR|1|A|A|17 | cWW | | |
7JRR|1|A|U|42||||7_555 | 7JRR|1|A|A|41||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|U|42||||7_555 | 7JRR|1|A|G|43||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|U|42||||7_555 | 7JRR|1|A|U|42||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|U|45 | 7JRR|1|A|A|14||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|U|45 | 7JRR|1|A|G|44 | | s53 | |
7JRR|1|A|U|45 | 7JRR|1|A|U|45 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|U|45 | 7JRR|1|A|U|46 | | s35 | |
7JRR|1|A|U|45||||7_555 | 7JRR|1|A|A|14 | cWW | | |
7JRR|1|A|U|45||||7_555 | 7JRR|1|A|G|44||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|U|45||||7_555 | 7JRR|1|A|U|45||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|U|45||||7_555 | 7JRR|1|A|U|46||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|U|46 | 7JRR|1|A|A|13||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|U|46 | 7JRR|1|A|A|14||||7_555 | | s55 | |
7JRR|1|A|U|46 | 7JRR|1|A|C|47 | | s35 | |
7JRR|1|A|U|46 | 7JRR|1|A|U|45 | | s53 | |
7JRR|1|A|U|46 | 7JRR|1|A|U|46 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|U|46||||7_555 | 7JRR|1|A|A|13 | cWW | | |
7JRR|1|A|U|46||||7_555 | 7JRR|1|A|A|14 | | s55 | |
7JRR|1|A|U|46||||7_555 | 7JRR|1|A|C|47||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|U|46||||7_555 | 7JRR|1|A|U|45||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|U|46||||7_555 | 7JRR|1|A|U|46||||7_555 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|U|49 | 7JRR|1|A|A|37 | cWW | | |
7JRR|1|A|U|49 | 7JRR|1|A|C|50 | | s35 | |
7JRR|1|A|U|49 | 7JRR|1|A|G|48 | | s53 | |
7JRR|1|A|U|49 | 7JRR|1|A|U|49 | | | 0BPh |
7JRR|1|A|U|49||||7_555 | 7JRR|1|A|A|37||||7_555 | cWW | | |
7JRR|1|A|U|49||||7_555 | 7JRR|1|A|C|50||||7_555 | | s35 | |
7JRR|1|A|U|49||||7_555 | 7JRR|1|A|G|48||||7_555 | | s53 | |
7JRR|1|A|U|49||||7_555 | 7JRR|1|A|U|49||||7_555 | | | 0BPh |
Base-Pairs | Count (46) | Relative Frequency |
---|
cWW | 40 | 0.870 |
tHS | 6 | 0.130 |
Base-Phosphate | Count (94) | Relative Frequency |
---|
0BPh | 94 | 1.000 |
Base-Stacking | Count (60) | Relative Frequency |
---|
s33 | 4 | 0.067 |
s53 | 28 | 0.467 |
s55 | 28 | 0.467 |